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系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者中miR-410表達(dá)及其靶基因生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2018-06-01 04:48

  本文選題:miR- + SLE。 參考:《中國免疫學(xué)雜志》2017年06期


【摘要】:目的:檢測miR-410在系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者(SLE)中的表達(dá)水平,運(yùn)用生物信息學(xué)方法研究miR-410及其靶基因在SLE發(fā)生發(fā)展過程中的作用。方法:定量檢測miR-410在SLE患者外周血單個核細(xì)胞中的表達(dá)水平,并通過miR-410序列分析,靶基因預(yù)測和Genecards數(shù)據(jù)庫分析,進(jìn)一步對其靶基因進(jìn)行GO富集和KEGG Pathway分析。結(jié)果:miR-410在SLE患者中表達(dá)顯著降低,其核苷酸序列在多物種間呈高度保守性。受miR-410調(diào)控且與SLE疾病相關(guān)的潛在靶基因包括FASLG、CSF2、IFNAR2、MAPK1、PLCG2、IL4等。GO分析發(fā)現(xiàn)miR-410的靶基因參與細(xì)胞生長增殖、程序性死亡、細(xì)胞分化、免疫系統(tǒng)發(fā)育等多個生物過程。KEGG Pathway分析發(fā)現(xiàn)miR-410的靶基因顯著富集在腫瘤途徑信號通路、細(xì)胞因子-細(xì)胞因子受體相互作用信號通路、膠質(zhì)瘤信號通路、黑色素瘤信號通路、TGF-β和JAK-STAT信號通路等。結(jié)論:miR-410可能通過直接靶向作用其調(diào)控靶分子,影響SLE患者體內(nèi)多條信號通路的網(wǎng)絡(luò)調(diào)控,從而參與SLE疾病的發(fā)生和發(fā)展。
[Abstract]:Aim: to detect the expression of miR-410 in patients with systemic lupus erythematosus (SLE) and to study the role of miR-410 and its target genes in the pathogenesis and development of SLE by bioinformatics. Methods: the expression of miR-410 in peripheral blood mononuclear cells (PBMC) of patients with SLE was quantitatively detected, and its target genes were further enriched and KEGG Pathway analyzed by miR-410 sequence analysis, target gene prediction and Genecards database analysis. Results the expression of 10 miR-410 was significantly decreased in SLE patients, and the nucleotide sequence was highly conserved in multiple species. The potential target genes regulated by miR-410 and associated with SLE disease include FASLGG, CSF2, IFNAR2, MAPK1, PLCG2NIL4, and so on. Go analysis showed that the target genes of miR-410 were involved in cell growth and proliferation, programmed death and cell differentiation. KEGG Pathway analysis showed that the target genes of miR-410 were significantly enriched in tumor signaling pathway, cytokine receptor interaction signaling pathway and glioma signal pathway. Melanoma signaling pathway TGF- 尾 and JAK-STAT signaling pathway. Conclusion it is possible that the direct targeting of the target molecules of SLE may influence the network regulation of multiple signaling pathways in patients with SLE, and thus participate in the occurrence and development of SLE disease.
【作者單位】: 南華大學(xué)附屬第一醫(yī)院風(fēng)濕免疫科;
【基金】:國家自然科學(xué)青年基金(No.81301774) 湖南省自然科學(xué)基金(No.2016JJ2108)
【分類號】:R593.241

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本文編號:1962889

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