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BIV及MVV Vif降解宿主蛋白APOBEC3Z2-Z3的機(jī)制研究以及嵌合型stHIV-1的構(gòu)建

發(fā)布時(shí)間:2018-03-09 09:41

  本文選題:BIV 切入點(diǎn):Vif 出處:《吉林大學(xué)》2015年博士論文 論文類型:學(xué)位論文


【摘要】:引發(fā)宿主重大疾病的許多病原體,包括HIV病毒在內(nèi),在長(zhǎng)期進(jìn)化過(guò)程中衍生出一系列拮抗宿主細(xì)胞內(nèi)抗病毒因子的輔助感染蛋白,從而完成病毒在宿主體內(nèi)的高效復(fù)制。另一方面,在HIV-1感染人類細(xì)胞過(guò)程中,宿主自身產(chǎn)生一類通過(guò)不同途徑發(fā)揮抗病毒功能的蛋白,這類蛋白稱為宿主限制因子。病毒輔助蛋白與宿主限制因子之間的相互作用機(jī)制研究是獲得性免疫缺陷綜合癥研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)問(wèn)題。現(xiàn)階段已經(jīng)被闡明的病毒輔助蛋白與宿主限制因子的作用機(jī)制包括:1.HIV-1的病毒感染因子Vif和宿主限制因子APOBEC3G;2.HIV-1的衣殼蛋白(capsid)與宿主限制因子TRIM5α;3.HIV-1的功能蛋白Vpu與宿主限制因子Tetherin(BST-2);4.HIV-2附屬蛋白Vpx與宿主限制因子SAMHD1。病毒輔助蛋白和宿主限制因子之間的相互作用存在種屬特異性,主要表現(xiàn)為病毒輔助蛋白的跨種屬活性以及宿主限制因子的廣譜抗病毒活性。一方面,某些不能感染人類的病原體在長(zhǎng)期進(jìn)化過(guò)程中,產(chǎn)生能有效拮抗人類宿主限制因子的輔助蛋白,使病毒感染的種屬范圍擴(kuò)大,從而產(chǎn)生了近些年來(lái)大量爆發(fā)的人畜共患病。因此對(duì)于其他種屬的宿主限制因子與病毒蛋白的相互作用機(jī)制的研究可為防治人畜共患病研究領(lǐng)域提供理論依據(jù)。另一方面,病毒感染宿主范圍的限制,導(dǎo)致藥物開(kāi)發(fā)中動(dòng)物模型選擇的局限性。HIV-1在非人類細(xì)胞中的感染力會(huì)被其他種屬細(xì)胞內(nèi)的同源宿主限制因子大大削弱,致使HIV-1病毒不能感染其他種屬,比如非人靈長(zhǎng)類動(dòng)物。從而衍生出針對(duì)HIV-1病毒改造,使其能夠在猴體內(nèi)長(zhǎng)期復(fù)制的研究領(lǐng)域。在本論文中,我們以宿主限制因子與病毒輔助蛋白的相互作用機(jī)制為出發(fā)點(diǎn),圍繞上述兩方面內(nèi)容進(jìn)行討論。 本論文的第一部分是圍繞宿主限制因子APOBEC3蛋白在其他種屬中與其對(duì)應(yīng)的慢病毒Vif蛋白的作用機(jī)制展開(kāi)研究。 慢病毒(lentiviruses)是逆轉(zhuǎn)錄病毒的一個(gè)亞家族,由于這種病毒在宿主體內(nèi)會(huì)產(chǎn)生一個(gè)長(zhǎng)的疾病潛伏期而得名。其中研究最多的是人類免疫缺陷病毒HumanImmunodeficiency Virus, HIV)和猴免疫缺陷病毒(simian immunodeficiency virus,SIV),另外還有貓免疫缺陷病毒(Feline Immunodefiency Virus, FIV)以及一些感染偶蹄類動(dòng)物的病毒包括牛免疫缺陷病毒(Bovineimmunodeficiencyvirus,BIV),綿羊梅迪-維斯那病毒(Maedi-visnavirus,MVV)以及馬傳染性貧血病毒(equineinfectious anemiavirus,EIAV)等。