尿毒癥患者外周血單個(gè)核細(xì)胞三維基因組學(xué)的初步研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-04 01:02
研究背景:慢性腎小球腎炎(chronic glomerulonephritis,CGN)的病人發(fā)病時(shí)間不固定,早期癥狀不明顯;颊吣I臟中腎小球持續(xù)緩慢累積損傷最終發(fā)展為尿毒癥(Uremic)。三維基因組學(xué)(Three-Dimensional Genomics,3D Genomics)是在三維空間結(jié)構(gòu)上對(duì)生物過(guò)程進(jìn)行研究,如不同三維結(jié)構(gòu)的基因組序列在基因轉(zhuǎn)錄,復(fù)制,修復(fù)和調(diào)控中發(fā)揮作用。外周血單個(gè)核細(xì)胞(Peripheral blood mononuclear cell,PBMC)含有非常多的免疫細(xì)胞,常用于人體免疫系統(tǒng)研究。腎小球腎炎患者免疫細(xì)胞和正常人免疫細(xì)胞存在基因表達(dá)差異,但是我們并不了解免疫細(xì)胞基因調(diào)控變化導(dǎo)致腎小球損傷的過(guò)程。為了探討三維基因組學(xué)的變化差異和疾病的關(guān)聯(lián),我們對(duì)腎小球腎炎尿毒癥期患者免疫細(xì)胞和正常人免疫細(xì)胞進(jìn)行了Hi-C(High-throughput chromosome conformation capture,Hi-C)分析。目的:本研究利用高通量測(cè)序方法,以病人的外周血單核細(xì)胞作為研究對(duì)象,觀察三維基因組學(xué)的變化。同時(shí)探討外周血單個(gè)核細(xì)胞在尿毒癥中的發(fā)病...
【文章來(lái)源】:廣西師范大學(xué)廣西壯族自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)
技術(shù)路線圖
U20:64.2ng/μL×10-3×50μL×20=64.2μg≥15μgNor20:65.4ng/μL×10-3×50μL×20=65.4μg≥15μg標(biāo)準(zhǔn) Hi-C 要求 DNA 總量≥15μg 才可進(jìn)行后續(xù)的 Hi-C 片段制備流程。結(jié)果顯示樣品如表 3-1,DNA 總量合格,兩個(gè)樣本都滿足標(biāo)準(zhǔn) Hi-C 建庫(kù)要求。3.1.2 交聯(lián)酶切產(chǎn)物檢測(cè)用瓊脂糖凝膠電泳(膠濃度 1%、電壓 100V、時(shí)間 60min)交聯(lián)酶切產(chǎn)物完整性檢測(cè),其結(jié)果如下圖:1 U20 64.2 ±1 50 3.21 64.22 Nor20 65.4 ±1 50 3.4 65.4
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]對(duì)尿毒癥并發(fā)高磷血癥患者進(jìn)行血液透析聯(lián)合血液灌流治療的效果探析[J]. 胡敏,唐銘君. 當(dāng)代醫(yī)藥論叢. 2019(14)
[2]細(xì)胞命運(yùn)轉(zhuǎn)化中的染色質(zhì)重塑及其表觀遺傳調(diào)控機(jī)制[J]. 江賜忠,高紹榮. 生命科學(xué). 2017(10)
[3]SWI/SNF染色質(zhì)重塑復(fù)合物依賴的心臟發(fā)育及心臟病理性重構(gòu)的表觀遺傳調(diào)控機(jī)制[J]. 李一飛,周開宇,華益民. 臨床兒科雜志. 2016(04)
[4]核苷酸結(jié)合寡聚化結(jié)構(gòu)域樣受體熱蛋白結(jié)構(gòu)域亞家族成員3炎癥小體的活化調(diào)節(jié)與牙周疾病的關(guān)系[J]. 吳冷,王駿,趙蕾,吳亞菲. 國(guó)際口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2015(06)
[5]尿毒癥不同原發(fā)病合并頑固性高血壓的療效[J]. 張繼波,熊有明,龔麗萍,林初媛,陳燕華,覃娜莎. 實(shí)用臨床醫(yī)學(xué). 2015(04)
[6]尿毒癥患者如何進(jìn)行有效護(hù)理[J]. 周麗梅. 中國(guó)社區(qū)醫(yī)師(醫(yī)學(xué)專業(yè)). 2010(29)
[7]我國(guó)面臨快速增長(zhǎng)的終末期腎病治療負(fù)擔(dān)[J]. Li Zuo M.D.1 and Mei Wang M.D.2 for Chinese Society of Blood Purification Institute of Nephrology,Peking University First 1 Hospital Institute of Nephrology,Peking University People’s Hospital 2. 中國(guó)血液凈化. 2010(01)
[8]國(guó)際與我國(guó)血液透析發(fā)展概況[J]. 陳再彬. 健康向?qū)? 2009(03)
[9]BAR結(jié)構(gòu)域蛋白質(zhì)的功能[J]. 張偉,王建光. 生命的化學(xué). 2004(05)
[10]擬南芥CBF4基因位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性(SNP)變化與抗旱表型的相應(yīng)性[J]. 郝崗平,吳忠義,陳茂盛,曹鳴慶,Dominique Brunnel,Georges Pelletier,黃叢林,楊清. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2004(02)
博士論文
[1]二代測(cè)序在胚胎植入前染色體疾病診斷中的臨床應(yīng)用[D]. 范俊梅.中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院 2015
[2]染色體芯片分析技術(shù)應(yīng)用于先天性心臟病分子診斷及發(fā)病機(jī)制研究[D]. 耿娟.上海交通大學(xué) 2014
