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宮頸癌細胞株HeLa與正常宮頸細胞株Ect1/E6E7的微小RNA表達譜的差異

發(fā)布時間:2022-12-09 03:10
  目的探討宮頸癌細胞株HeLa與正常宮頸細胞株Ect1/E6E7中微小RNA(miRNA)分子表達譜的差異。方法選取HeLa細胞和Ect1/E6E7細胞各3個樣本分別作為實驗組和對照組,采用miRNA芯片篩選兩者之間差異表達的miRNA,樣品間表達變化標準以上/下調(diào)4倍作為閾值范圍,并運用miRWalk軟件預測差異表達miRNA可能調(diào)控的靶基因,并對這些靶基因進行信號通路的富集分析。結(jié)果在HeLa細胞中,上調(diào)超過4倍差異表達miRNA分子7個,下調(diào)超過4倍差異表達miRNA分子16個(P<0.01)。生物信息學分析發(fā)現(xiàn)hsa-miR-126-3p的靶基因在腫瘤通路、凋亡通路以及Wnt信號通路上出現(xiàn)聚集;而hsa-miR-25-5p的靶基因腫瘤通路和鈣離子信號通路出現(xiàn)聚集;且hsa-miR-205-5p靶基因在TGF-β信號通路和EGFR信號通路出現(xiàn)聚集。結(jié)論宮頸癌細胞HeLa與正常宮頸細胞Ect1/E6E7之間存在差異表達miRNA分子,他們可能參與宮頸癌的發(fā)生發(fā)展機制。 

【文章頁數(shù)】:4 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1材料
    1.2方法
        1.2.1細胞培養(yǎng)
        1.2.2總RNA提取與濃度和質(zhì)量檢測
        1.2.3熒光標記與ELISA質(zhì)控
        1.2.4 miRNA芯片檢測及信號分析
        1.2.5 qRT-PCR驗證差異表達miRNA
        1.2.6靶基因生物信息學分析
    1.3統(tǒng)計學分析
2 結(jié)果
    2.1 miRNA芯片樣品總RNA的質(zhì)量鑒定結(jié)果
    2.2 miRNA在He La細胞和Ect1/E6E7細胞中的表達
    2.5 qRT-PCR驗證結(jié)果
    2.6 hsa-miR-126-3p、has-miR-25-5p和hsa-miR-205-5p靶基因生物信息學預測
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