發(fā)布時(shí)間：2023-01-08 18:05

　　目的:篩選慢性阻塞性肺疾�。╟hronic obstructive pulmonary disease,COPD）患者外周血單個(gè)核細(xì)胞中異常表達(dá)的lncRNA。方法:收集本院3例COPD病人與3例正常人對(duì)照外周血,分離單個(gè)核細(xì)胞,提取RNA后進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,根據(jù)P＜0.05且|log2FC|＞1計(jì)算兩組樣本的表達(dá)差異,繪制差異lncRNA熱圖與火山圖。通過(guò)Lncpro數(shù)據(jù)庫(kù)可能預(yù)測(cè)差異lncRNA調(diào)控的mRNA,并進(jìn)行GO功能與KEGG信號(hào)通路聚類。結(jié)果:COPD組和對(duì)照組兩組間滿足P＜0.05且|log2FC|＞1差異條件的lncRNA共計(jì)67個(gè),其中上調(diào)33個(gè),下調(diào)34個(gè)。靶基因主要富集的GO功能:多細(xì)胞生物過(guò)程的調(diào)控功能、發(fā)展過(guò)程的調(diào)控功能、結(jié)構(gòu)體形態(tài)發(fā)生功能、系統(tǒng)發(fā)展功能與發(fā)展過(guò)程功能。靶基因主要富集的KEGG信號(hào)通路:多物種凋亡通路、TGF-β信號(hào)通路、補(bǔ)體和凝血級(jí)聯(lián)通路、結(jié)腸直腸癌通路與細(xì)胞凋亡通路。結(jié)論:本研究結(jié)果提供了COPD外周血單個(gè)核細(xì)胞中l(wèi)ncRNA表達(dá)變化的一般情況與可能調(diào)控功能與通路,可能有助于闡明COPD的潛在機(jī)制。 

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【文章目錄】：
1 資料與方法
    1.1 外周血收集
    1.2 單個(gè)核細(xì)胞分離
    1.3 RNA提取與測(cè)序
    1.4 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果
    2.1 鑒定到的lncRNA總數(shù)與類型
    2.2 測(cè)序結(jié)果lncRNA總數(shù)與差異情況
    2.3 差異lncRNA靶基因GO功能與KEGG信號(hào)通路富集分析
3 討論



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