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DDX39在腎透明細(xì)胞癌增殖、轉(zhuǎn)移中的作用及臨床預(yù)后相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2019-09-12 18:32
【摘要】:[目的]DDX39是RNA解旋酶DEAD-Box家族成員之一,它在體內(nèi)通過(guò)調(diào)節(jié)基因表達(dá)和RNA代謝來(lái)發(fā)揮識(shí)別天然免疫功能、調(diào)節(jié)胞內(nèi)信號(hào)通路、RNA轉(zhuǎn)錄與剪切以及調(diào)控核內(nèi)表觀遺傳學(xué)等重要作用。而在不同腫瘤的調(diào)控過(guò)程中DDX39可以發(fā)揮抑癌或者促癌作用。DDX3 9在腎透明細(xì)胞癌(Clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)中發(fā)揮的功能以及與患者臨床預(yù)后相關(guān)性尚需要進(jìn)一步研究。通過(guò)我們的研究將為腎癌增殖轉(zhuǎn)移的形成提供新的理論依據(jù),為腎癌治療尋找新的基因靶點(diǎn),并且探索一種可以預(yù)測(cè)腎癌患者療效和預(yù)后的新型分子標(biāo)志物。[研究方法]1、通過(guò)Oncomine生物信息數(shù)據(jù)庫(kù),初步驗(yàn)證DDX39在腎透明細(xì)胞癌中的表達(dá)以及與預(yù)后關(guān)系。采用實(shí)時(shí)定量PCR(Real-time PCR,RT-PCR)和蛋白免疫印跡(Western-blot)技術(shù)進(jìn)一步驗(yàn)證腎透明細(xì)胞癌的癌旁組織與癌組織、腎癌細(xì)胞株與正常腎小管上皮細(xì)胞株之間mRNA及蛋白表達(dá)的差異性。2.免疫組化染色腎透明細(xì)胞癌組織芯片,分析DDX39在腎透明細(xì)胞癌中的表達(dá)與患者預(yù)后相關(guān)性。3、利用siRNA (small interfering RNA)干擾和質(zhì)粒轉(zhuǎn)染技術(shù),分別敲低和過(guò)表達(dá)腎癌細(xì)胞株中的DDX39,通過(guò)RT-PCR和Western-blot驗(yàn)證干擾和轉(zhuǎn)染效率,最終構(gòu)建DDX39低表達(dá)和過(guò)表達(dá)的腎癌細(xì)胞株。采用CCK8法增殖實(shí)驗(yàn)、平板克隆實(shí)驗(yàn)、Transwell細(xì)胞遷移實(shí)驗(yàn)、細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn)等來(lái)驗(yàn)證DDX39低表達(dá)和過(guò)表達(dá)時(shí)腎癌細(xì)胞株的增殖、轉(zhuǎn)移能力。[結(jié)果]1、通過(guò)Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)檢索分析以及標(biāo)本驗(yàn)證,結(jié)果顯示DDX39在腎透明細(xì)胞癌中呈高表達(dá),癌旁組織與癌組織、腎癌細(xì)胞株與正常腎小管上皮細(xì)胞株之間DDX39表達(dá)差異明顯。2.DDX39表達(dá)量與腫瘤的大小、TNM分期以及遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移相關(guān),單因素和多因素分析DDX39表達(dá)量與腎癌患者總生存期和無(wú)病生存期預(yù)后關(guān)系,DDX39可以作為腎癌預(yù)后獨(dú)立的預(yù)測(cè)因子,其表達(dá)量越高患者預(yù)后越差。3.用siRNA干擾技術(shù)和質(zhì)粒轉(zhuǎn)染技術(shù)可以有效的敲低和過(guò)表達(dá)腎癌細(xì)胞株中DDX39。體外細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,腎癌細(xì)胞株敲低DDX39后,細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移能力被抑制,而過(guò)表達(dá)DDX39后,腎癌細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移能力增強(qiáng)。[結(jié)論]DDX39在腎透明細(xì)胞癌中呈現(xiàn)原癌基因的特性,可以促進(jìn)腫瘤增殖和轉(zhuǎn)移。DDX39有望成為預(yù)測(cè)腎癌預(yù)后的新型分子標(biāo)志物以及成為腎癌基因靶向治療的新靶點(diǎn)。
【圖文】:

分析結(jié)果圖,表達(dá)差異,腎組織


圖1-1邋DDX39邋mRNA在腎癌組織與正常腎組織間表達(dá)差異的Mata分析結(jié)果,逡逑p邋?

逆轉(zhuǎn)錄,標(biāo)本,癌組織,表達(dá)水平


The邋rank邋for邋a邋gene邋is邋the邋median邋rank邋for邋that邋eene邋across邋each邋of邋the邋analyses.逡逑The邋p-Value邋for邋a邋gene邋is邋its邋p-Value邋for邋the邋median-ranked邋analysis.逡逑圖1-1邋DDX39邋mRNA在腎癌組織與正常腎組織間表達(dá)差異的Mata分析結(jié)果,逡逑p邋<0?邋001逡逑2.從Oncomme數(shù)據(jù)庫(kù)中共獲得72例透明細(xì)胞癌標(biāo)本的臨床信息,根據(jù)DDX39樣本逡逑中的mRNA表達(dá)量高低分成DDX39高表達(dá)組(高于中位表達(dá)量,n=36)和DDX39低表逡逑達(dá)組(低于中位表達(dá)量,n邋=邋36)。利用Kaplan-Meier生存分析法對(duì)比DDX39高表達(dá)組與逡逑低表達(dá)組生存差異,雖然結(jié)果沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.071),,但是從生存曲線可以看出逡逑DDX39高表達(dá)組較低表達(dá)組有著更差的預(yù)后趨勢(shì)。逡逑_邋100-kw..J?U)|邋Low邋DDX39逡逑嘗邐*-1,邐i-u*。,邋n=36逡逑I邐‘■?邋?邋?邋?邋L邋L邋—邋—邋—?逡逑3邐1邋邐邐u ̄逡逑=50-邐n=36邐——-逡逑2邐High邋DDX39逡逑0逡逑>逡逑°邐p=0.071逡逑0-l邐1邐1邐1邐1逡逑0邐1000邐2000邐3000邐4000逡逑Followup邋Time(Days)逡逑圖1-2邐Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)DDX39高表達(dá)組與低表達(dá)組間總體生存期差異
【學(xué)位授予單位】:第二軍醫(yī)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R737.11

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本文編號(hào):2535288

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