目的基于月桂酸和姜黃二酮的抗腫瘤特性,發(fā)掘前列腺癌中新的靶向治療基因。方法 BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫預(yù)測2種化合物共同靶蛋白基因,metascape數(shù)據(jù)庫對共同靶點進(jìn)行功能富集分析確定關(guān)鍵基因,GEPIA數(shù)據(jù)庫篩選研究靶點。對研究靶點進(jìn)行生存分析、tdROC曲線分析以及GSEA分析。結(jié)果月桂酸和姜黃二酮兩者共有24個靶蛋白基因,功能富集分析確定8個關(guān)鍵基因和前列腺癌相關(guān),其中BDKRB2基因在腫瘤組織和正常組織之間差異表達(dá)。生存分析顯示,BDKRB2低表達(dá)與患者不良預(yù)后相關(guān)。單基因GSEA提示,BDKRB2基因通過多種信號通路與前列腺癌發(fā)生發(fā)展相關(guān)。結(jié)論月桂酸和姜黃二酮可共同作用于BDKRB2基因,從而在前列腺癌中發(fā)揮治療作用。 

【文章來源】：實用藥物與臨床. 2020,23(05)

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

流程圖

應(yīng)用BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫[6]預(yù)測月桂酸和姜黃二酮的靶蛋白基因。在預(yù)測靶蛋白基因的過程中,該數(shù)據(jù)庫利用化合物的結(jié)構(gòu),確定各個官能團(tuán),再通過對靶蛋白結(jié)構(gòu)中的各個官能團(tuán)進(jìn)行比對,確定化合物以及其對應(yīng)靶蛋白之間的作用關(guān)系。圖2中展示了月桂酸和姜黃二酮的2D和3D結(jié)構(gòu)。在BATMAN-TCM的化合物分析模塊中,依次輸入月桂酸和姜黃二酮的英文名稱,分別獲取各自的靶向蛋白基因。然后對月桂酸和姜黃二酮的靶蛋白基因取交集,得到共同靶蛋白基因。1.2 在metascape中對共同靶蛋白基因進(jìn)行功能富集分析

按照BATMAN-TCM網(wǎng)站的說明文件,將月桂酸和姜黃二酮的英文名依次輸入到數(shù)據(jù)庫中,發(fā)現(xiàn)月桂酸具有238個靶蛋白基因,姜黃二酮具有264個靶蛋白基因。在這兩種化合物的靶蛋白基因中,有24個基因為兩者的共同靶蛋白基因。見圖3A。2.2 功能富集分析結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于對枸杞、姜黃、甘草的生物信息學(xué)分析探究GRIN3A在前列腺癌中的治療意義[J]. 王慶哲,張恩崇,宋永勝.  實用藥物與臨床. 2020(01)
[2]前列腺癌發(fā)生發(fā)展的流行病學(xué)研究進(jìn)展[J]. 楊進(jìn)益,楊明州,魏偉,岳文昌.  臨床泌尿外科雜志. 2017(09)



本文編號：3381378