【摘要】：目的:歸納分析膀胱癌易感基因的相關(guān)文獻(xiàn),并進(jìn)行生物信息學(xué)分析,為進(jìn)一步的研究提供參考依據(jù)。方法:檢索Pubmed、中國知網(wǎng)、萬方三大數(shù)據(jù)庫2006年1月1日-2015年12月31日發(fā)表的文獻(xiàn),摘錄膀胱癌易感基因并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果:共檢索有效文獻(xiàn)405篇,摘錄膀胱癌相關(guān)易感基因188個(gè),不同分級(jí)的基因本體論(GO)分類201種,京都基因與基因組百科全書數(shù)據(jù)庫(KEGG)通路7種。GO分類這些基因主要與細(xì)胞損傷修復(fù)、免疫反應(yīng)、細(xì)胞周期調(diào)節(jié)、炎性反應(yīng)、DNA損傷修復(fù)、凋亡和抗原遞呈等有關(guān)。KEGG通路主要是參與細(xì)胞受體相互作用、細(xì)胞凋亡、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、氨基酸和脂肪酸代謝等。在線STRING軟件構(gòu)建其中166個(gè)可翻譯成蛋白的蛋白與蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖,提示這些基因的表達(dá)產(chǎn)物大部分存在密切的相互關(guān)系。進(jìn)一步運(yùn)用Cytoscape軟件將STRING軟件所構(gòu)建的蛋白網(wǎng)絡(luò)圖可視化及量化,篩選出TP53、MTHFR、IL6、CDKN2A、GSTP1共5個(gè)基因。結(jié)論:通過對膀胱癌易感基因的生物分析研究,TP53、MTHFR、IL6、CDKN2A、GSTP1共5個(gè)基因可能為膀胱癌易感關(guān)鍵基因。

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1 張新濤;前列腺干細(xì)胞抗原（PSCA）基因rs2294008多態(tài)性與膀胱癌易感性的關(guān)聯(lián)研究[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2017年

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本文編號(hào)：2554906