骨骼肌轉(zhuǎn)錄組與蛋白組聯(lián)合分析巴馬小型豬T2DM的發(fā)病機制
發(fā)布時間:2021-04-27 09:35
2型糖尿。═2DM)是一種受多因素影響的復雜代謝性疾病。多種組學聯(lián)合分析方法為T2DM發(fā)病機制探索、疾病早期診斷和動物疾病模型制作等方面研究提供新的解決方案。本試驗通過構建廣西巴馬小型豬T2DM發(fā)病模型和未發(fā)病模型,利用RNA-seq和iTRAQ技術進行模型肌肉組織轉(zhuǎn)錄組學和蛋白組學分析,以探討巴馬小型豬T2DM的發(fā)病機制,為系統(tǒng)地從生物學角度進行T2DM的研究提供新的思路。本試驗選取年齡相似(6-7月齡)、體重相近(20公斤左右)廣西巴馬小型豬40頭(母豬18頭和去勢公豬22頭)。隨機選取9頭作為對照組(CON)和31頭作為試驗組。對照組飼喂基礎飼料,試驗組飼喂高脂高糖飼料(由60%基礎飼料、35%蔗糖和5%豬油組成)。高脂高糖飼料飼養(yǎng)巴馬小型豬12個月后,試驗組篩選出6頭多次出現(xiàn)血糖和靜脈葡萄糖耐量試驗(IVGTT)表現(xiàn)異常的小型豬作為發(fā)病組(T2D),6頭血糖和IVGTT表現(xiàn)正常的小型豬作為未發(fā)病組(NT2D),并利用RNA-seq技術和iTRAQ技術對巴馬小型豬背最長肌進行轉(zhuǎn)錄組測序和蛋白組學分析。主要試驗研究結(jié)果如下:1、廣西巴馬小型豬T2DM模型制作與NT2D個體相比,T...
【文章來源】:廣西大學廣西壯族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:162 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
關鍵縮略詞中英文對照表
第一章 綜述
1 巴馬小型豬疾病模型的發(fā)展和應用
1.1 巴馬小型豬疾病模型在醫(yī)學領域中的應用
1.2 巴馬小型豬T2DM疾病模型的建立和應用
2 生物組學技術的發(fā)展和應用
2.1 轉(zhuǎn)錄組學的發(fā)展和應用
2.2 蛋白組學的發(fā)展和應用
3 影響T2DM發(fā)生發(fā)展的信號通路研究進展
3.1 糖原合成和葡萄糖氧化代謝與T2DM的關系
3.2 胰島素信號傳導通路與T2DM的關系
3.3 脂肪酸氧化代謝信號通路與T2DM的關系
3.4 線粒體功能相關信號通路與T2DM的關系
3.5 氧化應激與T2DM的關系
3.6 炎癥反應信號通路與T2DM的關系
3.7 肌纖維類型轉(zhuǎn)化信號通路與T2DM的關系
3.8 運動與T2DM的關系
4 研究目的及意義
第二章 廣西巴馬小型豬T2DM模型的制作
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
2 結(jié)果與分析
2.1 體重及器官相關指標變化
2.2 相關生理生化指標測定及靜脈葡萄糖耐量試驗結(jié)果分析
2.3 組織切片觀察
3 討論
4 小結(jié)
第三章 T2DM巴馬小型豬骨骼肌轉(zhuǎn)錄組測序分析
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
2 結(jié)果與分析
2.1 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
2.2 qPCR驗證結(jié)果
2.3 T2DM巴馬小型豬與人T2DM患者骨骼肌轉(zhuǎn)錄組比較分析
3 討論
4 小結(jié)
第四章 T2D與NT2D巴馬小型豬蛋白質(zhì)組差異分析
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
2 結(jié)果與分析
2.1 TRAQ結(jié)果分析
2.2 PRM結(jié)果分析
2.3 蛋白組與轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析
3 討論
4 小結(jié)
第五章 CSRP3基因在T2DM發(fā)病機制中的作用研究
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
2 結(jié)果與分析
2.1 巴馬小型豬CSRP3基因真核表達載體構建與生物信息學分析
2.2 CSRP3基因骨骼肌表達作用分析
2.3 CSRP3基因功能細胞驗證
3 討論
4 小結(jié)
第六章 結(jié)論和創(chuàng)新點
1 結(jié)論
2 創(chuàng)新點
參考文獻
附錄
致謝
攻讀學位期間發(fā)表論文情況
本文編號:3163228
【文章來源】:廣西大學廣西壯族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:162 頁
【學位級別】:博士
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摘要
ABSTRACT
關鍵縮略詞中英文對照表
第一章 綜述
1 巴馬小型豬疾病模型的發(fā)展和應用
1.1 巴馬小型豬疾病模型在醫(yī)學領域中的應用
1.2 巴馬小型豬T2DM疾病模型的建立和應用
2 生物組學技術的發(fā)展和應用
2.1 轉(zhuǎn)錄組學的發(fā)展和應用
2.2 蛋白組學的發(fā)展和應用
3 影響T2DM發(fā)生發(fā)展的信號通路研究進展
3.1 糖原合成和葡萄糖氧化代謝與T2DM的關系
3.2 胰島素信號傳導通路與T2DM的關系
3.3 脂肪酸氧化代謝信號通路與T2DM的關系
3.4 線粒體功能相關信號通路與T2DM的關系
3.5 氧化應激與T2DM的關系
3.6 炎癥反應信號通路與T2DM的關系
3.7 肌纖維類型轉(zhuǎn)化信號通路與T2DM的關系
3.8 運動與T2DM的關系
4 研究目的及意義
第二章 廣西巴馬小型豬T2DM模型的制作
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
2 結(jié)果與分析
2.1 體重及器官相關指標變化
2.2 相關生理生化指標測定及靜脈葡萄糖耐量試驗結(jié)果分析
2.3 組織切片觀察
3 討論
4 小結(jié)
第三章 T2DM巴馬小型豬骨骼肌轉(zhuǎn)錄組測序分析
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
2 結(jié)果與分析
2.1 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
2.2 qPCR驗證結(jié)果
2.3 T2DM巴馬小型豬與人T2DM患者骨骼肌轉(zhuǎn)錄組比較分析
3 討論
4 小結(jié)
第四章 T2D與NT2D巴馬小型豬蛋白質(zhì)組差異分析
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
2 結(jié)果與分析
2.1 TRAQ結(jié)果分析
2.2 PRM結(jié)果分析
2.3 蛋白組與轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析
3 討論
4 小結(jié)
第五章 CSRP3基因在T2DM發(fā)病機制中的作用研究
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
2 結(jié)果與分析
2.1 巴馬小型豬CSRP3基因真核表達載體構建與生物信息學分析
2.2 CSRP3基因骨骼肌表達作用分析
2.3 CSRP3基因功能細胞驗證
3 討論
4 小結(jié)
第六章 結(jié)論和創(chuàng)新點
1 結(jié)論
2 創(chuàng)新點
參考文獻
附錄
致謝
攻讀學位期間發(fā)表論文情況
本文編號:3163228
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