骨質(zhì)疏松癥患者腸道菌群多樣性分析
本文選題:骨質(zhì)疏松癥 + 腸道菌群; 參考:《中國骨質(zhì)疏松雜志》2017年06期
【摘要】:目的探討原發(fā)性骨質(zhì)疏松患者腸道菌群的多樣性變化。方法收集原發(fā)性骨質(zhì)疏松患者7例與健康對(duì)照組7例的糞便樣本,提取腸道菌群DNA,16S rRNA基因擴(kuò)增,Illumina平臺(tái)測(cè)序。對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行物種注釋、多樣性分析、物種差異分析。結(jié)果原發(fā)性骨質(zhì)疏松患者腸道菌群在綱、目、科、屬、種、分類操作單位水平的菌群種類要多于對(duì)照組,且兩組人群在綱、目、科、屬、種、分類操作單位水平的腸道菌群種類有一定的重疊性;Alpha多樣性指標(biāo)中的趙氏指數(shù)及艾森指數(shù)在兩組間差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),香農(nóng)指數(shù)及辛普森指數(shù)在兩組間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05);Beta多樣性中的層級(jí)聚類能夠?qū)山M樣本進(jìn)行鑒別區(qū)分;骨質(zhì)疏松組與對(duì)照組樣本在門、科、種分類水平的部分腸道菌群含量存在差異(P0.05),芽單胞菌門、綠彎菌門、酸桿菌門、芽單胞菌科、叢毛單胞菌科、厭氧繩菌科、毛螺菌、優(yōu)桿菌等腸道菌群在骨質(zhì)疏松患者中所占比例要大于正常對(duì)照組(P0.05)。結(jié)論 16S rRNA測(cè)序有助于分析原發(fā)性骨質(zhì)疏松患者的腸道菌群多樣性變化,為研究腸道菌群與骨質(zhì)代謝的關(guān)系提供理論依據(jù)。
[Abstract]:Objective to investigate the diversity of intestinal flora in patients with primary osteoporosis. Methods fecal samples from 7 patients with primary osteoporosis and 7 healthy controls were collected, and the 16s rRNA gene of intestinal flora was amplified by Illumina platform sequencing. The sequencing results were analyzed by species annotation, diversity analysis and species diversity analysis. Results the intestinal flora of primary osteoporosis patients was more than that of the control group at the level of class, order, family, genus, species, classification and operation unit, and the two groups were in class, order, family, genus and species. There was a certain overlap between the two groups in the number of intestinal flora and the Issen index. There was statistical difference between the two groups, but there was no difference between the two groups in Shannon index and Simpson index. The statistical significance was that the hierarchical clustering in Beta diversity could distinguish the two groups of samples. There were significant differences in the intestinal flora between the osteoporosis group and the control group at the levels of phylum, family, species classification, P0.05, phylum, acidobacterium, Cytomonas, Cytomonidae, Anaerobicaceae, Helicobacter trichomes. The proportion of enteric bacteria such as eubacillus in osteoporosis patients was higher than that in normal control group (P 0.05). Conclusion 16s rRNA sequencing is helpful to analyze the diversity of intestinal flora in patients with primary osteoporosis and to provide a theoretical basis for the study of the relationship between intestinal flora and bone metabolism.
【作者單位】: 西安交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬紅會(huì)醫(yī)院;電信科學(xué)技術(shù)第十研究所;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(81601898) 西安市紅會(huì)醫(yī)院科研基金資助課題(YJ2016013) 中國博士后科學(xué)基金資助項(xiàng)目(2017M613176,2017M613177)
【分類號(hào)】:R580
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,本文編號(hào):1993245
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