α-L-巖藻糖甘酶1基因在小鼠不同組織中的表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-04-18 03:59
為了研究不同組織中α-L-巖藻糖苷酶1 (α-L-fucosidase1, FUCA1)特異性表達(dá)的調(diào)節(jié)機(jī)制,運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(real-time quantitative PCR, qPCR)和蛋白免疫印跡(Western Blot)在mRNA水平和蛋白水平上分析了Fuca1基因在小鼠成體不同組織中的表達(dá)特點(diǎn),還利用Clustal Omega分析了氨基酸序列在不同物種的同源性和系統(tǒng)進(jìn)化樹。qPCR檢測結(jié)果顯示,Fuca1基因在小鼠不同組織中存在表達(dá)差異,在睪丸中表達(dá)最高,其次是腎臟與卵巢;而Western Blot檢測結(jié)果顯示FUCA1主要在小鼠腎臟和卵巢高表達(dá);對(duì)FUCA1氨基酸序列進(jìn)行同源性分析,結(jié)果顯示FUCA1保守性低。以上研究表明,FUCA1可能與小鼠的組織特異性表達(dá)調(diào)節(jié)有關(guān),其在性腺中的具體表達(dá)機(jī)制還有待研究。
【文章來源】:湖南師范大學(xué)自然科學(xué)學(xué)報(bào). 2020,43(02)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
Fuca1基因在小鼠各組織的mRNA表達(dá)分析
FUCA1在小鼠各組織的蛋白表達(dá)分析
本研究發(fā)現(xiàn),在mRNA水平上,FUCA1在睪丸中表達(dá)最高,在肌肉和肝臟最低;免疫印跡技術(shù)則證實(shí)了FUCA1在小鼠8個(gè)組織都有廣泛的表達(dá),而且最高表達(dá)出現(xiàn)在腎臟而不是睪丸,脾臟和肌肉中出現(xiàn)最低表達(dá),有趣的是,與其相應(yīng)的mRNA上表達(dá)比較,可以發(fā)現(xiàn)并非呈線性關(guān)系。根據(jù)以前中心法則,DNA編碼序列被轉(zhuǎn)錄為mRNA,然后被翻譯為蛋白質(zhì)。盡管蛋白質(zhì)的合成及降解的速率均發(fā)生變化,但蛋白質(zhì)的豐度取決于其mRNA的豐度。此過程涉及許多調(diào)控,大量研究報(bào)告認(rèn)為,兩者之間的相關(guān)性通常較低[17-19]。JAX實(shí)驗(yàn)室研究人員測量來自192個(gè)多樣性近交系小鼠的肝臟中的全基因組轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)表達(dá),推測定量性狀位點(diǎn)(quantitative trait locus, QTL)是靶基因附近的遺傳變異,會(huì)影響其表達(dá),可能QTL會(huì)順式作用并影響轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)水平,遠(yuǎn)端的QTL對(duì)靶基因在反式中的表達(dá)發(fā)揮作用[20]。人們已經(jīng)在酵母和植物中研究了蛋白質(zhì)和轉(zhuǎn)錄水平的一致性,但Anatole等[21]進(jìn)行小鼠比較研究表明,轉(zhuǎn)錄物和蛋白質(zhì)的水平僅與約一半的測試基因顯著相關(guān),平均相關(guān)系數(shù)為0.27。蛋白質(zhì)和轉(zhuǎn)錄本之間的關(guān)系可能部分能用分子事件來解釋,如翻譯效率、選擇性剪接、折疊、組裝成復(fù)合物;轉(zhuǎn)運(yùn)和定位、共價(jià)修飾、分泌和降解等都會(huì)影響蛋白質(zhì)水平,而且與轉(zhuǎn)錄本無關(guān)。本文結(jié)果中睪丸組織的轉(zhuǎn)錄本和蛋白水平表達(dá)不一致,筆者推測是該基因翻譯過程中可能接受一系列的化學(xué)修飾信號(hào),如miRNA,使其蛋白水平下調(diào),翻譯表達(dá)后被部分降解[22,23],還可能是在翻譯后受到磷酸化、硫酸化、泛素化等。圖4 不同物種FUCA1系統(tǒng)進(jìn)化樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]高脂對(duì)中華鱉肝臟組織中microRNA及相關(guān)基因表達(dá)的影響[J]. 劉麗,伍遠(yuǎn)安,李傳武,鄒利,蔣國民,李金龍,王曉清,李玉瓏. 湖南師范大學(xué)自然科學(xué)學(xué)報(bào). 2018(06)
