目的IgA腎病是我國最常見的原發(fā)性腎小球疾病,也是導致青壯年病人進入尿毒癥期的最主要病因,給國家和患者家庭帶來了沉重的負擔,因此明確IgA腎病的發(fā)病機制,提出針對性治療方法尤為重要。目前基因芯片技術已被廣泛應用于生物醫(yī)學研究,為明確各種疾病的基因調控機制、研制針對性治療方案提供了重要的技術支持。已有的多個大型研究利用基因芯片技術證實在IgA腎病患者中存在多種差異表達的基因,但各研究所提出的差異表達的基因和通路各有不同。本研究旨在從高通量基因表達數(shù)據(jù)庫中提取、綜合關于IgA腎病中mRNA差異表達基因的芯片數(shù)據(jù),并利用深度測序技術,在IgA腎病患者外周血B細胞中驗證mRNA差異表達的基因,并進一步分析這些基因與血清半乳糖缺乏的IgA1(Gd-IgA1)分子水平的相關性。方法從高通量基因表達庫(GEO)中檢索符合納入標準的IgA腎病患者mRNA微陣列數(shù)據(jù)集,使用魯棒多芯片平均算法(RMA)將原始數(shù)據(jù)標準化,合并不同套(different series)數(shù)據(jù)后,使用ComBat法去除批次效應,最后使用R語言v3.2.2分析處理數(shù)據(jù)。利用基因本體集(Gene Ontology,GO)、基因組百科...

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【學位級別】：碩士

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中文摘要
Abstract
縮略語/符號說明
前言
    研究現(xiàn)狀、成果
    研究目的、方法
對象和方法
    1.1 試驗對象
        1.1.1 驗證試驗的研究對象
        1.1.2 單個基因芯片研究的納入標準
    1.2 數(shù)據(jù)分析方法
        1.2.1 基因芯片數(shù)據(jù)處理方法
        1.2.2 基因差異性表達的分析
        1.2.3 差異表達基因的功能分析
    1.3 試驗方法
        1.3.1 分離B淋巴細胞
        1.3.2 RNA提取與逆轉錄PCR(RT-PCR)
        1.3.3 深度測序
        1.3.4 定量檢測半乳糖缺乏的IgA1(Gd-IgA1)分子
        1.3.5 mRNA基因深度測序的數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
結果
    2.1 微陣列數(shù)據(jù)分析的結果
        2.1.1 納入研究的特征
        2.1.2 IgA腎病患者中基因的差異性表達
        2.1.3 差異表達的mRNA基因的功能分析
    2.2 差異表達基因的臨床驗證結果
        2.2.1 驗證試驗中出現(xiàn)的差異表達的mRNA基因
        2.2.2 差異基因與Gd-IgA1分子水平之間的關系
討論
結論
參考文獻
發(fā)表論文和參加科研情況說明
綜述 半乳糖缺乏的IgA1分子及其與IgA腎病發(fā)病機制關系的研究進展
    綜述參考文獻
致謝
個人簡歷



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