鑒定中樞基因預(yù)測膀胱尿路上皮癌患者預(yù)后
發(fā)布時(shí)間:2023-10-28 16:19
目的:膀胱尿路上皮癌(BLCA)在全世界具有高的發(fā)病率和死亡率。確定其癌癥發(fā)生和發(fā)展的確切機(jī)制至關(guān)重要。目前,沒有一種基因被確定為BLCA的確切原因。因此,沒有可接受的分子標(biāo)志來預(yù)測BLCA的預(yù)后。這種知識(shí)的短缺也阻礙了針對(duì)BLCA的新療法的開發(fā)。本研究旨在鑒定參與BLCA起始和進(jìn)展的潛在基因。方法:我們構(gòu)建了加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)(WGCNA),其中基因模塊與BLCA中的臨床特征相關(guān)(n=414)。在建立的25個(gè)模塊中,發(fā)現(xiàn)了淺綠色模塊與癌癥風(fēng)險(xiǎn)之間的高度相關(guān)性。在這些淺綠色模塊中,鑒定了23個(gè)用于轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)的網(wǎng)絡(luò)中樞基因,其中EGR2基因也是在WGCNA中鑒定的模塊基因構(gòu)建的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)中的中樞節(jié)點(diǎn)。結(jié)果:EGR2與存活率呈負(fù)相關(guān),基因集富集分析(GSEA)顯示了四組ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因,ECM受體相互作用,粘著斑,白細(xì)胞跨內(nèi)皮遷移參與了BLCA。結(jié)論:EGR2基因在膀胱癌基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中處于核心位置,且EGR2基因的表達(dá)在膀胱癌不同預(yù)后中有顯著差異性,可以作為膀胱癌發(fā)生發(fā)展以及預(yù)后判斷的重要指標(biāo),可能作為膀胱癌治療的新靶點(diǎn)。這將有助于更好地預(yù)測BLCA的預(yù)后,這種研究也可用于...
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
英漢縮略詞對(duì)照表
前言
1 對(duì)象與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)對(duì)象
1.2 表達(dá)譜數(shù)據(jù)的處理
1.3 差異基因的篩選
1.4 加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
2 結(jié)果
2.1 表達(dá)譜數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.2 BLCA差異表達(dá)基因
2.3 BLCA加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
3 討論
3.1 BLCA加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析的意義
3.2 EGR2 與膀胱尿路上皮癌
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄
致謝
本文編號(hào):3857343
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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中文摘要
ABSTRACT
英漢縮略詞對(duì)照表
前言
1 對(duì)象與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)對(duì)象
1.2 表達(dá)譜數(shù)據(jù)的處理
1.3 差異基因的篩選
1.4 加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
2 結(jié)果
2.1 表達(dá)譜數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.2 BLCA差異表達(dá)基因
2.3 BLCA加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
3 討論
3.1 BLCA加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析的意義
3.2 EGR2 與膀胱尿路上皮癌
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
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本文編號(hào):3857343
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