本文關鍵詞：基于癌癥基因組圖譜篩查卵巢漿液性囊腺癌相關基因

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【摘要】：目的:利用全基因組表達譜芯片篩查與卵巢漿液性囊腺癌發(fā)生相關的基因,對在卵巢漿液性囊腺癌發(fā)生過程中可能參與的基因間的信號轉導通路進行分析。方法:選取癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫中卵巢漿液性囊腺癌的Affymetrix Gene Chip Human Exon 1.0 ST Array數(shù)據(jù)共16張,分別為卵巢漿液性囊腺癌組8張和正常組8張,篩選出差異表達基因,并進行基因本體(gene ontology,GO)分析和信號通路分析,構建卵巢漿液性囊腺癌相關基因間的信號轉導通路,分析網(wǎng)絡中具有重要作用的基因。結果:共篩選出1 144個在卵巢癌中差異表達的基因,其中表達上調(diào)的基因有747個,表達下調(diào)的基因有397個。GO分析得到上調(diào)差異基因的顯著性功能分析結果362項,下調(diào)差異基因的顯著性功能分析結果 160項(P0.05)。其中包括與腫瘤發(fā)生相關的基因功能有細胞周期、DNA復制、細胞增殖、細胞凋亡、細胞黏附等。信號通路分析得到45個顯著上調(diào)信號通路和14個顯著下調(diào)信號通路(P0.05)。其中參與腫瘤發(fā)生相關的信號通路主要有細胞周期、P53信號通路、DNA復制、腫瘤中的信號通路、PI3K-Akt信號通路、ECM-receptor信號通路、細胞黏附因子、細胞凋亡等。挑選顯著性基因功能和信號通路分析的交集基因229個,構建顯著性GO與信號通路基因間信號轉導網(wǎng)絡。分析發(fā)現(xiàn)CDK1、PLK1、MCM3和PGK1這4個基因在卵巢癌的基因調(diào)控網(wǎng)絡中具有重要作用。結論:卵巢漿液性囊腺癌中有大量差異表達基因,差異表達的基因在多個與腫瘤發(fā)生密切相關的信號通路中發(fā)揮重要的調(diào)控作用。
【作者單位】： 東北師范大學醫(yī)院內(nèi)科;首都醫(yī)科大學附屬北京天壇醫(yī)院臨床醫(yī)學研究實驗室;
【關鍵詞】： 卵巢漿液性囊腺癌 基因芯片 差異表達 基因功能 信號通路
【基金】：國家自然科學基金資助項目(No.81303268) 北京市自然科學基金資助項目(No.7152098)
【分類號】：R737.31
【正文快照】： 卵巢癌的發(fā)病率僅次于子宮頸癌和子宮內(nèi)膜癌,是女性生殖系統(tǒng)致死率最高的惡性腫瘤,占所有因癌癥死亡女性患者的3%。卵巢癌的特點是起病隱匿,約85%患者首次診斷多為晚期,易播散轉移,術后易復發(fā)和易產(chǎn)生化療耐藥等。隨著手術和化療水平的提高,卵巢癌患者的生存率雖然得到了改善,

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1 韋麗婭;姚婷婷;陳慶瑜;沈青麗;林仲秋;;基因芯片篩選上調(diào)miRNA-205表達后HeLa細胞相關基因[J];國際婦產(chǎn)科學雜志;2012年05期

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本文編號：752011