本文將前列腺癌（Prostate Cancer,PCa）PC-3M-1E8細(xì)胞為標(biāo)靶的核酸適配體序列翻譯成氨基酸序列,計(jì)算氨基酸序列的分子參數(shù),然后用這些分子參數(shù)建立核酸適配體親和性的構(gòu)-效關(guān)系模型。所用的候選核酸適配體序列是采用以細(xì)胞為靶標(biāo)的指數(shù)富集配體系統(tǒng)進(jìn)化（Cell-SELEX）技術(shù)篩選得到。模型訓(xùn)練集、測(cè)試集分別包含150、50條核酸序列,均由第3輪和11輪的候選核酸適配體組成。將第3輪的核酸序列類標(biāo)簽值設(shè)置為"1",代表低親和性、低特異性的候選核酸適配序列;將第11輪篩選所得核酸序列類標(biāo)簽值設(shè)置為"2",代表高親和性、高特異性候選核酸適配序列。基于二值分類問(wèn)題的支持向量機(jī)分類（SVC）算法用于建模。SVC模型對(duì)訓(xùn)練集、測(cè)試集的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確度分別為87.3%、86%。另外,采用SVC模型對(duì)第5、7、9輪的序列也進(jìn)行了預(yù)測(cè)。第3、5、7、9、11輪的高親和性與高特異性核酸適配體的分率分別是0.23、0.41、0.61、0.64、0.87,預(yù)測(cè)結(jié)果符合SELEX篩選的適配體進(jìn)行規(guī)律。 

【文章來(lái)源】：分析科學(xué)學(xué)報(bào). 2020,36(01)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【文章目錄】：
1 實(shí)驗(yàn)部分
    1.1 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)
    1.2 分子參數(shù)計(jì)算
2 結(jié)果和討論
    2.1 分類模型建立
    2.2 模型參數(shù)討論
    2.3 分類模型討論
3 結(jié)論



本文編號(hào)：3038260