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系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者中miR-410表達及其靶基因生物信息學分析

發(fā)布時間:2018-06-01 04:48

  本文選題:miR- + SLE; 參考:《中國免疫學雜志》2017年06期


【摘要】:目的:檢測miR-410在系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者(SLE)中的表達水平,運用生物信息學方法研究miR-410及其靶基因在SLE發(fā)生發(fā)展過程中的作用。方法:定量檢測miR-410在SLE患者外周血單個核細胞中的表達水平,并通過miR-410序列分析,靶基因預測和Genecards數據庫分析,進一步對其靶基因進行GO富集和KEGG Pathway分析。結果:miR-410在SLE患者中表達顯著降低,其核苷酸序列在多物種間呈高度保守性。受miR-410調控且與SLE疾病相關的潛在靶基因包括FASLG、CSF2、IFNAR2、MAPK1、PLCG2、IL4等。GO分析發(fā)現miR-410的靶基因參與細胞生長增殖、程序性死亡、細胞分化、免疫系統(tǒng)發(fā)育等多個生物過程。KEGG Pathway分析發(fā)現miR-410的靶基因顯著富集在腫瘤途徑信號通路、細胞因子-細胞因子受體相互作用信號通路、膠質瘤信號通路、黑色素瘤信號通路、TGF-β和JAK-STAT信號通路等。結論:miR-410可能通過直接靶向作用其調控靶分子,影響SLE患者體內多條信號通路的網絡調控,從而參與SLE疾病的發(fā)生和發(fā)展。
[Abstract]:Aim: to detect the expression of miR-410 in patients with systemic lupus erythematosus (SLE) and to study the role of miR-410 and its target genes in the pathogenesis and development of SLE by bioinformatics. Methods: the expression of miR-410 in peripheral blood mononuclear cells (PBMC) of patients with SLE was quantitatively detected, and its target genes were further enriched and KEGG Pathway analyzed by miR-410 sequence analysis, target gene prediction and Genecards database analysis. Results the expression of 10 miR-410 was significantly decreased in SLE patients, and the nucleotide sequence was highly conserved in multiple species. The potential target genes regulated by miR-410 and associated with SLE disease include FASLGG, CSF2, IFNAR2, MAPK1, PLCG2NIL4, and so on. Go analysis showed that the target genes of miR-410 were involved in cell growth and proliferation, programmed death and cell differentiation. KEGG Pathway analysis showed that the target genes of miR-410 were significantly enriched in tumor signaling pathway, cytokine receptor interaction signaling pathway and glioma signal pathway. Melanoma signaling pathway TGF- 尾 and JAK-STAT signaling pathway. Conclusion it is possible that the direct targeting of the target molecules of SLE may influence the network regulation of multiple signaling pathways in patients with SLE, and thus participate in the occurrence and development of SLE disease.
【作者單位】: 南華大學附屬第一醫(yī)院風濕免疫科;
【基金】:國家自然科學青年基金(No.81301774) 湖南省自然科學基金(No.2016JJ2108)
【分類號】:R593.241

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