目的:本研究旨在篩選重度抑郁癥(MDD)的外周血潛在診斷標志物。方法:首先,從GEO數(shù)據庫下載基因表達譜數(shù)據集GSE32280。通過R軟件篩選MDD與正常對照外周血樣本的差異表達基因(DEGs)。對篩選出來的DEGs進行GO功能注釋以及KEGG通路富集分析;然后,采用Cytoscape軟件構建蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)網絡,并從中篩選出關鍵(hub)基因。采用R軟件對hub基因進行ROC分析,進而鑒定出具有診斷價值的hub基因。結果:從GSE32280數(shù)據集中共篩選出104個DEGs,其中上調基因47個,下調基因57個。GO功能注釋顯示,104個DEGs主要涉及細胞增殖、炎癥反應、轉運調控等功能。KEGG通路富集分析結果顯示,DEGs主要富集在NK細胞介導的細胞毒性、細胞因子與其受體相互作用和趨化因子信號通路。從PPI網絡中獲取16個hub基因。對hub基因進行ROC分析結果顯示,CXCL1、EGF、IFNG和CXCL8在MDD中具有較高的診斷價值。結論:CXCL1、EGF、IFNG和CXCL8是MDD重要的診斷標志物。

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 下載獲取數(shù)據集
    1.2 DEGs鑒定
    1.3 DEGs的功能注釋和通路富集分析
    1.4 構建PPI網絡并鑒定hub基因
    1.5 診斷生物標記物篩選
    1.6 統(tǒng)計分析
2 結果
    2.1 明確DEGs
    2.2 GO功能注釋和KEGG通路富集分析
    2.3 MDD相關通路及基因的GSEA富集分析
    2.4 構建PPI網絡及選擇hub基因
    2.5 明確MDD診斷標記物
3 討論



本文編號：4018070