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尿毒癥患者外周血單個(gè)核細(xì)胞三維基因組學(xué)的初步研究

發(fā)布時(shí)間:2022-01-04 01:02
  研究背景:慢性腎小球腎炎(chronic glomerulonephritis,CGN)的病人發(fā)病時(shí)間不固定,早期癥狀不明顯;颊吣I臟中腎小球持續(xù)緩慢累積損傷最終發(fā)展為尿毒癥(Uremic)。三維基因組學(xué)(Three-Dimensional Genomics,3D Genomics)是在三維空間結(jié)構(gòu)上對(duì)生物過(guò)程進(jìn)行研究,如不同三維結(jié)構(gòu)的基因組序列在基因轉(zhuǎn)錄,復(fù)制,修復(fù)和調(diào)控中發(fā)揮作用。外周血單個(gè)核細(xì)胞(Peripheral blood mononuclear cell,PBMC)含有非常多的免疫細(xì)胞,常用于人體免疫系統(tǒng)研究。腎小球腎炎患者免疫細(xì)胞和正常人免疫細(xì)胞存在基因表達(dá)差異,但是我們并不了解免疫細(xì)胞基因調(diào)控變化導(dǎo)致腎小球損傷的過(guò)程。為了探討三維基因組學(xué)的變化差異和疾病的關(guān)聯(lián),我們對(duì)腎小球腎炎尿毒癥期患者免疫細(xì)胞和正常人免疫細(xì)胞進(jìn)行了Hi-C(High-throughput chromosome conformation capture,Hi-C)分析。目的:本研究利用高通量測(cè)序方法,以病人的外周血單核細(xì)胞作為研究對(duì)象,觀察三維基因組學(xué)的變化。同時(shí)探討外周血單個(gè)核細(xì)胞在尿毒癥中的發(fā)病... 

【文章來(lái)源】:廣西師范大學(xué)廣西壯族自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

尿毒癥患者外周血單個(gè)核細(xì)胞三維基因組學(xué)的初步研究


染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)

技術(shù)路線圖


技術(shù)路線圖

電泳圖,交聯(lián),電泳圖,產(chǎn)物


U20:64.2ng/μL×10-3×50μL×20=64.2μg≥15μgNor20:65.4ng/μL×10-3×50μL×20=65.4μg≥15μg標(biāo)準(zhǔn) Hi-C 要求 DNA 總量≥15μg 才可進(jìn)行后續(xù)的 Hi-C 片段制備流程。結(jié)果顯示樣品如表 3-1,DNA 總量合格,兩個(gè)樣本都滿足標(biāo)準(zhǔn) Hi-C 建庫(kù)要求。3.1.2 交聯(lián)酶切產(chǎn)物檢測(cè)用瓊脂糖凝膠電泳(膠濃度 1%、電壓 100V、時(shí)間 60min)交聯(lián)酶切產(chǎn)物完整性檢測(cè),其結(jié)果如下圖:1 U20 64.2 ±1 50 3.21 64.22 Nor20 65.4 ±1 50 3.4 65.4

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]對(duì)尿毒癥并發(fā)高磷血癥患者進(jìn)行血液透析聯(lián)合血液灌流治療的效果探析[J]. 胡敏,唐銘君.  當(dāng)代醫(yī)藥論叢. 2019(14)
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[4]核苷酸結(jié)合寡聚化結(jié)構(gòu)域樣受體熱蛋白結(jié)構(gòu)域亞家族成員3炎癥小體的活化調(diào)節(jié)與牙周疾病的關(guān)系[J]. 吳冷,王駿,趙蕾,吳亞菲.  國(guó)際口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2015(06)
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博士論文
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[2]染色體芯片分析技術(shù)應(yīng)用于先天性心臟病分子診斷及發(fā)病機(jī)制研究[D]. 耿娟.上海交通大學(xué) 2014
[3]擬南芥組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶SDG25和組蛋白分子伴侶NAP1的功能研究[D]. 高娟.復(fù)旦大學(xué) 2012
[4]染色質(zhì)重塑與TonEBP依賴的基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控[D]. 郭進(jìn)軍.重慶醫(yī)科大學(xué) 2006

碩士論文
[1]CTCF結(jié)合與DNA甲基化對(duì)組蛋白修飾分布的影響[D]. 閆甜甜.內(nèi)蒙古大學(xué) 2017
[2]基于細(xì)胞核分析的癌細(xì)胞圖像特征提取與識(shí)別[D]. 趙國(guó)超.武漢理工大學(xué) 2013



本文編號(hào):3567330

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