目的:篩選慢性阻塞性肺疾�。╟hronic obstructive pulmonary disease,COPD）患者外周血單個核細胞中異常表達的lncRNA。方法:收集本院3例COPD病人與3例正常人對照外周血,分離單個核細胞,提取RNA后進行轉錄組測序,根據(jù)P＜0.05且|log2FC|＞1計算兩組樣本的表達差異,繪制差異lncRNA熱圖與火山圖。通過Lncpro數(shù)據(jù)庫可能預測差異lncRNA調控的mRNA,并進行GO功能與KEGG信號通路聚類。結果:COPD組和對照組兩組間滿足P＜0.05且|log2FC|＞1差異條件的lncRNA共計67個,其中上調33個,下調34個。靶基因主要富集的GO功能:多細胞生物過程的調控功能、發(fā)展過程的調控功能、結構體形態(tài)發(fā)生功能、系統(tǒng)發(fā)展功能與發(fā)展過程功能。靶基因主要富集的KEGG信號通路:多物種凋亡通路、TGF-β信號通路、補體和凝血級聯(lián)通路、結腸直腸癌通路與細胞凋亡通路。結論:本研究結果提供了COPD外周血單個核細胞中l(wèi)ncRNA表達變化的一般情況與可能調控功能與通路,可能有助于闡明COPD的潛在機制。 

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 資料與方法
    1.1 外周血收集
    1.2 單個核細胞分離
    1.3 RNA提取與測序
    1.4 生物信息學分析
2 結果
    2.1 鑒定到的lncRNA總數(shù)與類型
    2.2 測序結果lncRNA總數(shù)與差異情況
    2.3 差異lncRNA靶基因GO功能與KEGG信號通路富集分析
3 討論



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