第一部分:糖尿病腎病關(guān)鍵ce RNA網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建分析及驗(yàn)證目的檢測(cè)糖尿病腎病小鼠差異表達(dá)的m RNA與lncRNA,構(gòu)建糖尿病腎病關(guān)鍵ce RNA相互作用網(wǎng)絡(luò);篩選可能參與糖尿病腎病系膜增生的關(guān)鍵ce RNA對(duì)。方法通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù),獲得在糖尿病腎病小鼠腎臟組織中差異表達(dá)的m RNA及l(fā)ncRNA;通過(guò)Bio Mart去除在ENSEMBLE數(shù)據(jù)庫(kù)中未收錄的RNA;通過(guò)Mi Randa及Star Base數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)糖尿病腎病lncRNA-miRNA-m RNA相互作用網(wǎng)絡(luò);利用hypergeometric test構(gòu)建糖尿病腎病差異ce RNA網(wǎng)絡(luò)、KEGG及GO分析差異ce RNA網(wǎng)絡(luò);分析中心性參數(shù)（Degree和betweenness）,構(gòu)建糖尿病腎病關(guān)鍵ce RNA網(wǎng)絡(luò);應(yīng)用q RT-PCR檢測(cè)關(guān)鍵ce RNA網(wǎng)絡(luò)在糖尿病腎病小鼠腎臟組織及高低糖培養(yǎng)系膜細(xì)胞中的表達(dá)。結(jié)果應(yīng)用二代測(cè)序技術(shù),得到差異表達(dá)m RNA及l(fā)ncRNA,通過(guò)hypergeometric test保留了具有顯著共享關(guān)系的相互作用對(duì),在前15%的degree與betweenness的交集有中3個(gè)lncRNA和5個(gè)... 

【文章來(lái)源】：重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市

【文章頁(yè)數(shù)】：73 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

RNA-seq檢測(cè)正常小鼠和糖尿病腎病模型小鼠腎臟組織差異mRNAs和lncRNAs

構(gòu)建DN差異ceRNA網(wǎng)絡(luò)Fig1.2ConstructionofceRNAnetworkofDN

圖 1.3 DN ceRNA 核心網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建Fig1.3 Construction of key ceRNAnetwork of DNAGO and KEGG pathway analysis of mRNAs in the DN-related ceRNAnetwork (adjusted q<0.05). B The centrality analysis of the DN-related ceRNAnetwork with the high topologicalfeatures-degree and betweenness. C The predicted interaction among with 5 both high degree andbetweenness RNAs and their shared miRNAs.3.4 驗(yàn)證糖尿病腎病關(guān)鍵 ceRNA 網(wǎng)絡(luò)分子在 DN 腎臟組織與細(xì)胞中表達(dá)進(jìn)一步，我們運(yùn)用 qRT-PCR 驗(yàn)證核心網(wǎng)絡(luò) ceRNA 分子（H2k2, Gm10073,Gm19963, Trim11, Ormdl3）在 DN 及對(duì)照小鼠腎臟組織的表達(dá)情況。結(jié)果顯示，H2k2, Gm10073, Trim11 和 Ormdl3 表達(dá)趨勢(shì)與 RNA-seq 結(jié)果一致（圖 1.4 和


本文編號(hào)：2946529