核心蛋白聚糖在常染色體顯性多囊腎病進(jìn)展中的作用及機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2021-06-30 15:40
研究目的:常染色體顯性多囊腎。╝utosomal dominant kidney disease,ADPKD)作為最常見(jiàn)的遺傳性腎病,主要由PKD1或PKD2基因突變引起,導(dǎo)致腎臟囊腫的形成和擴(kuò)張。過(guò)去的40多年,ADPKD的進(jìn)展、診斷和治療已取得巨大的進(jìn)步,但是ADPKD目前仍是難以治愈的疾病,缺少有效的干預(yù)及治療手段。ADPKD作為常見(jiàn)的遺傳性腎病,基因突變是探索疾病本身發(fā)生發(fā)展機(jī)制的核心。PKD1或PKD2基因突變可導(dǎo)致一系列的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路發(fā)生異常,異常激活或抑制的信號(hào)通路相互交聯(lián),形成復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)。通過(guò)對(duì)2項(xiàng)ADPKD患者腎組織表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)集進(jìn)行生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)核心節(jié)點(diǎn)基因DCN在多囊腎病中是異常表達(dá),與多種差異表達(dá)基因存在生物學(xué)關(guān)聯(lián),參與多種信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。DCN基因編碼蛋白核心蛋白聚糖(decorin,DCN)是細(xì)胞外基質(zhì)的成分之一,屬于富含亮氨酸的小分子多糖家族成員,通過(guò)多種機(jī)制發(fā)揮抗腫瘤,調(diào)節(jié)新生血管形成、抗纖維化等生物學(xué)功能。DCN蛋白作為具有廣泛生物學(xué)效應(yīng)的小分子蛋白,在慢性腎臟病進(jìn)展中起到抗炎和抗纖維化的作用。深入探索DCN在ADPKD中的生物學(xué)功能,可能...
【文章來(lái)源】:中國(guó)人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)上海市 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:107 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
差異表達(dá)基因功能富集圖1-2差異表達(dá)基因功能富集
海軍軍醫(yī)大學(xué)博士學(xué)位論文- 20 -圖1-3 差異表達(dá)基因信號(hào)通路富集(3)蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),關(guān)鍵基因和信號(hào)通路模塊分析共同表達(dá)的561個(gè)DEGs(291個(gè)上調(diào)基因,270個(gè)下調(diào)基因)輸入String在線的數(shù)據(jù)集,獲取蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),獲得421個(gè)節(jié)點(diǎn)基因(圖1-4A)。在這些421個(gè)節(jié)點(diǎn)基因中,根據(jù)蛋白質(zhì)相互作用聯(lián)系評(píng)分,獲得34個(gè)中心節(jié)點(diǎn)基因,排名前十的節(jié)點(diǎn)基因分別是ALB, JUN, 胰島素樣生長(zhǎng)因子1 (IGF1), 成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子2 (FGF2), α平滑肌肌動(dòng)蛋白2 (ACTA2),纖溶酶原 (PLG), EHHADH, 波形蛋白(VIM)和 核心蛋白聚糖(DCN)。根據(jù)節(jié)點(diǎn)基因打分的重要性,在網(wǎng)絡(luò)
蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)圖
本文編號(hào):3258022
【文章來(lái)源】:中國(guó)人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)上海市 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:107 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
差異表達(dá)基因功能富集圖1-2差異表達(dá)基因功能富集
海軍軍醫(yī)大學(xué)博士學(xué)位論文- 20 -圖1-3 差異表達(dá)基因信號(hào)通路富集(3)蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),關(guān)鍵基因和信號(hào)通路模塊分析共同表達(dá)的561個(gè)DEGs(291個(gè)上調(diào)基因,270個(gè)下調(diào)基因)輸入String在線的數(shù)據(jù)集,獲取蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),獲得421個(gè)節(jié)點(diǎn)基因(圖1-4A)。在這些421個(gè)節(jié)點(diǎn)基因中,根據(jù)蛋白質(zhì)相互作用聯(lián)系評(píng)分,獲得34個(gè)中心節(jié)點(diǎn)基因,排名前十的節(jié)點(diǎn)基因分別是ALB, JUN, 胰島素樣生長(zhǎng)因子1 (IGF1), 成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子2 (FGF2), α平滑肌肌動(dòng)蛋白2 (ACTA2),纖溶酶原 (PLG), EHHADH, 波形蛋白(VIM)和 核心蛋白聚糖(DCN)。根據(jù)節(jié)點(diǎn)基因打分的重要性,在網(wǎng)絡(luò)
蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)圖
本文編號(hào):3258022
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