本文選題：高原肺水腫 + 家系�。� 參考：《遺傳》2017年02期

【摘要】：高原肺水腫(high-altitude pulmonary edema,HAPE)是一種高原特發(fā)性疾病,其發(fā)病與遺傳因素有一定關聯(lián)。本研究對一個HAPE相關的家系展開遺傳學調(diào)查,然后利用外顯子組測序篩查了包括先證者在內(nèi)的6名HAPE病史成員以及先證者的母親共7個成員的遺傳變異,結果發(fā)現(xiàn)18個HAPE相關的潛在遺傳變異(9個SNVs和9個Indels)。利用SIFT,Poly Phen-2和PROVEAN等3種軟件對這些遺傳變異進行蛋白功能危害性分析,結果發(fā)現(xiàn)定位于CFHR4基因的SNV(p.L85F)以及定位于OXER1基因的SNV(p.R176C)具有高危害性,且OXER1的功能與HAPE低氧誘導通路存在高度關聯(lián),它們可作為該家系中HAPE相關的候選病理性變異。此外,還有部分SNVs(NMB p.S150P、APOB p.I4194T和EIF4ENIF1 p.Q763P)以及Indels(KCNJ12 p.EE333-334E、ANKRD31p.LMN251-253LN和OR2A14 p.HFFC175-178HFC),其遺傳變異同樣具有一定危害,可作為潛在的HAPE相關遺傳變異。本研究首次通過外顯子組測序直接篩選與一中國HAPE家系相關的遺傳變異,為后續(xù)揭示HAPE發(fā)病機制提供了新線索。
[Abstract]:High altitude pulmonary (HAPE) is a high altitude idiopathic disease, which is associated with genetic factors. In this study, genetic investigation was carried out on a family associated with HAPE, and the genetic variation of 6 HAPE history members, including the proband, and 7 members of the mother of the proband were screened using exon group sequencing. The results showed that there were 18 potential genetic variations associated with HAPE (9 SNVs and 9 Indels). Using sift Phen-2 and PROVEAN to analyze the protein function hazard of these genetic variations, it was found that SNVP. L85F) and SNVp.R176C, which were located in CFHR4 gene and OXER1 gene, were highly harmful. The function of OXER1 is highly correlated with HAPE hypoxia induced pathway, and they can be used as candidate pathological variation of HAPE in this family. In addition, some SNVs(NMB p.S150PnAPOB p.I4194T and EIF4ENIF1 p.Q763P), Indels(KCNJ12 p.EE333-334EKRD31p. LMN251-253LN and OR2A14 p.HFFC175-178HFCN also have some harm, which can be used as potential HAPE related genetic variation. In this study, the genetic variation associated with a Chinese HAPE pedigree was screened directly by exon sequencing for the first time, which provided a new clue for further revealing the pathogenesis of HAPE.
【作者單位】： 青海大學醫(yī)學院高原醫(yī)學研究中心;青海省高原醫(yī)學應用基礎重點實驗室;青海-猶他高原醫(yī)學聯(lián)合重點實驗室;青海省人民醫(yī)院;青海大學醫(yī)學院;
【基金】：國家自然科學基金項目(編號:31160232) 青海省科技廳應用基礎基金項目(編號:2016-ZJ-706)資助~~
【分類號】：R594.3

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本文編號：1963659