2型糖尿病易感基因miRNA結(jié)合位點(diǎn)多態(tài)性與妊娠期糖尿病相關(guān)性研究
本文關(guān)鍵詞:2型糖尿病易感基因miRNA結(jié)合位點(diǎn)多態(tài)性與妊娠期糖尿病相關(guān)性研究
更多相關(guān)文章: 妊娠期糖尿病 miRNA 單核苷酸多態(tài)性
【摘要】:目的妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus, GDM)是以胰島素分泌不足和胰島素抵抗為特征的多基因遺傳病,與2型糖尿病(T2DM)具有相似的遺傳背景。miRNA作為重要的基因表達(dá)調(diào)控分子參與一系列生理活動(dòng),其結(jié)合位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism, SNP)與疾病的發(fā)生密切相關(guān)。但目前有關(guān)miRNA結(jié)合位點(diǎn)SNP與GDM的相關(guān)性研究尚未見(jiàn)報(bào)道。本研究旨在探討T2DM易感基因1niRNA結(jié)合位點(diǎn)SNP與GDM及糖代謝指標(biāo)的相關(guān)性,并驗(yàn)證SNP位點(diǎn)與相應(yīng)miRNA的結(jié)合性。方法選擇全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome-wide association study,GWAS)中與T2DM相關(guān),且已在漢族人群(CHB)中驗(yàn)證的基因?yàn)楹蜻x基因,用NCBI和1000 Genomes數(shù)據(jù)庫(kù)篩選候選基因3'UTR區(qū)CHB中MAF5%的SNP位點(diǎn),PolymiRTS Database、MiRDB、TargetScanHuman 5.2和MicroRNA.org 4個(gè)軟件預(yù)測(cè)SNP位點(diǎn)miRNA的結(jié)合性,選取2個(gè)或2個(gè)以上軟件預(yù)測(cè)有同一niRNA結(jié)合的SNP位點(diǎn)。應(yīng)用Taqman探針?lè)▽?duì)納入的1739例孕婦(其中GDM患者839例,正常對(duì)照900例)進(jìn)行SNP位點(diǎn)基因分型,Sanger測(cè)序法驗(yàn)證分型結(jié)果的準(zhǔn)確性,利用logistic回歸和多元線(xiàn)性回歸等統(tǒng)計(jì)方法分析SNP位點(diǎn)與GDM和相關(guān)糖代謝指標(biāo)的相關(guān)性,并用雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)在體外驗(yàn)證SNP位點(diǎn)與相應(yīng)miRNA的結(jié)合性。結(jié)果1.49個(gè)T2DM候選基因中篩選出符合條件的SNP位點(diǎn)17個(gè):SLC30A8 rs2466293、 KCNB1 rs1051295、KCNQ1 rs8234、CDC123rs12126、VPS26A rs1802295、LPIN1 rs1050800、KCNJ11 rs5210、INSRrs1366600、rs3745550、PAX4 rs712699、NLRP3 rs10802502、MFN2 rs1042842、HNF1B rs2688、GIPR rs73042335、CDKN2B rs1063192、CDKN2B rs3217992和CDKN2A rs3088440,軟件預(yù)測(cè)分別是hsa-miR-181a-2-3p、hsa-miR-216a、hsa-miR-380、hsa-miR-361、hsa-miR-510、 hsa-miR-96、hsa-miR-219a-2-3p、hsa-miR-106、hsa-miR-600、hsa-miR-223、 hsa-miR-548、hsa-miR-183、hsa-miR-299、hsa-miR-135b、hsa-miR-323b、 hsa-miR-138和hsa-miR-328結(jié)合位點(diǎn)的SNP。17個(gè)SNP位點(diǎn)基因型分型成功率均在95%以上,準(zhǔn)確性達(dá)100%,在對(duì)照組均符合Hardy-Weinberg平衡(p0.05)。2.GDM組孕婦年齡、空腹及OGTT 1h,2h,3h血糖和血胰島素水平、HOMA-IR和胰島素曲線(xiàn)下面積AUC均顯著高于對(duì)照組(p0.05),而HOMA-B顯著低于對(duì)照組(p0.05)。3.基因型和等位基因分布頻率比較:6個(gè)SNP位點(diǎn)rs2466293 (SLC30A8)、rs1051295 (KCNB1)、rs1042842 (MFN2)、rs1063192(CDKN2B)、rs1366600(Ⅱ(PAX4)的三種基因型在GDM組和對(duì)照組的分布頻率差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,少見(jiàn)等位基因純合型(分別為CC、CC、AA、CC、CC和AA)增加GDM的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR值分別為1.455、1.579、1.398、1.480、2.191和1.366)。