本文關(guān)鍵詞：基于癌癥基因組圖譜篩查卵巢漿液性囊腺癌相關(guān)基因

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【摘要】：目的:利用全基因組表達(dá)譜芯片篩查與卵巢漿液性囊腺癌發(fā)生相關(guān)的基因,對(duì)在卵巢漿液性囊腺癌發(fā)生過程中可能參與的基因間的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路進(jìn)行分析。方法:選取癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫中卵巢漿液性囊腺癌的Affymetrix Gene Chip Human Exon 1.0 ST Array數(shù)據(jù)共16張,分別為卵巢漿液性囊腺癌組8張和正常組8張,篩選出差異表達(dá)基因,并進(jìn)行基因本體(gene ontology,GO)分析和信號(hào)通路分析,構(gòu)建卵巢漿液性囊腺癌相關(guān)基因間的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,分析網(wǎng)絡(luò)中具有重要作用的基因。結(jié)果:共篩選出1 144個(gè)在卵巢癌中差異表達(dá)的基因,其中表達(dá)上調(diào)的基因有747個(gè),表達(dá)下調(diào)的基因有397個(gè)。GO分析得到上調(diào)差異基因的顯著性功能分析結(jié)果362項(xiàng),下調(diào)差異基因的顯著性功能分析結(jié)果 160項(xiàng)(P0.05)。其中包括與腫瘤發(fā)生相關(guān)的基因功能有細(xì)胞周期、DNA復(fù)制、細(xì)胞增殖、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞黏附等。信號(hào)通路分析得到45個(gè)顯著上調(diào)信號(hào)通路和14個(gè)顯著下調(diào)信號(hào)通路(P0.05)。其中參與腫瘤發(fā)生相關(guān)的信號(hào)通路主要有細(xì)胞周期、P53信號(hào)通路、DNA復(fù)制、腫瘤中的信號(hào)通路、PI3K-Akt信號(hào)通路、ECM-receptor信號(hào)通路、細(xì)胞黏附因子、細(xì)胞凋亡等。挑選顯著性基因功能和信號(hào)通路分析的交集基因229個(gè),構(gòu)建顯著性GO與信號(hào)通路基因間信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)。分析發(fā)現(xiàn)CDK1、PLK1、MCM3和PGK1這4個(gè)基因在卵巢癌的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中具有重要作用。結(jié)論:卵巢漿液性囊腺癌中有大量差異表達(dá)基因,差異表達(dá)的基因在多個(gè)與腫瘤發(fā)生密切相關(guān)的信號(hào)通路中發(fā)揮重要的調(diào)控作用。
【作者單位】： 東北師范大學(xué)醫(yī)院內(nèi)科;首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京天壇醫(yī)院臨床醫(yī)學(xué)研究實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 卵巢漿液性囊腺癌 基因芯片 差異表達(dá) 基因功能 信號(hào)通路
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(No.81303268) 北京市自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(No.7152098)
【分類號(hào)】：R737.31
【正文快照】： 卵巢癌的發(fā)病率僅次于子宮頸癌和子宮內(nèi)膜癌,是女性生殖系統(tǒng)致死率最高的惡性腫瘤,占所有因癌癥死亡女性患者的3%。卵巢癌的特點(diǎn)是起病隱匿,約85%患者首次診斷多為晚期,易播散轉(zhuǎn)移,術(shù)后易復(fù)發(fā)和易產(chǎn)生化療耐藥等。隨著手術(shù)和化療水平的提高,卵巢癌患者的生存率雖然得到了改善,

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1 韋麗婭;姚婷婷;陳慶瑜;沈青麗;林仲秋;;基因芯片篩選上調(diào)miRNA-205表達(dá)后HeLa細(xì)胞相關(guān)基因[J];國際婦產(chǎn)科學(xué)雜志;2012年05期

2 冠瀟;李力;黎丹戎;阮和云;尹永碩;張瑋;;應(yīng)用功能分類基因芯片篩選卵巢癌淋巴結(jié)定向高轉(zhuǎn)移細(xì)胞系中差異性表達(dá)基因[J];現(xiàn)代婦產(chǎn)科進(jìn)展;2008年01期

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中國重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 許沈華;牟瀚舟;朱赤紅;錢麗娟;羊正炎;應(yīng)曄;劉祥麟;;卵巢癌基因表達(dá)譜研究[A];中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會(huì)2005年學(xué)術(shù)大會(huì)、青年學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要集[C];2005年

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本文編號(hào)：752011