前列腺癌中多重信號通路的表達檢測
發(fā)布時間:2023-05-10 18:11
目的:觀察良性前列腺增生組織與前列腺癌組織中多重腫瘤相關信號通路關鍵基因的表達差異情況,了解前列腺癌重要相關基因的相互關系,從系統(tǒng)的角度分析PCa相關生物分子的交互網絡,揭示PCa發(fā)生發(fā)展的動態(tài)過程,從而為篩選有效的前列腺癌治療藥物和方案提供新線索。 方法:用德國Qiagen公司人前列腺癌的RT2Profiler PCR Array基因芯片篩選良性前列腺增生組織與前列腺癌組織中相關信號通路的關鍵基因,并用熒光定量RT-PCR檢測篩選出的關聯(lián)基因mRNA在良性前列腺增生組織與前列腺癌組織中的表達。所有數(shù)據采用SPSS15.0統(tǒng)計軟件進行統(tǒng)計分析。 結果:RT2Profiler PCR Array基因芯片篩選出17個興趣基因,將這17個興趣基因導入在線基因網絡數(shù)據庫得到8個關聯(lián)基因構成的網絡調控模擬圖,而AKT1和EGFR是該交互網絡的中樞節(jié)點。8個關聯(lián)基因在良性前列腺增生組織與前列腺癌組織中的相對表達量有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。 結論:EGFR、FASN與GSTP1等17個興趣基因可能與前列腺癌的發(fā)生、發(fā)展及轉移密切相關;KT-1、KLK-3與IGF-1等8個目的基因構成網絡調...
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
目錄
1 緒論
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 組織標本收集
2.1.2 主要實驗儀器
2.1.3 主要實驗試劑
2.2 熒光定量RT—PCR檢測PCA中信號通路相關基因
2.2.1 總RNA提取
2.2.2 總RNA純化
2.2.3 總RNA純度及濃度檢測
2.2.4 cDNA合成
2.2.5 實時熒光定量PCR
2.2.6 RT2 PROFILER PCR ARRAY實驗流程圖
2.3 熒光定量RT—PCR檢測BPH與PCA中目的基因的表達差異
2.3.1 引物設計合成
2.3.2 組織總RNA提取與純化
2.3.3 總RNA純度、濃度以及完整性檢測
2.3.4 逆轉錄反應
2.3.5 熒光定量PCR反應
2.4 數(shù)據處理與統(tǒng)計學分析
2.4.1 熒光定量PCR數(shù)據處理
2.4.2 統(tǒng)計分析
3 結果
3.1 總RNA濃度及完整性鑒定結果
3.2 熒光定量PCR擴增結果
3.2.1 PCA和BPH組熒光定量PCR動力學曲線圖
3.2.2 PCA和BPH組熒光定量PCR融解曲線圖
3.2.3 BPH和PCA組熒光定量PCR的CT值
3.3 PCRARRAY數(shù)據分析軟件對原始CT值分析結果
3.3.1 96基因在PCA與BPH中的相對表達及評價結果
3.3.2 96基因在PCA與BPH組中構成的散點圖
3.3.3 84關鍵基因在PCA與BPH組中構成的熱圖
3.3.4 17興趣基因在PCA與BPH組中構成的柱形圖
3.4 GNCPRO數(shù)據分析軟件模擬興趣基因的交互網絡
3.5 統(tǒng)計結果
3.5.1 BPH和PCA組的MANN—-WHITNEY U檢驗結果
3.5.2 8個關聯(lián)基因在BPH與PCA中的相對表達量比較
4 討論
4.1 改良法提取組織總RNA
4.1.1 RNEAS YMINI KIT試劑盒提取組織總RNA
4.1.2 TRIZOL法提取組織總RNA
4.1.3 TRIZOL法提取組織總RNA后用試劑盒純化
4.2 前列腺癌相關信號通路基因的網絡調控
4.2.1 17興趣基因在BPH和PCA的表達及其意義
4.2.2 8個關聯(lián)基因在PCA中的表達及其意義
4.2.3 EGFR/PI3K/AKT信號通路在PCA中的網絡調控作用
5 結論
參考文獻
綜述
參考文獻
附錄一
附錄二
攻讀學位期間主要的研究成果
致謝
本文編號:3813253
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
目錄
1 緒論
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 組織標本收集
2.1.2 主要實驗儀器
2.1.3 主要實驗試劑
2.2 熒光定量RT—PCR檢測PCA中信號通路相關基因
2.2.1 總RNA提取
2.2.2 總RNA純化
2.2.3 總RNA純度及濃度檢測
2.2.4 cDNA合成
2.2.5 實時熒光定量PCR
2.2.6 RT2 PROFILER PCR ARRAY實驗流程圖
2.3 熒光定量RT—PCR檢測BPH與PCA中目的基因的表達差異
2.3.1 引物設計合成
2.3.2 組織總RNA提取與純化
2.3.3 總RNA純度、濃度以及完整性檢測
2.3.4 逆轉錄反應
2.3.5 熒光定量PCR反應
2.4 數(shù)據處理與統(tǒng)計學分析
2.4.1 熒光定量PCR數(shù)據處理
2.4.2 統(tǒng)計分析
3 結果
3.1 總RNA濃度及完整性鑒定結果
3.2 熒光定量PCR擴增結果
3.2.1 PCA和BPH組熒光定量PCR動力學曲線圖
3.2.2 PCA和BPH組熒光定量PCR融解曲線圖
3.2.3 BPH和PCA組熒光定量PCR的CT值
3.3 PCRARRAY數(shù)據分析軟件對原始CT值分析結果
3.3.1 96基因在PCA與BPH中的相對表達及評價結果
3.3.2 96基因在PCA與BPH組中構成的散點圖
3.3.3 84關鍵基因在PCA與BPH組中構成的熱圖
3.3.4 17興趣基因在PCA與BPH組中構成的柱形圖
3.4 GNCPRO數(shù)據分析軟件模擬興趣基因的交互網絡
3.5 統(tǒng)計結果
3.5.1 BPH和PCA組的MANN—-WHITNEY U檢驗結果
3.5.2 8個關聯(lián)基因在BPH與PCA中的相對表達量比較
4 討論
4.1 改良法提取組織總RNA
4.1.1 RNEAS YMINI KIT試劑盒提取組織總RNA
4.1.2 TRIZOL法提取組織總RNA
4.1.3 TRIZOL法提取組織總RNA后用試劑盒純化
4.2 前列腺癌相關信號通路基因的網絡調控
4.2.1 17興趣基因在BPH和PCA的表達及其意義
4.2.2 8個關聯(lián)基因在PCA中的表達及其意義
4.2.3 EGFR/PI3K/AKT信號通路在PCA中的網絡調控作用
5 結論
參考文獻
綜述
參考文獻
附錄一
附錄二
攻讀學位期間主要的研究成果
致謝
本文編號:3813253
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