11例腎移植術(shù)后合并隱球菌病患者的新生隱球菌菌株遺傳多樣性研究
發(fā)布時間:2022-01-26 23:14
目的分析11例腎移植術(shù)后并發(fā)隱球菌病患者的新生隱球菌株的基因型分布等遺傳多樣性特征,為提高腎移植術(shù)后患者并發(fā)隱球菌病的診治水平提供科學(xué)基礎(chǔ)。方法采用國際人與動物真菌病學(xué)會(International Society for Human and Animal Mycology, ISHAM)推薦的多位點序列分型(multi locus sequence typing, MLST)方法對分離自我院9例及外院2例腎移植術(shù)后患者的11株新生隱球菌進(jìn)行分子分型及系統(tǒng)發(fā)育分析,并與22株分離自免疫功能正常的隱球菌病患者的菌株進(jìn)行群體多樣性特征比較。結(jié)果本研究納入的11株新生隱球菌均為VNⅠ基因型菌株(交配型均為MATα型),其中包含5種ST分子型,且以ST5型菌株為主(46%, 5/11)。系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果與主成分分析(principal component analysis, PCA)結(jié)果均顯示來自腎移植患者的ST5型菌株與來自免疫功能正常患者的ST5型菌株匯聚在一個類群。分離自腎移植術(shù)后隱球菌病患者的菌株群體(π=0.00150)的核酸多樣性(π)高于分離自免疫功能正;颊叩木耆后w(π=0....
【文章來源】:中國真菌學(xué)雜志. 2020,15(06)CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
基于多位點序列構(gòu)建的分離自腎移植術(shù)后患者致病新生隱球菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹(鄰接法)
國外研究提示隱球菌腦膜炎是腎移植患者術(shù)后并發(fā)侵襲性真菌感染之一[24],病死率可達(dá)49%[13-15]。腎移植手術(shù)是我國開展最廣泛的實體器官移植手術(shù),目前存活的術(shù)后患者人群數(shù)量巨大(>10萬人)[12],是一個不容忽視的隱球菌病易感染人群[22]。2003年,Prasad等[23]在基于一項326例印度患者的單中心研究中報道腎移植術(shù)后發(fā)病隱球菌病的患者約占隱球菌病總患者數(shù)量的20%。值得注意的是,既往流行病學(xué)研究提示我國隱球菌病患者中大部分免疫功能正常(約70%)[9,25],國內(nèi)相關(guān)臨床診治經(jīng)驗也主要來源于此。然而,不同宿主人群并發(fā)隱球菌病的致病菌種群的遺傳多樣性可能不同,且不同基因型的新生隱球菌株具有不同的毒力及藥敏特征。因此,研究分離自腎移植術(shù)后隱球菌病患者致病菌的基因型分布等遺傳多樣性對于提高該人群隱球菌病的診治水平具有重要意義。表2 本研究納入菌株多態(tài)性位點、核苷酸多樣性及平均核苷酸差異數(shù)Tab.2 Number of polymorphic sites, nucleotide diversity and average number of nucleotide differences per sequence in this study 位點 腎移植患者 免疫功能正;颊 S π k S π k CAP59 0 0 0 0 0 0 GPD1 3 0.00174 0.945 6 0.00131 0.710 IGS1 10 0.00605 4.364 2 0.00026 0.182 LAC1 1 0.00108 0.509 6 0.00116 0.545 PLB1 1 0.00034 0.182 3 0.00067 0.355 SOD1 0 0 0 11 0.00187 1.000 URA5 0 0 0 8 0.00114 0.727 總和 15 0.00150 6.000 36 0.00088 3.519 S: 多態(tài)性位點;π: 核苷酸多樣性;k: 平均核苷酸差異數(shù).
