本研究探討不同程度無精子癥患者睪丸組織的轉(zhuǎn)錄組差異,了解差異表達(dá)基因(DEG)在功能、分類和代謝通路的不同,揭示無精子癥患者精子發(fā)生分子機制,為促進(jìn)男性不育研究的發(fā)展提供理論基礎(chǔ).選取1份非梗阻性無精子癥和4份梗阻性無精子癥患者睪丸組織樣品(從無精子到有精子),進(jìn)行RNA提取和文庫構(gòu)建,利用Illumina HiSeqTM2500高通量測序,構(gòu)建無精子癥患者睪丸組織轉(zhuǎn)錄組文庫,并用生物信息學(xué)方法進(jìn)行分析.結(jié)果發(fā)現(xiàn),樣品比對基因組數(shù)據(jù)庫的平均比對率為94.38%,共檢測2 242個屬于預(yù)測新的蛋白質(zhì)編碼基因的轉(zhuǎn)錄本.得到差異表達(dá)基因統(tǒng)計結(jié)果為:NOA vs. OA1基因上調(diào)8 045,下調(diào)1 150;OA1 vs. OA2基因上調(diào)1 538,下調(diào)420;OA2 vs. OA3基因上調(diào)1 275,下調(diào)1 690;OA3 vs. OA4基因上調(diào)1 834,下調(diào)1 853.比較5例無精子癥睪丸組織的差異基因KEGG,主要富集在RNA降解通路、基底細(xì)胞瘤通路、癌通路、黑色素生成通路和調(diào)節(jié)干細(xì)胞多能性等信號通路. PRM1、PRM2、TNP1、UBXN6、CXCL16、NUPR2、CCDC136和...

【文章頁數(shù)】：13 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 睪丸組織
    1.2 RNA提取、文庫構(gòu)建及測序
    1.3 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 測序質(zhì)量評估及基本數(shù)據(jù)分析
    2.2 測序結(jié)果比對分析
    2.3 差異表達(dá)基因分析
    2.4 時間序列分析
    2.5 差異表達(dá)基因的GO富集與KEGG通路分析
    2.6 融合基因
3 討論
    3.1 睪丸組織轉(zhuǎn)錄組特點
    3.2 差異表達(dá)基因的GO注釋及KEGG分析
    3.3 融合基因分析



本文編號：4027290