對(duì)于除EIAV之外的慢病毒,Vif蛋白都是與病毒感染、復(fù)制相關(guān)的重要輔助因子。其中HIV, SIV, FIV的Vif蛋白對(duì)相應(yīng)宿主限制因子A3s蛋白的降解作用機(jī)制已經(jīng)被廣泛的研究,Vif蛋白通過(guò)招募ElonginB,ElonginC,Cullin5形成E3泛素連接酶復(fù)合物降解相應(yīng)宿主的APOBEC3蛋白。但是BIV以及MVV的Vif對(duì)相應(yīng)的宿主A3s蛋白的降解作用機(jī)制尚未被揭示。本論文對(duì)BIV以及MVV Vif介導(dǎo)的相應(yīng)宿主APOBEC3蛋白的降解機(jī)制進(jìn)行了研究。研究發(fā)現(xiàn)BIV以及MVV Vif介導(dǎo)的降解機(jī)制與已被闡述的HIV-1, SIV以及FIV Vif介導(dǎo)的降解機(jī)制既存在共同性又存在一定的不同之處:BIV以及MVV Vif同樣是通過(guò)蛋白酶體途徑降解宿主A3蛋白;BIV以及MVVVif中都存在對(duì)降解作用至關(guān)重要的與ElonginC結(jié)合的BC-Box。但它們所招募的E3連接酶復(fù)合物成員不完全相同:BIV Vif降解復(fù)合物成員包括ElonginB, ElonginC以及Cullin2,MVV Vif降解復(fù)合物成員包括ElonginB, ElonginC以及Cullin5,BIV以及MVV Vif介導(dǎo)的降解均不依賴CBF-β;與其他慢病毒的Vif蛋白在形成E3復(fù)合物中對(duì)Cullin蛋白的選擇性不同, BIV Vif是唯一一個(gè)招募Cullin2蛋白的。鋅離子螯合劑TPEN能夠阻斷BIV Vif對(duì)APOBEC3蛋白的降解,說(shuō)明Zn2+對(duì)BIV Vif的活性有重要意義。通過(guò)序列比對(duì)以及點(diǎn)突變的方法我們證實(shí)了BIV Vif上與btCullin2之間相互作用的關(guān)鍵位點(diǎn)為C-x1-C-x1-H-x19-C基序。鋅親和層析實(shí)驗(yàn)表明BIV Vif與Zn2+間的相互結(jié)合依賴于C-x1-C-x1-H-x19-C基序,它是與以往報(bào)道的Zn指結(jié)構(gòu)都不盡相同的一個(gè)全新的Zn2+結(jié)合環(huán)。MVVVif雖與Cullin5相結(jié)合,但在MVVVif上未發(fā)現(xiàn)Cul5-box或HCCH基序,并且MVV Vif對(duì)宿主APOBEC3蛋白的降解幾乎不受TPEN的影響,說(shuō)明MVV Vif介導(dǎo)的降解不依賴Zn2+的參與,這些都暗示MVV Vif與oaCul5之間的相互作用方式不同于HIV-1或SIV Vif。 本論文的第二部分內(nèi)容是利用宿主限制因子的種屬特異性,對(duì)病毒進(jìn)行改造,試圖突破種屬間傳播的限制瓶頸。1981年艾滋病發(fā)現(xiàn)至今短短30余年時(shí)間里,全球已有超過(guò)3400萬(wàn)人感染艾滋病。然而沒(méi)有合適的動(dòng)物模型是阻礙艾滋病藥物與疫苗開(kāi)發(fā)的關(guān)鍵因素之一,F(xiàn)階段用于研究艾滋病的動(dòng)物模型有兩種:一種是HIV-1感染黑猩猩和SCID/hu鼠,但是它們的有效性和疾病特征嚴(yán)重限制了其應(yīng)用。另一種是用猴免疫缺陷病毒SIV或經(jīng)改造的SHIV感染恒河猴,盡管這種動(dòng)物模型對(duì)于研究發(fā)病機(jī)理很有效,但由于SIV與HIV之間的差異,致使這種感染不能完全模擬HIV對(duì)人類的感染。因此該動(dòng)物模型對(duì)于艾滋病治療藥物以及疫苗的評(píng)價(jià)存在一定的缺陷。