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]隱球菌性腦膜炎診治專家共識[J]. 劉正印,王貴強(qiáng),朱利平,呂曉菊,章強(qiáng)強(qiáng),俞云松,周志慧,劉焱斌,蔡衛(wèi)平,李若瑜,張文宏,張福杰,吳昊,徐英春,盧洪洲,李太生. 中華內(nèi)科雜志. 2018 (05)
[2]免疫正常人群隱球菌性腦膜炎臨床分析[J]. 劉加,方文捷,洪南,李娟,陳敏,潘煒華,廖萬清. 中國真菌學(xué)雜志. 2016(02)
[3]北京昌平區(qū)鴿糞中新生隱球菌的分離鑒定及其血清型、配型分析[J]. 吳媛,趙桂英,李文革,盧金星. 中國人獸共患病學(xué)報. 2011(04)
[4]腎移植與隱球菌感染[J]. 范娟,朱元杰,溫海. 中國真菌學(xué)雜志. 2007(01)
本文編號:3611299
【文章來源】:中國真菌學(xué)雜志. 2020,15(06)CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
基于多位點序列構(gòu)建的分離自腎移植術(shù)后患者致病新生隱球菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹(鄰接法)
國外研究提示隱球菌腦膜炎是腎移植患者術(shù)后并發(fā)侵襲性真菌感染之一[24],病死率可達(dá)49%[13-15]。腎移植手術(shù)是我國開展最廣泛的實體器官移植手術(shù),目前存活的術(shù)后患者人群數(shù)量巨大(>10萬人)[12],是一個不容忽視的隱球菌病易感染人群[22]。2003年,Prasad等[23]在基于一項326例印度患者的單中心研究中報道腎移植術(shù)后發(fā)病隱球菌病的患者約占隱球菌病總患者數(shù)量的20%。值得注意的是,既往流行病學(xué)研究提示我國隱球菌病患者中大部分免疫功能正常(約70%)[9,25],國內(nèi)相關(guān)臨床診治經(jīng)驗也主要來源于此。然而,不同宿主人群并發(fā)隱球菌病的致病菌種群的遺傳多樣性可能不同,且不同基因型的新生隱球菌株具有不同的毒力及藥敏特征。因此,研究分離自腎移植術(shù)后隱球菌病患者致病菌的基因型分布等遺傳多樣性對于提高該人群隱球菌病的診治水平具有重要意義。表2 本研究納入菌株多態(tài)性位點、核苷酸多樣性及平均核苷酸差異數(shù)Tab.2 Number of polymorphic sites, nucleotide diversity and average number of nucleotide differences per sequence in this study 位點 腎移植患者 免疫功能正;颊 S π k S π k CAP59 0 0 0 0 0 0 GPD1 3 0.00174 0.945 6 0.00131 0.710 IGS1 10 0.00605 4.364 2 0.00026 0.182 LAC1 1 0.00108 0.509 6 0.00116 0.545 PLB1 1 0.00034 0.182 3 0.00067 0.355 SOD1 0 0 0 11 0.00187 1.000 URA5 0 0 0 8 0.00114 0.727 總和 15 0.00150 6.000 36 0.00088 3.519 S: 多態(tài)性位點;π: 核苷酸多樣性;k: 平均核苷酸差異數(shù).
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]隱球菌性腦膜炎診治專家共識[J]. 劉正印,王貴強(qiáng),朱利平,呂曉菊,章強(qiáng)強(qiáng),俞云松,周志慧,劉焱斌,蔡衛(wèi)平,李若瑜,張文宏,張福杰,吳昊,徐英春,盧洪洲,李太生. 中華內(nèi)科雜志. 2018 (05)
[2]免疫正常人群隱球菌性腦膜炎臨床分析[J]. 劉加,方文捷,洪南,李娟,陳敏,潘煒華,廖萬清. 中國真菌學(xué)雜志. 2016(02)
[3]北京昌平區(qū)鴿糞中新生隱球菌的分離鑒定及其血清型、配型分析[J]. 吳媛,趙桂英,李文革,盧金星. 中國人獸共患病學(xué)報. 2011(04)
[4]腎移植與隱球菌感染[J]. 范娟,朱元杰,溫海. 中國真菌學(xué)雜志. 2007(01)
本文編號:3611299
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