【摘要】:研究背景:很久以來,精子被認(rèn)為只是運(yùn)送DNA進(jìn)入卵細(xì)胞,而其他組分例如RNA分子只是殘留物、不具有生理功能。近年來的研究進(jìn)展表明,成熟精子中RNA分子可以通過受精方式傳遞給子代、參與調(diào)節(jié)受精卵和胚胎的發(fā)育。精子RNA可分為mRNA(message RNA,信使RNA)和ncRNA(non-coding RNA,非編碼RNA)。迄今,通過microarray和RT-PCR等方法,眾多的mRNAs和長(zhǎng)度小于200個(gè)核苷酸的小ncRNAs已在人和其他哺乳動(dòng)物精子中得到鑒定。然而,哺乳動(dòng)物尤其是人的成熟精子是否存在長(zhǎng)度大于200核苷酸的長(zhǎng)非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)、及其可能的功能還遠(yuǎn)未闡明。lncRNA是近年來發(fā)現(xiàn)的一類具有表觀遺傳調(diào)控功能的重要生物大分子,與染色質(zhì)調(diào)控蛋白、RNA結(jié)合蛋白、小RNA等相互作用形成功能復(fù)合體,調(diào)控多個(gè)重要生命過程。例如,已有研究表明睪丸特異性lncRNA對(duì)于雄性生殖至關(guān)重要、關(guān)鍵lncRNA的缺失會(huì)導(dǎo)致雄性不育,提示lncRNA分子異?赡芘c男性不育密切相關(guān)。男性不育已成為嚴(yán)重影響國(guó)民身心健康的重大疾病,其中以精子運(yùn)動(dòng)能力低下為主要特征的弱精癥占相當(dāng)大的比例,但相關(guān)的病因機(jī)制有待闡明。結(jié)合上述領(lǐng)域內(nèi)研究熱點(diǎn)以及臨床需要,本研究擬回答:人成熟精子中是否存在lncRNA,它的表達(dá)譜是如何?如果人成熟精子內(nèi)存在lncRNA,那么它是否與弱精癥存在相關(guān)性呢,是否導(dǎo)致男性不育的重要因子?通過研究分析lncRNA在人成熟精子中的表達(dá)譜,驗(yàn)證并篩選出一些與弱精癥有相關(guān)性的lncRNA,本課題期待為揭示弱精癥的病因提供科學(xué)依據(jù)、為男性不育的發(fā)病機(jī)制提供新線索。研究方法:收集精子樣本共84例,其中包括36例弱精患者的精子,隨機(jī)12個(gè)捐助者的樣本混勻后均分成三份;48例正常的精子樣本,隨機(jī)12個(gè)捐助者的樣本混勻后均成四份。混合樣品純化后分離提取總RNA,并檢測(cè)其純度和質(zhì)量,最后篩選7個(gè)混合樣品,編號(hào)分別為:NS-1,NS-2,NS-3,NS-4,ATNZ-1,ATNZ-2,ATNZ-3。通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,得到lncRNA在人成熟精子中的表達(dá)情況,并篩選出差異表達(dá)顯著lncRNAs(Fold-change2.0,P0.01)。利用GO分析(Gene Ontology,基因本體論)和KEGG通路分析進(jìn)一步研究。我們通過RT-PCR和熒光原位雜交(FISH)證實(shí)lncRNA轉(zhuǎn)錄物在人成熟精子中的存在。利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(QPCR)進(jìn)行大樣本量驗(yàn)證精子睪丸特異性且差異表達(dá)顯著的lncRNAs。正常組和弱精癥組lncRNAs表達(dá)水平的比較采用Mann-Whitney和雙樣本Kolmogorov-Smirnov兩種非參數(shù)檢驗(yàn)。分析差異表達(dá)lnc RNAs與弱精癥的前向運(yùn)動(dòng)精子率(PR%)之間的相關(guān)性。同時(shí)構(gòu)建出lncRNA與mRNA的共表達(dá)分析網(wǎng)絡(luò),分析預(yù)測(cè)這些差異表達(dá)的lncRNAs的功能和可能的致病機(jī)制。研究結(jié)果:1.在人成熟精子中鑒定了know lncRNA有38,307個(gè)和novel lncRNA有27,472個(gè),并且通過RT-PCR和熒光原位雜交(FISH)在2個(gè)代表性的lncRNA上證實(shí)了lncRNA轉(zhuǎn)錄物的存在。2.正常精子(NS)組和弱精癥(ATNZ)組中,共有2768個(gè)lncRNAs差異表達(dá)(Fold-change2.0,P0.01),其中2445個(gè)lncRNAs表達(dá)上調(diào),323個(gè)lncRNAs表達(dá)下調(diào);共有615個(gè)mRNAs差異表達(dá),其中393個(gè)mRNAs表達(dá)上調(diào),222個(gè)mRNAs表達(dá)下調(diào)。3.GO分析顯示,將mRNA分成3類:生物學(xué)過程類(biological process)、細(xì)胞組分類(cellular component)、分子功能類(molecular function)。其中參與生物過程類基因顯著富集(P0.01),包括:蛋白激酶C-激活,G蛋白偶聯(lián)受體信號(hào)通路,肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架組織,RNA代謝過程的調(diào)節(jié),基于肌動(dòng)蛋白絲的過程和細(xì)胞連接組裝。KEGG通路分析顯示,差異表達(dá)的mRNA參與cGMP-PKG信號(hào)通路,NOD樣受體信號(hào)通路,細(xì)胞凋亡等。4.NS組和ATNZ組中,預(yù)測(cè)出差異表達(dá)lncRNA的順式調(diào)控(編碼基因的上游10 kbp序列和lncRNA的下游100 kbp序列)和反式調(diào)控(自由能小于-30kj/mol)的靶基因。