[3]擬南芥組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶SDG25和組蛋白分子伴侶NAP1的功能研究[D]. 高娟.復(fù)旦大學(xué) 2012
[4]染色質(zhì)重塑與TonEBP依賴的基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控[D]. 郭進(jìn)軍.重慶醫(yī)科大學(xué) 2006
碩士論文
[1]CTCF結(jié)合與DNA甲基化對(duì)組蛋白修飾分布的影響[D]. 閆甜甜.內(nèi)蒙古大學(xué) 2017
[2]基于細(xì)胞核分析的癌細(xì)胞圖像特征提取與識(shí)別[D]. 趙國(guó)超.武漢理工大學(xué) 2013
本文編號(hào):3567330
【文章來(lái)源】:廣西師范大學(xué)廣西壯族自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)
技術(shù)路線圖
U20:64.2ng/μL×10-3×50μL×20=64.2μg≥15μgNor20:65.4ng/μL×10-3×50μL×20=65.4μg≥15μg標(biāo)準(zhǔn) Hi-C 要求 DNA 總量≥15μg 才可進(jìn)行后續(xù)的 Hi-C 片段制備流程。結(jié)果顯示樣品如表 3-1,DNA 總量合格,兩個(gè)樣本都滿足標(biāo)準(zhǔn) Hi-C 建庫(kù)要求。3.1.2 交聯(lián)酶切產(chǎn)物檢測(cè)用瓊脂糖凝膠電泳(膠濃度 1%、電壓 100V、時(shí)間 60min)交聯(lián)酶切產(chǎn)物完整性檢測(cè),其結(jié)果如下圖:1 U20 64.2 ±1 50 3.21 64.22 Nor20 65.4 ±1 50 3.4 65.4
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]對(duì)尿毒癥并發(fā)高磷血癥患者進(jìn)行血液透析聯(lián)合血液灌流治療的效果探析[J]. 胡敏,唐銘君. 當(dāng)代醫(yī)藥論叢. 2019(14)
[2]細(xì)胞命運(yùn)轉(zhuǎn)化中的染色質(zhì)重塑及其表觀遺傳調(diào)控機(jī)制[J]. 江賜忠,高紹榮. 生命科學(xué). 2017(10)
[3]SWI/SNF染色質(zhì)重塑復(fù)合物依賴的心臟發(fā)育及心臟病理性重構(gòu)的表觀遺傳調(diào)控機(jī)制[J]. 李一飛,周開宇,華益民. 臨床兒科雜志. 2016(04)
[4]核苷酸結(jié)合寡聚化結(jié)構(gòu)域樣受體熱蛋白結(jié)構(gòu)域亞家族成員3炎癥小體的活化調(diào)節(jié)與牙周疾病的關(guān)系[J]. 吳冷,王駿,趙蕾,吳亞菲. 國(guó)際口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2015(06)
[5]尿毒癥不同原發(fā)病合并頑固性高血壓的療效[J]. 張繼波,熊有明,龔麗萍,林初媛,陳燕華,覃娜莎. 實(shí)用臨床醫(yī)學(xué). 2015(04)
[6]尿毒癥患者如何進(jìn)行有效護(hù)理[J]. 周麗梅. 中國(guó)社區(qū)醫(yī)師(醫(yī)學(xué)專業(yè)). 2010(29)
[7]我國(guó)面臨快速增長(zhǎng)的終末期腎病治療負(fù)擔(dān)[J]. Li Zuo M.D.1 and Mei Wang M.D.2 for Chinese Society of Blood Purification Institute of Nephrology,Peking University First 1 Hospital Institute of Nephrology,Peking University People’s Hospital 2. 中國(guó)血液凈化. 2010(01)
[8]國(guó)際與我國(guó)血液透析發(fā)展概況[J]. 陳再彬. 健康向?qū)? 2009(03)
[9]BAR結(jié)構(gòu)域蛋白質(zhì)的功能[J]. 張偉,王建光. 生命的化學(xué). 2004(05)
[10]擬南芥CBF4基因位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性(SNP)變化與抗旱表型的相應(yīng)性[J]. 郝崗平,吳忠義,陳茂盛,曹鳴慶,Dominique Brunnel,Georges Pelletier,黃叢林,楊清. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2004(02)
博士論文
[1]二代測(cè)序在胚胎植入前染色體疾病診斷中的臨床應(yīng)用[D]. 范俊梅.中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院 2015
[2]染色體芯片分析技術(shù)應(yīng)用于先天性心臟病分子診斷及發(fā)病機(jī)制研究[D]. 耿娟.上海交通大學(xué) 2014
[3]擬南芥組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶SDG25和組蛋白分子伴侶NAP1的功能研究[D]. 高娟.復(fù)旦大學(xué) 2012
[4]染色質(zhì)重塑與TonEBP依賴的基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控[D]. 郭進(jìn)軍.重慶醫(yī)科大學(xué) 2006
碩士論文
[1]CTCF結(jié)合與DNA甲基化對(duì)組蛋白修飾分布的影響[D]. 閆甜甜.內(nèi)蒙古大學(xué) 2017
[2]基于細(xì)胞核分析的癌細(xì)胞圖像特征提取與識(shí)別[D]. 趙國(guó)超.武漢理工大學(xué) 2013
本文編號(hào):3567330
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