本文關(guān)鍵詞： 類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎 冠心病 單核苷酸多態(tài)性 高分辨率熔解曲線　出處：《蘭州大學(xué)》2015年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：目的自主建立RTKN2.LDLR.APOB.APOC1、ARL15、HLA-DMA、NFKB2、 CRP、ACE、NOS3、ENPP1和IQSEC1基因15個單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點的臨床常規(guī)化分子診斷方法,并探討15個SNP位點與蘭州地區(qū)漢族人群類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(RA)和冠心病(CHD)易感及血清學(xué)指標(biāo)的相關(guān)性。方法基于高分辨熔解技術(shù)(HRM)建立類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎7個關(guān)聯(lián)基因RTKN2. LDLR、APOB、APOC1、ARL15、HLA-DMA 和 NFKB2的8個單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)位點(rs3125734 CT.rs688 CT.rs693 CT. rs4420638 AG.rs255758 AC.rs1063478 CT、rs397514331 -/A 和rs397514332CT)和冠心病5個關(guān)聯(lián)基因CRP、ACE、NOS3、ENPP1 和 IQSEC1 的7個SNP位點(rs1205 CT.rs4305 AG.rs4353 GA.rs7830 AC.rs12528076 CT. rs939899 GA 和 rs1108640 GC)的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-高分辨熔解曲線(PCR-HR M)檢測方法,應(yīng)用于588例RA患者與200例健康對照和260例CHD患者與238例健康對照的臨床標(biāo)本的檢測。以測序金標(biāo)準(zhǔn)驗證其檢測正確性和臨床適用性。通過病例對照分析,篩選蘭州地區(qū)漢族人群RA和CHD的易感SNP位點,并進行其血清學(xué)指標(biāo)RF和抗CCP抗體的相關(guān)性分析。結(jié)果全部標(biāo)本PCR-HRM擴增后均能基因分型,經(jīng)直接測序金標(biāo)準(zhǔn)驗證,其基因分型正確率達100%。(1)RA病例對照分析顯示：① rs3125734 CT和rs688CT位點基因型和等位基因頻率在RA組與對照組間的差異有統(tǒng)計學(xué)意義(x2=6.144,P=0.046；x2=5.793,P=0.016；x2=8.582,P=0.014:x2=5.409,P=0.020)；rs255758 AC和rs1063478 CT基因型頻率在兩組間的差異有統(tǒng)計學(xué)意義(x2=6.877,P=o.032；x2=6.893,P=0.032).②性別分層后僅rs3125734 CT位點基因型和等位基因頻率在男性組間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=6.527,P=0.011；x2=5.899,P=0.015)；rs688 CT和rs255758 AC基因型和等位基因頻率女性組間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(x2=8.916,P=0.012；x2=7.180,P=0.007；x2=10.788,P=0:006； x2=4.235,P=0.039)。③按血清學(xué)分層后rs3125734 CT等位基因頻率在CCP陽性RA組與健康對照組間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=4.708,P=0.030),其基因型頻率和等位基因頻率在RF陽性RA組與對照組間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=7.246,P=0.027；x2=6.370,P=0.012)；rs4420638 AG位點基因型頻率在RF陰性RA組與對照組間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=4.105,P=0.043)。④風(fēng)險回歸對各位點突變基因型擬合二元logistic回歸分析發(fā)現(xiàn)在RA組與對照組rs3125734 CT突變雜合基因型CT可增加RA的發(fā)病風(fēng)險(χ2=4.011,P=0.045,OR=1.613),rs688CT突變純合基因型TT可降低RA的發(fā)病風(fēng)險(x2=6.853,P=0.009,OR=0.273), rs255758 AC突變雜合基因型AC可降低RA的發(fā)病風(fēng)險(χ2=6.641,P=0.010,OR=0.640):在男性RA組和男性對照組rs1063478 CT突變雜合基因型CT可增加RA的發(fā)病風(fēng)險(x2=6.029,P=0.014,OR=3.204)；在女性RA組和女性對照組rs688 CT和rs255758 AC突變純合基因型TT/AC可降低RA的發(fā)病風(fēng)險(x2=5.704,P=0.017,OR=0.244；x2=9.410,P=0.002,OR=0.531)；在RF陽性RA組與對照組rs3125734 CT突變雜合基因型CT可增加RA的發(fā)病風(fēng)險(x2=4.110,P=0.043,OR=1.853)；在RF陰性RA組與對照組rs4420638 AG突變雜合基因型AG可增加RA的發(fā)病風(fēng)險(χ2=4.046,P=0.044,OR=1.799)。⑤RA病例組血脂水平分析顯示：rs693 CT和rs4420638 AG位點與HDL-C水平之間存在統(tǒng)計學(xué)差異(x2=4.762,P=0.029,OR=3.385；x2-8.226,P=0.004,OR=5.416),通過對rs693 CT和rs4420638 AG位點的突變基因型和野生型的患者HDL-C水平進行均值方差分析,結(jié)果顯示兩組間均存在統(tǒng)計學(xué)差異(F=7.312,P=0.008:F=12.482,P=0.001).(2)CHD病例對照分析顯示：①rs4353 GA位點等位基因頻率在CHD組與對照組間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(x2=3.998,P=0.045,OR=1.297)。②rs7830 AC位點基因型頻率在兩組間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(x2=6.369,P=0.041,OR=0.790)。③rs12528076 CT位點等位基因頻率在兩組間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(x2=3.918,P=0.047,OR=1.335)。④CHD病例組血脂水平分析顯示：rs1205 CT位點與HDL-C和LDL-C水平有相關(guān)性(x2=7.371,P=0.007,OR=7.920；x2=5.892,P=0.015,OR=0.320),通過對rs1205CT位點的突變基因型CT/TT和野生型CC的患者HDL-C和LDL-C水平進行均值方差分析,結(jié)果顯示僅與HDL-C水平存在統(tǒng)計學(xué)差異(F=14.067,P=0.001)。結(jié)論自主建立的PCR-HRM分子診斷方法能夠?qū)?5個SNP位點正確基因分型,達到臨床常規(guī)化分子診斷目標(biāo)。RTKN2、LDLR、APOC1、ARL15和HLA-DMA與蘭州地區(qū)漢族人群RA易感相關(guān),其中rs693 CT和rs4420638 AG聯(lián)合HDL-C血清水平可預(yù)警RA發(fā)生；ACE、NOS3和ENPP1與蘭州地區(qū)漢族人群CHD易感相關(guān),其中rs1205 CT聯(lián)合HDL-C血清水平可預(yù)警CHD發(fā)生。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：蘭州大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R593.22;R541.4;R440

