目的:膀胱癌是泌尿系統(tǒng)最常見的惡性腫瘤,占我國泌尿生殖系統(tǒng)腫瘤發(fā)病率的第一位,并即將成為全球第六大最常見的惡性腫瘤,且發(fā)病率仍在上升。具有轉(zhuǎn)移迅速、預(yù)后比較差、復(fù)發(fā)率高等特點。膀胱癌是發(fā)生在膀胱黏膜上的惡性腫瘤,根據(jù)病理組織學(xué)分類,膀胱癌的病理類型包括膀胱尿路上皮癌、膀胱腺癌、膀胱鱗狀細胞癌、膀胱小細胞癌、膀胱類癌和膀胱透明細胞癌6種類型。其中,膀胱尿路上皮癌占膀胱癌患者總數(shù)的90%以上,是最常見的膀胱癌。雖然局限性膀胱癌腫瘤能通過外科手術(shù)切除而得以控制,但目前對于膀胱癌術(shù)后的高復(fù)發(fā)和高轉(zhuǎn)移率臨床上仍然缺少有效的治療手段。因此,如何阻止膀胱癌的發(fā)生和進展成為目前治療膀胱癌有待解決的關(guān)鍵問題,其中尋找新的分子靶點、探究膀胱癌發(fā)生發(fā)展的分子機制成為研究的熱點。基因突變、腫瘤抑制因子的喪失以及細胞生長信號通路的異常調(diào)控都與膀胱癌的發(fā)生發(fā)展有關(guān)。近年來大量研究表明,非編碼RNA（non-coding RNA,ncRNA）的異常表達在膀胱癌的發(fā)生、發(fā)展過程中起著重要作用。因此,本研究利用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫對膀胱癌中基因（mRNA、miRNA、lncRNA）從分子水平進行研究,豐富膀胱癌的發(fā)生、發(fā)展... 

【文章來源】：桂林醫(yī)學(xué)院廣西壯族自治區(qū)

【文章頁數(shù)】：76 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

在TCGA數(shù)據(jù)庫中設(shè)定檢索條件獲取膀胱癌數(shù)據(jù)

圖 1-2.ceRNA 假說的機制示意圖[49]。Figure 1-2.Schematic diagram of the mechanism of the ceRNA[49]。1.4 基因功能富集分析為了進一步闡明膀胱癌中差異表達的 RNA 生物學(xué)功能，本研究中使用了 DAVID 數(shù)據(jù)庫對 ceRNA 網(wǎng)絡(luò)中有差異表達的 RNA 進行富集分析，主要分析分子功能，生物過程和細胞成分這三方面。我們常用的富集分析主要包括 GO 分析和 KEGG 分析。GO 分析和 KEGG 分析的條形圖均由“Goplot”包產(chǎn)生，其篩選調(diào)節(jié)為 P<0.05,此時顯示為顯著富集。具體過程如下：打開網(wǎng)站 https://david.ncifcrf.gov/ ，進入 DAVID 首頁，然后點擊 Start

異表達的 mRNA、lncRNA、miRNA 聚類生成的火山圖（表達倍數(shù)>2 倍，P<1-4E，紅上調(diào)，綠色代表顯著下調(diào)）。A:差異表達的 mRNA 火山圖；B：差異表達的 miRNA 火山差異表達的 lncRNA 火山圖。 2-1. Volcano map generated by clustering of differentially expressed mRNA, lncRNAand mpression multiple > is twice, P< 1-4e, red represents significantly up-regulated, green represenificantly down-regulated).A: volcano map of differentially expressed mRNA; B: volcano mapdifferentially expressed miRNA; C: volcano map of differentially expressed lncRNA.eRNA 網(wǎng)絡(luò)的分析們根據(jù) ceRNA 假說進一步驗證了這些差異表達的 RNA 的關(guān)系和功我們預(yù)測了在線數(shù)據(jù)庫中的 lncRNA-miRNA 和 miRN-mRNA 的相互作ceRNA 網(wǎng)絡(luò)的 17 個關(guān)鍵 miRNA 總共有 52 個靶向 mRNA（表 2-2）們預(yù)測到 58 個 lncRNA 和 22 個 miRNA 有相互作用關(guān)系（表 2-3有差異表達的 RNA 的中的 52 個 mRNA，58 個 lncRNA 和 22 個 m

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]microRNA-214在膀胱癌中表達的生物學(xué)功能、調(diào)控機制及臨床應(yīng)用研究[D]. 王金鳳.山東大學(xué) 2015

碩士論文
[1]LncRNA RP11-79H23.3在膀胱癌的發(fā)生發(fā)展中作為ceRNA通過miR-107調(diào)控PTEN表達的作用機制[D]. 池虹.重慶醫(yī)科大學(xué) 2018
[2]長鏈非編碼RNA-n346372在膀胱癌發(fā)生發(fā)展中的作用及相關(guān)基因研究[D]. 劉安偉.第二軍醫(yī)大學(xué) 2017
[3]MiR-34a在人膀胱癌組織中的表達[D]. 王偉.河北聯(lián)合大學(xué) 2011



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