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基于生物信息學(xué)分析探索中晚期宮頸鱗癌基因組學(xué)與化療敏感性及預(yù)后的關(guān)系

發(fā)布時間:2021-10-21 18:27
  目的:宮頸癌是女性最常見的惡性腫瘤之一,也是導(dǎo)致女性癌癥死亡的主要原因之一。通過篩查,侵襲性宮頸癌的發(fā)病率和死亡率大大降低,然而每年仍有相當(dāng)數(shù)量的患者被診斷為中晚期宮頸癌(ⅡB-Ⅳ期),病理類型以鱗狀細(xì)胞癌為主。雖然以順鉑為基礎(chǔ)的同步放化療的應(yīng)用使宮頸癌的治療得到了改善,然而即使是身體狀況和病變特征非常相似的患者,對同一治療方案的效果也存在明顯的個體差異現(xiàn)象,一部分患者的腫瘤得到控制或治愈,而另一部分患者的腫瘤治療無效甚至進(jìn)展。近年來從分子生物學(xué)角度解釋這種個體差異現(xiàn)象成為研究熱點(diǎn)。因此,我們試圖通過分析中晚期宮頸鱗癌患者的基因突變譜與順鉑治療敏感性、無進(jìn)展生存期(PFS)和總生存期(OS)的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)具有臨床意義的個體遺傳學(xué)特征來優(yōu)化治療方案的選擇。方法:首先我們通過TCGAbiolinks從TCGA數(shù)據(jù)庫中獲取所有宮頸癌(Cervical Squamous Cell Carcinoma and Endocervical Adenocarcinoma,CESC)病例的臨床信息和測序數(shù)據(jù),從中篩選出接受同步放化療且使用順鉑放療增敏的ⅡB-Ⅳ期宮頸鱗狀細(xì)胞癌患者。然后對這些患者的基因突變... 

【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】:58 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 前言
第二章 研究方法
    2.1 TCGA數(shù)據(jù)集獲取
    2.2 Cox比例風(fēng)險回歸模型分析
    2.3 GDSC基因突變與藥物敏感性分析
    2.4 差異表達(dá)基因篩選及通路富集分析
    2.5 Kaplan-Meier生存分析
    2.6 統(tǒng)計學(xué)方法
第三章 研究結(jié)果
    3.1 TCGA宮頸鱗癌患者的臨床病理特征
    3.2 TCGA宮頸癌患者和GDSC宮頸癌細(xì)胞系的基因突變概況
    3.3 RB1突變是OS的獨(dú)立影響因素
    3.4 RB1突變影響宮頸癌細(xì)胞對順鉑的敏感性
    3.5 RB1突變可能通過下調(diào)PI3K/AKT信號通路影響順鉑敏感性
第四章 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間成果
致謝



本文編號:3449503

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