【參考文獻】

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1 齊曉明;張蕊;李倩男;盧明華;尤崇革;;高分辨率熔解技術(shù)檢測冠心病患者TNF-α及其受體基因多態(tài)性[J];臨床檢驗雜志;2014年06期

2 韓清泉;;內(nèi)皮型一氧化氮合酶基因多態(tài)性與原發(fā)性高血壓關(guān)系的研究進展[J];搏擊(武術(shù)科學(xué));2012年10期

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4 張陽東;董矜;李立青;田亞平;楚瑞雪;;冠心病患者血管緊張素Ⅰ轉(zhuǎn)換酶基因多態(tài)性分析[J];西南國防醫(yī)藥;2011年03期

5 鄧建新;;114例老年冠心病患者抑郁狀況的調(diào)查[J];齊齊哈爾醫(yī)學(xué)院學(xué)報;2011年05期

6 羅莉;黃凌寧;許昌聲;吳可貴;;漿細(xì)胞膜糖蛋白1基因多態(tài)性與2型糖尿病合并冠狀動脈粥樣硬化性心臟病的關(guān)系[J];中華高血壓雜志;2011年01期

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8 張陽東;田亞平;董矜;李立青;鄧心新;;內(nèi)皮固有型一氧化氮合酶基因單核苷酸多態(tài)性與冠心病的相關(guān)性研究[J];標(biāo)記免疫分析與臨床;2008年06期

9 季祥武;張愛元;管立學(xué);王敬先;黃靜;;冠心病與血管緊張素轉(zhuǎn)換酶和內(nèi)皮型一氧化氮合酶基因多態(tài)性及交互作用的臨床研究[J];中華心血管病雜志;2007年11期

10 ;SHEsis,a powerful software platform for analyses of linkage disequilibrium,haplotype construction,and genetic association at polymorphism loci[J];Cell Research;2005年02期

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本文編號：1498422