烏魯木齊市3~5歲兒童口腔微生物與腸道微生物的構(gòu)成差異
發(fā)布時(shí)間:2024-12-07 04:52
目的探索烏魯木齊市3~5歲兒童口腔微生物與腸道微生物的菌群構(gòu)成及多樣性等差異。方法從本團(tuán)隊(duì)前期流行病學(xué)調(diào)查的烏魯木齊市3~5歲兒童中,按調(diào)查時(shí)間順序隨機(jī)抽取12名兒童。分別收集唾液及糞便樣本共計(jì)24份,分為口腔微生物組和腸道微生物組。利用16S V3-V4區(qū)設(shè)計(jì)引物來(lái)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,使用MiSeq測(cè)序儀進(jìn)行二代測(cè)序,比較兩組的微生物構(gòu)成及多樣性差異。結(jié)果門水平上:放線菌門(t=5.98,P<0.001)、變形菌門(z=20.0,P=0.005)、TM7(z=78.0,P<0.001)在口腔中豐度較高;厚壁菌門(z=134.0,P<0.001)在腸道中豐度較高。厚壁菌門/擬桿菌門的值在腸道中較大(z=113.0,P=0.017)。屬水平上:羅斯菌屬、普雷沃菌屬、鏈球菌屬為口腔中豐度較高的菌屬;糞桿菌屬、Ruminococcaceae、擬桿菌屬為腸道中豐度較高的菌屬(P<0.001)。奈瑟菌屬、卟啉單胞菌屬等僅存在于口腔中。Catenibacterium、腸桿菌屬等僅存在于腸道中。菌群功能顯示:在細(xì)胞運(yùn)動(dòng)(z=136.0,P<0.001)、碳水化合物代謝(t=...
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【文章目錄】:
1 對(duì)象與方法
1.1 研究對(duì)象
1.2 唾液采集
1.3 糞便采集
1.4 DNA提取及PCR擴(kuò)增
1.5 測(cè)序文庫(kù)制備及高通量測(cè)序
1.6 生物信息學(xué)分析
1.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié) 果
2.1 測(cè)序長(zhǎng)度分布統(tǒng)計(jì)
2.2 OTU劃分和分類地位鑒定
2.3 Alpha多樣性分析
2.4 Beta多樣性分析
2.5 組間分類學(xué)組成及差異性分析
2.6 優(yōu)勢(shì)菌屬的關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)分析
2.7 菌群代謝功能預(yù)測(cè)
3 討 論
3.1 口腔微生物與腸道微生物的選擇
3.2 口腔微生物與腸道微生物的相關(guān)性
3.3 口腔及腸道中菌屬分布特異性差異分析
3.4 口腔及腸道微生物與全身系統(tǒng)性疾病相關(guān)性
3.5 不足與展望
本文編號(hào):4014832
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【文章目錄】:
1 對(duì)象與方法
1.1 研究對(duì)象
1.2 唾液采集
1.3 糞便采集
1.4 DNA提取及PCR擴(kuò)增
1.5 測(cè)序文庫(kù)制備及高通量測(cè)序
1.6 生物信息學(xué)分析
1.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié) 果
2.1 測(cè)序長(zhǎng)度分布統(tǒng)計(jì)
2.2 OTU劃分和分類地位鑒定
2.3 Alpha多樣性分析
2.4 Beta多樣性分析
2.5 組間分類學(xué)組成及差異性分析
2.6 優(yōu)勢(shì)菌屬的關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)分析
2.7 菌群代謝功能預(yù)測(cè)
3 討 論
3.1 口腔微生物與腸道微生物的選擇
3.2 口腔微生物與腸道微生物的相關(guān)性
3.3 口腔及腸道中菌屬分布特異性差異分析
3.4 口腔及腸道微生物與全身系統(tǒng)性疾病相關(guān)性
3.5 不足與展望
本文編號(hào):4014832
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