基于誘導(dǎo)多潛能干細(xì)胞的Alport綜合征蛋白質(zhì)組學(xué)的生物信息
本文關(guān)鍵詞: Alport綜合征 iPSCs GO富集 KEGG通路 出處:《暨南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)與醫(yī)學(xué)版)》2015年02期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的:探討Alport綜合征(AS)差異性表達(dá)蛋白質(zhì)主要參與的GO富集分析和KEGG通路,為AS的進(jìn)一步機(jī)制研究奠定基礎(chǔ).方法:10例AS患者與10例健康對照者(NC)作為實(shí)驗(yàn)對象.分別收集實(shí)驗(yàn)參與者尿液200 m L,并從尿液中分離尿腎臟管細(xì)胞,將尿腎臟管細(xì)胞誘導(dǎo)分化成多潛能干細(xì)胞(i PSCs),運(yùn)用i TRAQ技術(shù)找出2組之間差異性表達(dá)蛋白質(zhì),對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析.結(jié)果:在2組樣本中發(fā)現(xiàn)35種蛋白質(zhì)具有差異性表達(dá),包括18種上調(diào)與17種下調(diào).差異性表達(dá)蛋白質(zhì)GO富集主要聚集在細(xì)胞分子、細(xì)胞組成與細(xì)胞生物學(xué)過程.嘌呤代謝通路與絲裂原激活的蛋白激酶是主要的KEGG信號傳導(dǎo)通路.結(jié)論:差異性表達(dá)蛋白質(zhì)的生物信息學(xué)有助于AS發(fā)病機(jī)制研究,可作為機(jī)制研究參考和補(bǔ)充.
[Abstract]:Objective: to investigate the differential expression of protein in Alport syndrome, which is mainly involved in go enrichment analysis and KEGG pathway. Methods 10 patients with as and 10 healthy controls (n = 10) were selected as subjects. Urine samples of 200 mL urine were collected from participants, and renal catheterization cells were isolated from urine. Urinary renal tubular cells were induced to differentiate into multipotent stem cells. The differential expression proteins were identified by I TRAQ technique and analyzed by bioinformatics. Results: 35 proteins were found to be differentially expressed in two groups of samples. There are 18 upregulation and 17 down-regulation. Cell composition and cell biological process. Purine metabolic pathway and mitogen-activated protein kinase are the main KEGG signal transduction pathways. Conclusion: bioinformatics of differentially expressed proteins may contribute to the study of pathogenesis of as. It can be used as a reference and supplement for mechanism research.
【作者單位】: 暨南大學(xué)附屬第二醫(yī)院深圳市人民醫(yī)院臨床醫(yī)學(xué)研究中心;深圳市第三人民醫(yī)院腎臟內(nèi)科;廣東醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)研究所;
【基金】:深圳市知識創(chuàng)新計(jì)劃項(xiàng)目(JCYJ20140416122812045)
【分類號】:R692.3
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
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,本文編號:1542425
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