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子癇前期外周血及胎盤(pán)miRNA差異表達(dá)譜與生物信息分析

發(fā)布時(shí)間:2024-03-01 03:55
  目的通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)篩選子癇前期孕婦外周血及胎盤(pán)組織中的microRNA,運(yùn)用生物信息學(xué)的分析方法,精確比較樣本間microRNA差異表達(dá)譜,選擇顯著差異的miRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),分析功能類(lèi)別以及基因與相應(yīng)基因本體(GO)之間的關(guān)聯(lián)。著重分析靶基因的功能分布,確定差異miRNA在子癇前期疾病中的生物學(xué)功能。方法1)收集2017年1月至2017年12月在四川省人民醫(yī)院分娩的年齡、產(chǎn)次相匹配的正常妊娠及子癇前期孕婦外周血、胎盤(pán)各3例,共12例,形成正常與疾病對(duì)照組。2)從收集的全血中分離血清,提取總RNA后分別連接5’接頭和3’接頭,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,凝膠電泳法獲取片段在18-40nt左右的cDNA文庫(kù);使用Illumina HiSeqTM 2500進(jìn)行高通量測(cè)序,初步過(guò)濾數(shù)據(jù),得到干凈序列(clean reads),對(duì)其分布及共有序列進(jìn)行統(tǒng)計(jì)、分類(lèi)注釋,獲得樣本所含各類(lèi)sRNA的組分和表達(dá)量信息。3)將所得的測(cè)序數(shù)據(jù)與miRNA生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)(miRBase數(shù)據(jù)庫(kù)(version 21))比對(duì),獲取miRNA的表達(dá)信息:長(zhǎng)度、結(jié)構(gòu)、表達(dá)水平等,計(jì)算其表達(dá)量。4)判...

【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
abstract
中英文縮略詞表
第一章 緒論
第二章 子癇前期血清MIRNA差異表達(dá)譜的篩選
    2.1 材料和方法
    2.2 結(jié)果
    2.3 討論
第三章 子癇前期胎盤(pán)組織MIRNA差異表達(dá)譜的篩選
    3.1 材料和實(shí)驗(yàn)方法
    3.2 結(jié)果
    3.3 討論
第四章 子癇前期血清及胎盤(pán)差異MIRNA生物信息學(xué)分析
    4.1 實(shí)驗(yàn)方法
    4.2 結(jié)果
    4.3 討論
全文討論
綜述
致謝
參考文獻(xiàn)
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本文編號(hào):3915401

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