前列腺癌中多重信號通路的表達(dá)檢測
發(fā)布時(shí)間:2023-05-10 18:11
目的:觀察良性前列腺增生組織與前列腺癌組織中多重腫瘤相關(guān)信號通路關(guān)鍵基因的表達(dá)差異情況,了解前列腺癌重要相關(guān)基因的相互關(guān)系,從系統(tǒng)的角度分析PCa相關(guān)生物分子的交互網(wǎng)絡(luò),揭示PCa發(fā)生發(fā)展的動(dòng)態(tài)過程,從而為篩選有效的前列腺癌治療藥物和方案提供新線索。 方法:用德國Qiagen公司人前列腺癌的RT2Profiler PCR Array基因芯片篩選良性前列腺增生組織與前列腺癌組織中相關(guān)信號通路的關(guān)鍵基因,并用熒光定量RT-PCR檢測篩選出的關(guān)聯(lián)基因mRNA在良性前列腺增生組織與前列腺癌組織中的表達(dá)。所有數(shù)據(jù)采用SPSS15.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。 結(jié)果:RT2Profiler PCR Array基因芯片篩選出17個(gè)興趣基因,將這17個(gè)興趣基因?qū)朐诰基因網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫得到8個(gè)關(guān)聯(lián)基因構(gòu)成的網(wǎng)絡(luò)調(diào)控模擬圖,而AKT1和EGFR是該交互網(wǎng)絡(luò)的中樞節(jié)點(diǎn)。8個(gè)關(guān)聯(lián)基因在良性前列腺增生組織與前列腺癌組織中的相對表達(dá)量有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。 結(jié)論:EGFR、FASN與GSTP1等17個(gè)興趣基因可能與前列腺癌的發(fā)生、發(fā)展及轉(zhuǎn)移密切相關(guān);KT-1、KLK-3與IGF-1等8個(gè)目的基因構(gòu)成網(wǎng)絡(luò)調(diào)...
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
目錄
1 緒論
2 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 組織標(biāo)本收集
2.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.3 主要實(shí)驗(yàn)試劑
2.2 熒光定量RT—PCR檢測PCA中信號通路相關(guān)基因
2.2.1 總RNA提取
2.2.2 總RNA純化
2.2.3 總RNA純度及濃度檢測
2.2.4 cDNA合成
2.2.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
2.2.6 RT2 PROFILER PCR ARRAY實(shí)驗(yàn)流程圖
2.3 熒光定量RT—PCR檢測BPH與PCA中目的基因的表達(dá)差異
2.3.1 引物設(shè)計(jì)合成
2.3.2 組織總RNA提取與純化
2.3.3 總RNA純度、濃度以及完整性檢測
2.3.4 逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)
2.3.5 熒光定量PCR反應(yīng)
2.4 數(shù)據(jù)處理與統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2.4.1 熒光定量PCR數(shù)據(jù)處理
2.4.2 統(tǒng)計(jì)分析
3 結(jié)果
3.1 總RNA濃度及完整性鑒定結(jié)果
3.2 熒光定量PCR擴(kuò)增結(jié)果
3.2.1 PCA和BPH組熒光定量PCR動(dòng)力學(xué)曲線圖
3.2.2 PCA和BPH組熒光定量PCR融解曲線圖
3.2.3 BPH和PCA組熒光定量PCR的CT值
3.3 PCRARRAY數(shù)據(jù)分析軟件對原始CT值分析結(jié)果
3.3.1 96基因在PCA與BPH中的相對表達(dá)及評價(jià)結(jié)果
3.3.2 96基因在PCA與BPH組中構(gòu)成的散點(diǎn)圖
3.3.3 84關(guān)鍵基因在PCA與BPH組中構(gòu)成的熱圖
3.3.4 17興趣基因在PCA與BPH組中構(gòu)成的柱形圖
3.4 GNCPRO數(shù)據(jù)分析軟件模擬興趣基因的交互網(wǎng)絡(luò)
3.5 統(tǒng)計(jì)結(jié)果
3.5.1 BPH和PCA組的MANN—-WHITNEY U檢驗(yàn)結(jié)果