rs2466293、 rs1051295、rs1042842和rs1063192位點(diǎn)少見(jiàn)等位基因在GDM組的分布頻率高于對(duì)照組(P0.05)。4.SNP位點(diǎn)基因型與糖代謝指標(biāo)相關(guān)性:1)rs2466293位點(diǎn)危險(xiǎn)等位基因C的個(gè)數(shù)與OGTT 2h血糖呈正相關(guān)(b=0.062),與HOMA-B呈負(fù)相關(guān)(b=-0.057);CC基因型空腹胰島素水平低于TT和TT+CT基因型(P0.05)。2)rs1051295位點(diǎn)危險(xiǎn)等位基因C的個(gè)數(shù)與空腹血糖、OGTT 2h和3h血糖及HOMA-IR呈正相關(guān)(b值分別為0.006、0.056、0.058和0.065);CC+CT基因型空腹及OGTT 2h和3h胰島素水平以及胰島素曲線(xiàn)下面積均高于TT基因型(P0.05)。3)rs1042842位點(diǎn)危險(xiǎn)等位基因A的個(gè)數(shù)與OGTT 3h血糖呈正相關(guān)(b=0.056,P0.05)。4)rs1063192位點(diǎn)危險(xiǎn)等位基因CC純合型獨(dú)立影響OGTT 1h,2h和3h血糖(b值分別為0.062、0.048和0.062),CC基因型OGTT 3h胰島素水平高于TT及CT+TT基因型。5)rs712699位點(diǎn)危險(xiǎn)等位基因A的個(gè)數(shù)與OGTT 2h血糖呈正相關(guān)(b=0.051,P0.05)。6)rs1802295位點(diǎn)少見(jiàn)等位基因T的個(gè)數(shù)與空腹血糖和HOMA-IR呈負(fù)相關(guān)(b值分別-0.050和-0.056,P0.05)。7)rs1050800位點(diǎn)少見(jiàn)等位基因T的個(gè)數(shù)與OGTT 2h和3h血糖呈正相關(guān),與HOMA-B呈負(fù)相關(guān)(b值分別0.047、0.061和-0.059,P0.05)。8)rs2688位點(diǎn)少見(jiàn)等位基因C的個(gè)數(shù)與HOMA-IR及HOMA-B呈負(fù)相關(guān)(b值分別-0.070和-0.065),CC基因型空腹胰島素水平低于AA基因型(P0.05)。9)rs10802502少見(jiàn)等位基因C的個(gè)數(shù)與OGTT 1h血糖呈負(fù)相關(guān)(b=-0.058),CC基因型OGTT 2h胰島素水平低于TT及CT+TT基因型(P0.05)。10) rs73042335少見(jiàn)等位基因A的個(gè)數(shù)與OGTT 1h血糖呈正相關(guān)(b= 0.049,P0.05)。11)rs3217992位點(diǎn)AA基因型OGTT 2h和3h胰島素水平均低于TT基因型(P0.05)。5.雙熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)結(jié)果:miR-223與PAX4基因3'UTR區(qū)含有rs712699位點(diǎn)AA純合型基因序列相結(jié)合,抑制熒光素酶基因的表達(dá)(P0.05)。結(jié)論1.本研究在國(guó)內(nèi)外首次發(fā)現(xiàn)T2DM易感基因miRNA結(jié)合位點(diǎn)SNPrs2466293、 rs1051295、rs1042842、rs1063192、rs1366600和rs712699的少見(jiàn)等位基因純合型增加GDM的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。2.rs2466293、rs1051295、rs1042842、rs1063192、rs1366600、s712699、rs1802295、 rs1050800、rs2688、rs10802502、rs73042335和rs3217992位點(diǎn)少見(jiàn)等位基因與多個(gè)糖代謝指標(biāo)相關(guān)。3.miR-223與PAX4基因3'UT TR區(qū)含rs712699 AA純合型的基因序列結(jié)合,可能抑制PAX4基因的表達(dá)。
【關(guān)鍵詞】:妊娠期糖尿病 miRNA 單核苷酸多態(tài)性
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類(lèi)號(hào)】:R714.256
【目錄】:
- 中文摘要4-7
- Abstract7-10
- 中英文對(duì)照縮略詞表10-12
- 前言12-17
- 實(shí)驗(yàn)材料17-21
- 實(shí)驗(yàn)方法21-38
- 實(shí)驗(yàn)結(jié)果38-70
- 討論70-79
- 結(jié)論79-80
- 參考文獻(xiàn)80-92
- 論文綜述92-105
- 參考文獻(xiàn)100-105
- 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表文章目錄105-106
- 致謝106-107
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,本文編號(hào):776369
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