基于生物信息學(xué)分析探索中晚期宮頸鱗癌基因組學(xué)與化療敏感性及預(yù)后的關(guān)系
發(fā)布時(shí)間:2021-10-21 18:27
目的:宮頸癌是女性最常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,也是導(dǎo)致女性癌癥死亡的主要原因之一。通過(guò)篩查,侵襲性宮頸癌的發(fā)病率和死亡率大大降低,然而每年仍有相當(dāng)數(shù)量的患者被診斷為中晚期宮頸癌(ⅡB-Ⅳ期),病理類型以鱗狀細(xì)胞癌為主。雖然以順鉑為基礎(chǔ)的同步放化療的應(yīng)用使宮頸癌的治療得到了改善,然而即使是身體狀況和病變特征非常相似的患者,對(duì)同一治療方案的效果也存在明顯的個(gè)體差異現(xiàn)象,一部分患者的腫瘤得到控制或治愈,而另一部分患者的腫瘤治療無(wú)效甚至進(jìn)展。近年來(lái)從分子生物學(xué)角度解釋這種個(gè)體差異現(xiàn)象成為研究熱點(diǎn)。因此,我們?cè)噲D通過(guò)分析中晚期宮頸鱗癌患者的基因突變譜與順鉑治療敏感性、無(wú)進(jìn)展生存期(PFS)和總生存期(OS)的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)具有臨床意義的個(gè)體遺傳學(xué)特征來(lái)優(yōu)化治療方案的選擇。方法:首先我們通過(guò)TCGAbiolinks從TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取所有宮頸癌(Cervical Squamous Cell Carcinoma and Endocervical Adenocarcinoma,CESC)病例的臨床信息和測(cè)序數(shù)據(jù),從中篩選出接受同步放化療且使用順鉑放療增敏的ⅡB-Ⅳ期宮頸鱗狀細(xì)胞癌患者。然后對(duì)這些患者的基因突變...
【文章來(lái)源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】:58 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 前言
第二章 研究方法
2.1 TCGA數(shù)據(jù)集獲取
2.2 Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型分析
2.3 GDSC基因突變與藥物敏感性分析
2.4 差異表達(dá)基因篩選及通路富集分析
2.5 Kaplan-Meier生存分析
2.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
第三章 研究結(jié)果
3.1 TCGA宮頸鱗癌患者的臨床病理特征
3.2 TCGA宮頸癌患者和GDSC宮頸癌細(xì)胞系的基因突變概況
3.3 RB1突變是OS的獨(dú)立影響因素
3.4 RB1突變影響宮頸癌細(xì)胞對(duì)順鉑的敏感性
3.5 RB1突變可能通過(guò)下調(diào)PI3K/AKT信號(hào)通路影響順鉑敏感性
第四章 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間成果
致謝
本文編號(hào):3449503
【文章來(lái)源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】:58 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 前言
第二章 研究方法
2.1 TCGA數(shù)據(jù)集獲取
2.2 Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型分析
2.3 GDSC基因突變與藥物敏感性分析
2.4 差異表達(dá)基因篩選及通路富集分析
2.5 Kaplan-Meier生存分析
2.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
第三章 研究結(jié)果
3.1 TCGA宮頸鱗癌患者的臨床病理特征
3.2 TCGA宮頸癌患者和GDSC宮頸癌細(xì)胞系的基因突變概況
3.3 RB1突變是OS的獨(dú)立影響因素
3.4 RB1突變影響宮頸癌細(xì)胞對(duì)順鉑的敏感性
3.5 RB1突變可能通過(guò)下調(diào)PI3K/AKT信號(hào)通路影響順鉑敏感性
第四章 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間成果
致謝
本文編號(hào):3449503
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