3.5.2 8個(gè)關(guān)聯(lián)基因在BPH與PCA中的相對表達(dá)量比較
4 討論
4.1 改良法提取組織總RNA
4.1.1 RNEAS YMINI KIT試劑盒提取組織總RNA
4.1.2 TRIZOL法提取組織總RNA
4.1.3 TRIZOL法提取組織總RNA后用試劑盒純化
4.2 前列腺癌相關(guān)信號通路基因的網(wǎng)絡(luò)調(diào)控
4.2.1 17興趣基因在BPH和PCA的表達(dá)及其意義
4.2.2 8個(gè)關(guān)聯(lián)基因在PCA中的表達(dá)及其意義
4.2.3 EGFR/PI3K/AKT信號通路在PCA中的網(wǎng)絡(luò)調(diào)控作用
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
附錄一
附錄二
攻讀學(xué)位期間主要的研究成果
致謝
本文編號:3813253
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
目錄
1 緒論
2 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 組織標(biāo)本收集
2.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.3 主要實(shí)驗(yàn)試劑
2.2 熒光定量RT—PCR檢測PCA中信號通路相關(guān)基因
2.2.1 總RNA提取
2.2.2 總RNA純化
2.2.3 總RNA純度及濃度檢測
2.2.4 cDNA合成
2.2.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
2.2.6 RT2 PROFILER PCR ARRAY實(shí)驗(yàn)流程圖
2.3 熒光定量RT—PCR檢測BPH與PCA中目的基因的表達(dá)差異
2.3.1 引物設(shè)計(jì)合成
2.3.2 組織總RNA提取與純化
2.3.3 總RNA純度、濃度以及完整性檢測
2.3.4 逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)
2.3.5 熒光定量PCR反應(yīng)
2.4 數(shù)據(jù)處理與統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2.4.1 熒光定量PCR數(shù)據(jù)處理
2.4.2 統(tǒng)計(jì)分析
3 結(jié)果
3.1 總RNA濃度及完整性鑒定結(jié)果
3.2 熒光定量PCR擴(kuò)增結(jié)果
3.2.1 PCA和BPH組熒光定量PCR動(dòng)力學(xué)曲線圖
3.2.2 PCA和BPH組熒光定量PCR融解曲線圖
3.2.3 BPH和PCA組熒光定量PCR的CT值
3.3 PCRARRAY數(shù)據(jù)分析軟件對原始CT值分析結(jié)果
3.3.1 96基因在PCA與BPH中的相對表達(dá)及評價(jià)結(jié)果
3.3.2 96基因在PCA與BPH組中構(gòu)成的散點(diǎn)圖
3.3.3 84關(guān)鍵基因在PCA與BPH組中構(gòu)成的熱圖
3.3.4 17興趣基因在PCA與BPH組中構(gòu)成的柱形圖
3.4 GNCPRO數(shù)據(jù)分析軟件模擬興趣基因的交互網(wǎng)絡(luò)
3.5 統(tǒng)計(jì)結(jié)果
3.5.1 BPH和PCA組的MANN—-WHITNEY U檢驗(yàn)結(jié)果
3.5.2 8個(gè)關(guān)聯(lián)基因在BPH與PCA中的相對表達(dá)量比較
4 討論
4.1 改良法提取組織總RNA
4.1.1 RNEAS YMINI KIT試劑盒提取組織總RNA
4.1.2 TRIZOL法提取組織總RNA
4.1.3 TRIZOL法提取組織總RNA后用試劑盒純化
4.2 前列腺癌相關(guān)信號通路基因的網(wǎng)絡(luò)調(diào)控
4.2.1 17興趣基因在BPH和PCA的表達(dá)及其意義
4.2.2 8個(gè)關(guān)聯(lián)基因在PCA中的表達(dá)及其意義
4.2.3 EGFR/PI3K/AKT信號通路在PCA中的網(wǎng)絡(luò)調(diào)控作用
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
附錄一
附錄二
攻讀學(xué)位期間主要的研究成果
致謝
本文編號:3813253
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