目的:基于GEO數(shù)據(jù)庫對miR-221調(diào)控前列腺癌差異基因進行分析,以期找到miR-221調(diào)控前列腺癌的重要靶點基因。方法:在GEO數(shù)據(jù)庫里,獲得miR-221調(diào)控前列腺癌差異基因表達的芯片GSE45627,用在線分析工具GEO2R進行數(shù)據(jù)分析,按照P <0. 01和差異倍數(shù)≥2進行篩選,將篩選得到的基因輸入DAVID數(shù)據(jù)庫進行基因和通路的富集分析,然后進行蛋白質(zhì)互做分析。結(jié)果:共鑒定108個DEG。基因本體富集結(jié)果表明,DEG編碼的功能分子主要位于細胞質(zhì)、細胞核,分子功能主要涉及"雙鏈RNA結(jié)合""螺旋酶活性""雙鏈DNA結(jié)合""蛋白結(jié)合""單鏈RNA結(jié)合",與生物學過程有關,包括"調(diào)節(jié)Ⅰ型干擾素信號通路""病毒的防御反應""調(diào)控病毒遺傳物質(zhì)的復制""先天免疫反應"。KEGG信號通路分析主要涉及甲型H1N1流感信號通路、麻疹信號通路、丙型肝炎信號通路、RIG-I樣受體信號通路、Toll樣受體信號通路等。結(jié)論:生物信息分析的結(jié)果可以發(fā)現(xiàn)miR-221調(diào)控前列腺癌中有用的靶點和信號通路,但這些需要進一步的實驗驗證。

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【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 基因芯片數(shù)據(jù)
    1.2 識別DEG
    1.3 差異基因功能和通路富集分析
    1.4 PPI網(wǎng)絡的建立和模塊的分析
2 結(jié)果
    2.1 篩選基因結(jié)果
    2.2基因功能富集分析
    2.3 KEGG信號通路分析
    2.4 PPI網(wǎng)絡和模塊分析
3 討論



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