[2]α-L-巖藻糖苷酶基因在斑馬魚發(fā)育過程中的功能分析[J]. 王道,劉文彬,肖亞梅. 生命科學(xué)研究. 2013(04)
[3]黃鱔α-L-巖藻糖苷酶基因克隆及其在雌雄個(gè)體間的表達(dá)分析[J]. 王道,廖高鵬,肖亞梅. 湖南師范大學(xué)自然科學(xué)學(xué)報(bào). 2013(04)
本文編號(hào):3144757
【文章來源】:湖南師范大學(xué)自然科學(xué)學(xué)報(bào). 2020,43(02)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
Fuca1基因在小鼠各組織的mRNA表達(dá)分析
FUCA1在小鼠各組織的蛋白表達(dá)分析
本研究發(fā)現(xiàn),在mRNA水平上,FUCA1在睪丸中表達(dá)最高,在肌肉和肝臟最低;免疫印跡技術(shù)則證實(shí)了FUCA1在小鼠8個(gè)組織都有廣泛的表達(dá),而且最高表達(dá)出現(xiàn)在腎臟而不是睪丸,脾臟和肌肉中出現(xiàn)最低表達(dá),有趣的是,與其相應(yīng)的mRNA上表達(dá)比較,可以發(fā)現(xiàn)并非呈線性關(guān)系。根據(jù)以前中心法則,DNA編碼序列被轉(zhuǎn)錄為mRNA,然后被翻譯為蛋白質(zhì)。盡管蛋白質(zhì)的合成及降解的速率均發(fā)生變化,但蛋白質(zhì)的豐度取決于其mRNA的豐度。此過程涉及許多調(diào)控,大量研究報(bào)告認(rèn)為,兩者之間的相關(guān)性通常較低[17-19]。JAX實(shí)驗(yàn)室研究人員測量來自192個(gè)多樣性近交系小鼠的肝臟中的全基因組轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)表達(dá),推測定量性狀位點(diǎn)(quantitative trait locus, QTL)是靶基因附近的遺傳變異,會(huì)影響其表達(dá),可能QTL會(huì)順式作用并影響轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)水平,遠(yuǎn)端的QTL對(duì)靶基因在反式中的表達(dá)發(fā)揮作用[20]。人們已經(jīng)在酵母和植物中研究了蛋白質(zhì)和轉(zhuǎn)錄水平的一致性,但Anatole等[21]進(jìn)行小鼠比較研究表明,轉(zhuǎn)錄物和蛋白質(zhì)的水平僅與約一半的測試基因顯著相關(guān),平均相關(guān)系數(shù)為0.27。蛋白質(zhì)和轉(zhuǎn)錄本之間的關(guān)系可能部分能用分子事件來解釋,如翻譯效率、選擇性剪接、折疊、組裝成復(fù)合物;轉(zhuǎn)運(yùn)和定位、共價(jià)修飾、分泌和降解等都會(huì)影響蛋白質(zhì)水平,而且與轉(zhuǎn)錄本無關(guān)。本文結(jié)果中睪丸組織的轉(zhuǎn)錄本和蛋白水平表達(dá)不一致,筆者推測是該基因翻譯過程中可能接受一系列的化學(xué)修飾信號(hào),如miRNA,使其蛋白水平下調(diào),翻譯表達(dá)后被部分降解[22,23],還可能是在翻譯后受到磷酸化、硫酸化、泛素化等。圖4 不同物種FUCA1系統(tǒng)進(jìn)化樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]高脂對(duì)中華鱉肝臟組織中microRNA及相關(guān)基因表達(dá)的影響[J]. 劉麗,伍遠(yuǎn)安,李傳武,鄒利,蔣國民,李金龍,王曉清,李玉瓏. 湖南師范大學(xué)自然科學(xué)學(xué)報(bào). 2018(06)
[2]α-L-巖藻糖苷酶基因在斑馬魚發(fā)育過程中的功能分析[J]. 王道,劉文彬,肖亞梅. 生命科學(xué)研究. 2013(04)
[3]黃鱔α-L-巖藻糖苷酶基因克隆及其在雌雄個(gè)體間的表達(dá)分析[J]. 王道,廖高鵬,肖亞梅. 湖南師范大學(xué)自然科學(xué)學(xué)報(bào). 2013(04)
本文編號(hào):3144757
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