那么,構(gòu)建更加完善的用于評(píng)價(jià)艾滋病疫苗或藥物的動(dòng)物模型將有助于推動(dòng)全球艾滋病的治療。 猴分為兩大種類:一種是新世界猴,如松鼠猴和通常的絨猴;另外一種是舊世界猴,如非洲綠猴(African green monkey, agm)和恒河猴(Rhesus Macacus, mac)。HIV在感染新世界猴的侵入階段就被阻斷,原因是病毒包膜蛋白gp120與細(xì)胞表面受體蛋白CD4和CCR5之間不能有效的相互作用。雖然HIV能有效的侵入舊世界猴,但在侵入后階段受到宿主細(xì)胞限制因子的制約,導(dǎo)致病毒不能有效復(fù)制。三種宿主限制因子解釋了侵入后阻斷:三維基體蛋白5α(TRIM5α)和脂蛋白APOBEC3家族以及膜蛋白BST2。在本論文中,我們通過(guò)對(duì)HIV-1的NL43病毒株骨架進(jìn)行基因替換來(lái)解除HIV-1感染舊世界猴的限制因素。人源的TRIM5α,APOBEC3以及BST-2能夠分別被HIV-1的CA, Vif以及Vpu所拮抗,但恒河猴的同源宿主限制因子不能被HIV-1的CA,Vif以及Vpu拮抗,而是能夠被SIVmac239的CA, Vif以及HIV-1稀有亞型DH12的Vpu所拮抗。我們將HIV-1的CA,,Vif以及Vpu的穿膜區(qū)基因分別替換成SIVmac239的CA,Vif以及HIV-1DH12的Vpu穿膜區(qū),獲得了stHIV-1嵌合病毒質(zhì)粒。我們?cè)?93T細(xì)胞中檢測(cè)到嵌合病毒stHIV-1的結(jié)構(gòu)蛋白的正常表達(dá),并且能夠成功包裝出病毒顆粒。在此基礎(chǔ)上,我們通過(guò)MAGI-CCR5細(xì)胞檢測(cè)了包裝出的病毒顆粒對(duì)人類細(xì)胞的感染能力,發(fā)現(xiàn)嵌合病毒能夠成功感染人類MAGI細(xì)胞。替換部分的蛋白功能的驗(yàn)證結(jié)果表明:stHIV-1的Vif能夠有效降解恒河猴的A3G蛋白,并且替換的Vpu能夠拮抗Rh BST-2對(duì)病毒出毒的抑制。在檢測(cè)stHIV-1的CA功能實(shí)驗(yàn)中,我們沒(méi)能成功構(gòu)建穩(wěn)定表達(dá)恒河猴TRIM5α的人類T淋巴細(xì)胞系CEM×174,因此對(duì)于CA的功能驗(yàn)證需要在今后的stHIV-1感染恒河猴PBMC實(shí)驗(yàn)中進(jìn)行間接驗(yàn)證。此外,我們還成功的檢測(cè)到stHIV-1在CEM×174細(xì)胞系中的長(zhǎng)期復(fù)制。在下一步計(jì)劃中,我們需要完成在Rh PBMC細(xì)胞中檢測(cè)stHIV-1的長(zhǎng)期復(fù)制曲線,在此基礎(chǔ)上對(duì)恒河猴進(jìn)行病毒功毒以及病毒傳代實(shí)驗(yàn),我們希望改造的病毒能夠在恒河猴體內(nèi)穩(wěn)定復(fù)制并且最終能導(dǎo)致恒河猴的致病。 本論文的研究補(bǔ)充了BIV Vif-btA3Z2-Z3以及MVV Vif-oaA3Z2-Z3蛋白之間相互拮抗作用的機(jī)制,為病毒在牛羊中的疾病進(jìn)程以及潛在的種屬間感染提供可參考的意義。另外stHIV-1的構(gòu)建有望成為更加理想的AIDS動(dòng)物模型,推動(dòng)AIDS治療藥物及疫苗的發(fā)展。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R512.91

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):1587985

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