卵巢漿液性囊腺癌化療耐藥和敏感組織中的miRNA差異表達譜檢測及生物信息學(xué)分析
本文關(guān)鍵詞:卵巢漿液性囊腺癌化療耐藥和敏感組織中的miRNA差異表達譜檢測及生物信息學(xué)分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的:尋找卵巢漿液性囊腺癌化療耐藥及敏感組織中micro RNA的差異表達,并利用生物信息學(xué)技術(shù)對差異表達的micro RNAs進行生物信息學(xué)分析,為研究上皮性卵巢癌化療耐藥產(chǎn)生的分子機制及逆轉(zhuǎn)其化療耐藥提供理論基礎(chǔ)和依據(jù)。方法:首先,應(yīng)用micro RNA表達譜基因芯片尋找卵巢漿液性囊腺癌化療耐藥及敏感組織中差異表達的micro RNAs;其次,選取部分差異表達的micro RNAs應(yīng)用RT-PCR實驗技術(shù)在擴大的組織樣本中進行驗證;最后,運用生物信息學(xué)軟件對符合要求的micro RNAs進行相關(guān)生物信息學(xué)分析。結(jié)果:1、在micro RNA表達譜基因芯片中篩選出與卵巢漿液性囊腺癌化療耐藥相關(guān)的表達上調(diào)miR-27a-3p、miR-141-3p、miR-200b-3p,表達下調(diào)miR-93-3p、miR-497-5p、miR-675-3p。2、表達差異miR-27a-3p,miR-93-3p,miR-141-3p,miR-200b-3p,miR-497-5p,miR-675-3p在擴大樣本組織中的RT-PCR驗證結(jié)果與micro RNA微陣列芯片結(jié)果相一致。3、上調(diào)micro RNA(miR-27a-3p、miR-141-3p、miR-200b-3p)通過靶基因預(yù)測軟件預(yù)測到GRB2、NLK、APC、ABL2、ZEB2、RNF2等307個靶基因,下調(diào)micro RNA(miR-93-3p、miR-497-5p、miR-675-3p)通過靶基因預(yù)測軟件預(yù)測到ALS2、KLF8、CCND2、IGF1R、ZFX、CALU等53個靶基因。4、上調(diào)micro RNAs預(yù)測的靶基因GO(BP模塊)分析結(jié)果顯示:正調(diào)控含核酸堿基化合物代謝過程、正調(diào)控高分子代謝過程及細胞死亡可能與化療耐藥及藥物代謝存在相關(guān)性。上調(diào)micro RNAs預(yù)測的靶基因KEGG Pathway分析結(jié)果顯示:MAPK信號通路、ErbB信號通路及TGF-β信號通路可能參與了化療耐藥產(chǎn)生的機制。5、SP1、TGFB2、PAK2基因蛋白均參與了與耐藥相關(guān)的生物過程和信號通路。結(jié)論:1、miRNA芯片微陣列分析及生物信息學(xué)分析技術(shù)可為人類研究上皮性卵巢癌多藥耐藥機制提供新的途徑,micro RNAs與上皮性卵巢癌化療多藥耐藥間的相關(guān)性將為逆轉(zhuǎn)其多藥耐藥提供一種全新的思路和策略。2、miRNA-27-3p及其靶基因SP1,miRNA-141-3p及其靶基因TGFB2,miRNA-200b-3p及其靶基因PAK2可能在上皮性卵巢癌化療耐藥的發(fā)生機制中扮演重要角色。
【關(guān)鍵詞】:miRNA表達譜基因芯片 卵巢漿液性癌 化療耐藥及敏感 生物信息學(xué)技術(shù)
【學(xué)位授予單位】:山西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R737.31
【目錄】:
- 中文摘要5-7
- 英文摘要7-9
- 縮略簡稱9-10
- 前言10-11
- 1 材料與方法11-18
- 1.1 實驗材料11
- 1.2 實驗儀器及設(shè)備11-12
- 1.3 實驗試劑12
- 1.4 實驗方法12-18
- 1.4.1 microRNA表達譜基因芯片檢測12-14
- 1.4.2 實時熒光定量PCR驗證芯片差異表達譜14-17
- 1.4.3 micro RNA差異表達譜的靶基因預(yù)測17
- 1.4.4 DAVID軟件平臺對靶基因行生物信息學(xué)分析17-18
- 2 結(jié)果18-26
- 3 討論26-29
- 4 結(jié)論29-30
- 參考文獻30-33
- 文獻綜述33-42
- 參考文獻38-42
- 在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果42-43
- 附錄43-45
- 致謝45-46
- 個人簡歷46
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本文關(guān)鍵詞:卵巢漿液性囊腺癌化療耐藥和敏感組織中的miRNA差異表達譜檢測及生物信息學(xué)分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
,本文編號:424547
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