結(jié)果顯示,找到lncRNA的靶基因mRNA有13131個(gè)。其GO富集分析表明,這些靶基因參與的生物過程包括:細(xì)胞器官組織,RNA轉(zhuǎn)運(yùn),RNA代謝過程,參與形態(tài)發(fā)生的細(xì)胞成分裝配,肌原纖維組裝,肌動(dòng)蛋白結(jié)構(gòu)組織,肌動(dòng)蛋白絲重組等過程。KEGG通路分析顯示,差異表達(dá)的lncRNA靶基因參與包括蛋白質(zhì)消化吸收,RNA轉(zhuǎn)運(yùn),肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架調(diào)節(jié),PI3K-Akt信號(hào)通路等途徑。5.篩選得到睪丸精子特異性的lncRNA有48個(gè)。進(jìn)行熒光定量PCR分別進(jìn)行驗(yàn)證,最后得到只有5個(gè)精子睪丸特異表達(dá)的lncRNA,分別為:NONHSAG032058、NONHSAG009522、NONHSAG072018、LXLOC_098487、LXLOC_077183。臨床大樣本(51個(gè)正常樣本和51個(gè)弱精樣本)進(jìn)行qRT-PCR實(shí)驗(yàn)證明,在睪丸精子特異性表達(dá)的LXLOC_098487,NONHSAG009522,NONHSAG072018,NONHSAG032058在弱精癥患者中同時(shí)增加,與測(cè)序結(jié)果相同,表明它們可能共同涉及在調(diào)節(jié)成熟精子功能。6.結(jié)合上述結(jié)果5,LXLOC_098487在弱精癥組和正常組中的表達(dá)水平存在顯著性差異(非參數(shù)檢驗(yàn)Mann-Whitney,P=0.011;非參數(shù)檢驗(yàn)Kolmogorov-Smirnov,P=0.033);NONHSAG009522在弱精癥組和正常組中的表達(dá)水平存在顯著性差異(非參數(shù)檢驗(yàn)Mann-Whitney,P0.001;非參數(shù)檢驗(yàn)Kolmogorov-Smirnov,P0.001);NONHSAG072018在弱精癥組和正常組中的表達(dá)水平存在顯著性差異(非參數(shù)檢驗(yàn)Mann-Whitney,P0.001;非參數(shù)檢驗(yàn)Kolmogorov-Smirnov,P0.001);NONHSAG032058在弱精癥組和正常組中的表達(dá)水平存在顯著性差異(非參數(shù)檢驗(yàn)Mann-Whitney,P=0.030;非參數(shù)檢驗(yàn)Kolmogorov-Smirnov,P=0.037);分析臨床精子樣本中4條lncRNAs和精液基本參數(shù)的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)4個(gè)lncRNAs的表達(dá)水平和前向運(yùn)動(dòng)精子率(Progressive motility,PR,%)無相關(guān)性。7.組織特異性且差異表達(dá)lncRNA:NONHSAG072018,其靶基因?yàn)?NM_001145204(Shisa9)與通道蛋白有關(guān),可能多層次參與調(diào)控通道蛋白的靶基因,并在其中扮演重要的角色。組織特異性且差異表達(dá)NONHSAG009522,NM_015423(AASDHPPT)參與氨基酸合成,泛酸代謝,線粒體代謝等。結(jié)論:1.本研究證實(shí)人成熟精子中存在lncRNAs,以及構(gòu)建人成熟精子lncRNAs表達(dá)譜。該結(jié)果豐富人成熟精子中的RNA類型,為精子RNA功能的深入研究以及對(duì)男性不育等相關(guān)領(lǐng)域產(chǎn)生促進(jìn)作用。2.以上結(jié)果顯示,本研究初步篩選,并鑒定得到5個(gè)精子睪丸特異性且差異表達(dá)lncRNAs,與正常組相比,其中有4個(gè)lncRNAs在弱精中表達(dá)水平均呈上調(diào)趨勢(shì),符合測(cè)序結(jié)果。目前驗(yàn)證的5條候選lncRNAs初步證明與弱精癥PR值無相關(guān)性,但是差異分析顯示,弱精人群和正常人群之間是存在顯著差異,表明lncRNA可能是弱精癥的一個(gè)貢獻(xiàn)因素。由于涉及的樣本量相對(duì)較小,因此得出的結(jié)果需要可靠的,豐富的臨床大樣本及找到更正確的實(shí)驗(yàn)和統(tǒng)計(jì)分析進(jìn)一步來進(jìn)行驗(yàn)證。對(duì)5條候選lncRNAs進(jìn)行RNA-PLEX軟件預(yù)測(cè)出相對(duì)應(yīng)的靶基因,最終其中只有兩條找出靶基因,并進(jìn)行GO分析和KEGG分析顯示,可能多層次參與調(diào)控通道蛋白的靶基因,參與氨基酸合成,泛酸代謝,線粒體代謝等,并在其中扮演重要的角色。該結(jié)果為闡釋弱精癥的分子機(jī)制提供了實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ),對(duì)精子發(fā)生和精子功能調(diào)節(jié)的研究具有重要的理論意義。因此,它們很有可能成為“弱精癥相關(guān)分子標(biāo)志群”中的新一員以發(fā)揮其臨床價(jià)值。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:南昌大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R698.2
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