本文選題：Human + pegivirus-1(HPgV-1)��； 參考：《昆明理工大學(xué)》2017年碩士論文

【摘要】：Humanpegiviruses(HPgVs)屬于黃病毒科pegivirus屬,單股正鏈RNA病毒。目前,pegivirus屬中可以感染人類(lèi)的病毒有兩種,分別為HPgV-1和HPgV-2。其中,HPgV-1曾被稱(chēng)為庚型肝炎病毒(Hepatitis G Virus,HGV)或 GB Virus C(GBV-C)。HPgV-1 的感染不會(huì)引起人類(lèi)的肝損傷,但與HIV-1合并感染會(huì)延緩艾滋病患者的疾病進(jìn)程,并且不同基因型的HPgV-1對(duì)艾滋病的疾病影響存在明顯差異。最近,通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)發(fā)現(xiàn)了HPgV-2,該病毒主要在艾滋病合并丙肝(HCV)的患者中流行。云南省是我國(guó)艾滋病流行的高發(fā)區(qū)之一,云南地區(qū)HIV-1感染者中HPgVs的流行及其對(duì)艾滋病病程的影響如何,相關(guān)研究較少�；诖�,本論文就云南地區(qū)HIV-1感染者中HPgV-1和HPgV-2的分子流行病學(xué)進(jìn)行了研究。首先,我們針對(duì)云南省16個(gè)地州的1062例艾滋病患者,包括靜脈吸毒人群(injecting drug users,IDUs)460例,異性性傳播人群602例,進(jìn)行了 HPgV-1 RNA的檢測(cè)。結(jié)果發(fā)現(xiàn)HPgV-1 RNA 感染率為 23.4%(248/1062),其中 HPgV-1 在 IDUs 中的感染率(28.5%,131/460)顯著高于異性傳播人群(19.4%,117/602)(P0.05)。我們進(jìn)一步通過(guò)E2區(qū)同源關(guān)系進(jìn)化樹(shù)分析發(fā)現(xiàn),云南地區(qū)HIV-1感染者中HPgV-1 7型為主要基因型占55.7%(118/212),其次為 3 型 34.9%(74/212),4 型 4.7%(10/212),2 型 3.3%(7/212)和未知基因型 1.4%(3/212)。從傳播方式來(lái)看,7型主要流行于IDUs中(73.3%,85/116),而3型則主要流行于異性性接觸人群中(54.2%,52/96)。此外,我們對(duì)主要流行的3型和7型HPgV-1患者的臨床指標(biāo)進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)合并感染7型HPgV-1的艾滋病患者具有較低的HIV-1病毒載量(log = 3.87 ± 0.59 vs.4.01 ± 0.64,p = 0.038)和較高的CD4+細(xì)胞數(shù)量(cells/uL = 338±176 vs.285 ± 180,p = 0.025),表明7型HPgV-1具有較好地延緩HIV-1疾病進(jìn)程的作用。其次,基于HPgV-1 4型、6型和7型具有相同的地域分布特征,為了進(jìn)一步研究這三種基因型的進(jìn)化和起源關(guān)系,我們成功獲得了 13條4型和7型HPgV-1全長(zhǎng)序列。經(jīng)Split network、同源進(jìn)化樹(shù)、遺傳距離、核苷酸同源性以及PCOORD分析,結(jié)果表明4、6和7型具有相同的進(jìn)化和起源,屬于同一種基因型,因此,我們暫時(shí)將這三種基因型統(tǒng)一命名為HPgV-1基因4型。此外,通過(guò)PHI和Bootscanning重組分析,我們發(fā)現(xiàn)并確認(rèn)了兩例HPgV-1全長(zhǎng)重組株。最后,我們對(duì)547例HIV感染者,包括HIV-1單感染260例,HIV-1/HCV雙重感染192例和HIV-1/HCV/HPgV-1三重感染95例,進(jìn)行了 HPgV-2 RNA的檢測(cè)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),HPgV-2的感染率為0.91%(5/547),其中在以上三種人群中的感染率分別為0.00%(0/260)、0.52%(1/192)和4.21%(4/95)。另外,我們成功擴(kuò)增并獲得4條HPgV-2全長(zhǎng)基因組序列,并經(jīng)全長(zhǎng)序列比對(duì)分析發(fā)現(xiàn),HPgV-2核苷酸序列保守性(92.0%,0.058)分別高于 HPgV-1(87.5%,0.140)和 HCV(66.54%,0.423)。臨床數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn),HPgV-2 的感染對(duì)艾滋病患者的肝功指標(biāo)ALT和AST無(wú)影響。綜上所述,本論文闡明了云南地區(qū)艾滋病人群中HPgV-1的感染率和基因型分布特征,發(fā)現(xiàn)7型HPgV-1可能具有較好地延緩HIV-1疾病進(jìn)程的作用,提出了新的HPgV-1分型的標(biāo)準(zhǔn)。此外,我們還闡明了 HPgV-2主要在HIV-1/HCV感染人群中流行,描述了 HPgV-2全長(zhǎng)基因序列特征。該結(jié)果將為進(jìn)一步深入開(kāi)展HPgVs的多樣性對(duì)艾滋病病程的影響機(jī)制研究提供了重要科學(xué)依據(jù)。
[Abstract]:Human pegiviruses ( HPgVs ) belong to the genus pegivirus of the family Flaviviridae , single strand positive strand RNA virus . At present , the infection rate of HPgV - 1 in IDUs is 55.7 % ( 118 / 212 ) , the infection rate of HPgV - 1 in IDUs is 55.7 % ( 118 / 212 ) , and the infection rate of HPgV - 1 in IDUs is 34.9 % ( 74 / 212 ) , type 4 4.7 % ( 10 / 212 ) , type 2 3.3 % ( 7 / 212 ) and unknown genotype 1.4 % ( 3 / 212 ) . Type 3 was mainly prevalent in heterosexual contact population ( 54.2 % , 52 / 96 ) . The results showed that the infection rate of HPgV - 1 was 0.91 % ( 0 / 260 ) , 0.52 % ( 1 / 192 ) and 4.21 % ( 4 / 95 ) respectively . In conclusion , the infection rate and genotype distribution of HPgV - 1 in HIV - 1 / HCV infected population were discussed . The results showed that HPgV - 1 might have a better effect on HIV - 1 disease progression , and the characteristics of HPgV - 2 gene sequence were described .
【學(xué)位授予單位】：昆明理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類(lèi)號(hào)】：R512.91

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 ;High risk populations and HIV-1 infection in China[J];Cell Research;2005年Z1期

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本文編號(hào)：2117648