外周血B細(xì)胞mRNA表達(dá)在IgA腎病發(fā)病及Gd-IgA1產(chǎn)生中的初步研究
發(fā)布時(shí)間:2024-05-07 03:02
目的IgA腎病是我國(guó)最常見的原發(fā)性腎小球疾病,也是導(dǎo)致青壯年病人進(jìn)入尿毒癥期的最主要病因,給國(guó)家和患者家庭帶來了沉重的負(fù)擔(dān),因此明確IgA腎病的發(fā)病機(jī)制,提出針對(duì)性治療方法尤為重要。目前基因芯片技術(shù)已被廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)研究,為明確各種疾病的基因調(diào)控機(jī)制、研制針對(duì)性治療方案提供了重要的技術(shù)支持。已有的多個(gè)大型研究利用基因芯片技術(shù)證實(shí)在IgA腎病患者中存在多種差異表達(dá)的基因,但各研究所提出的差異表達(dá)的基因和通路各有不同。本研究旨在從高通量基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫中提取、綜合關(guān)于IgA腎病中mRNA差異表達(dá)基因的芯片數(shù)據(jù),并利用深度測(cè)序技術(shù),在IgA腎病患者外周血B細(xì)胞中驗(yàn)證mRNA差異表達(dá)的基因,并進(jìn)一步分析這些基因與血清半乳糖缺乏的IgA1(Gd-IgA1)分子水平的相關(guān)性。方法從高通量基因表達(dá)庫(GEO)中檢索符合納入標(biāo)準(zhǔn)的IgA腎病患者mRNA微陣列數(shù)據(jù)集,使用魯棒多芯片平均算法(RMA)將原始數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化,合并不同套(different series)數(shù)據(jù)后,使用ComBat法去除批次效應(yīng),最后使用R語言v3.2.2分析處理數(shù)據(jù)。利用基因本體集(Gene Ontology,GO)、基因組百科...
【文章頁數(shù)】:43 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略語/符號(hào)說明
前言
研究現(xiàn)狀、成果
研究目的、方法
對(duì)象和方法
1.1 試驗(yàn)對(duì)象
1.1.1 驗(yàn)證試驗(yàn)的研究對(duì)象
1.1.2 單個(gè)基因芯片研究的納入標(biāo)準(zhǔn)
1.2 數(shù)據(jù)分析方法
1.2.1 基因芯片數(shù)據(jù)處理方法
1.2.2 基因差異性表達(dá)的分析
1.2.3 差異表達(dá)基因的功能分析
1.3 試驗(yàn)方法
1.3.1 分離B淋巴細(xì)胞
1.3.2 RNA提取與逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)
1.3.3 深度測(cè)序
1.3.4 定量檢測(cè)半乳糖缺乏的IgA1(Gd-IgA1)分子
1.3.5 mRNA基因深度測(cè)序的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
結(jié)果
2.1 微陣列數(shù)據(jù)分析的結(jié)果
2.1.1 納入研究的特征
2.1.2 IgA腎病患者中基因的差異性表達(dá)
2.1.3 差異表達(dá)的mRNA基因的功能分析
2.2 差異表達(dá)基因的臨床驗(yàn)證結(jié)果
2.2.1 驗(yàn)證試驗(yàn)中出現(xiàn)的差異表達(dá)的mRNA基因
2.2.2 差異基因與Gd-IgA1分子水平之間的關(guān)系
討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
發(fā)表論文和參加科研情況說明
綜述 半乳糖缺乏的IgA1分子及其與IgA腎病發(fā)病機(jī)制關(guān)系的研究進(jìn)展
綜述參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3966725
【文章頁數(shù)】:43 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略語/符號(hào)說明
前言
研究現(xiàn)狀、成果
研究目的、方法
對(duì)象和方法
1.1 試驗(yàn)對(duì)象
1.1.1 驗(yàn)證試驗(yàn)的研究對(duì)象
1.1.2 單個(gè)基因芯片研究的納入標(biāo)準(zhǔn)
1.2 數(shù)據(jù)分析方法
1.2.1 基因芯片數(shù)據(jù)處理方法
1.2.2 基因差異性表達(dá)的分析
1.2.3 差異表達(dá)基因的功能分析
1.3 試驗(yàn)方法
1.3.1 分離B淋巴細(xì)胞
1.3.2 RNA提取與逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)
1.3.3 深度測(cè)序
1.3.4 定量檢測(cè)半乳糖缺乏的IgA1(Gd-IgA1)分子
1.3.5 mRNA基因深度測(cè)序的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
結(jié)果
2.1 微陣列數(shù)據(jù)分析的結(jié)果
2.1.1 納入研究的特征
2.1.2 IgA腎病患者中基因的差異性表達(dá)
2.1.3 差異表達(dá)的mRNA基因的功能分析
2.2 差異表達(dá)基因的臨床驗(yàn)證結(jié)果
2.2.1 驗(yàn)證試驗(yàn)中出現(xiàn)的差異表達(dá)的mRNA基因
2.2.2 差異基因與Gd-IgA1分子水平之間的關(guān)系
討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
發(fā)表論文和參加科研情況說明
綜述 半乳糖缺乏的IgA1分子及其與IgA腎病發(fā)病機(jī)制關(guān)系的研究進(jìn)展
綜述參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3966725
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