背景:漿液性卵巢癌（SOC）占所有上皮性卵巢癌的50%以上。然而,SOC患者對鉑類化療有不同程度的反應(yīng),因此具有不同的生存率。目的:本研究旨在通過分析微陣列數(shù)據(jù)集GDS1381和GDS3592來鑒定導(dǎo)致SOC的發(fā)生以及耐藥的候選基因。材料和方法:從Gene Expression Omnibus數(shù)據(jù)庫下載GDS1381和GDS3592:共鑒定了219個差異表達(dá)基因（DEGs）,分析了可能對卡鉑的反應(yīng)性和SOC預(yù)后有潛在影響的基因。結(jié)果:DEGs富集的功能和通路包括細(xì)胞外區(qū)域,細(xì)胞外間隙,胞外外泌體等。我們在cMAP（Connectivity MAP）上將所有上調(diào)和下調(diào)的基因輸入,鑒定出10種可能有助于改善卵巢癌患者藥物敏感性的小分子藥物。在構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)之后,我們篩選三十個基因組進(jìn)行進(jìn)一步分析。通過基因的生存分析,在不同數(shù)據(jù)庫中的分析和免疫組織化學(xué),我們發(fā)現(xiàn)G蛋白α亞基（GNAI1）,非SMC冷凝體I型復(fù)合物亞基H（NCAPH）,基質(zhì)金屬蛋白酶9（MMP9）,極光激酶A（AURKA）和果皮2多齒狀抑制復(fù)合體2亞基增強(qiáng)子（EZH2）可能是參與導(dǎo)致發(fā)生SOC卡鉑耐藥的關(guān)鍵分子。結(jié)論:... 

【文章來源】：重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市

【文章頁數(shù)】：63 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

差異基因的富集分析

3：差異基因的路 KEGG 通路分析。A：條狀圖 B：點(diǎn)圖ig. 3: KEGG pathway analysis of DEGs. A: barplot B: dotps 的蛋白相互作用（PPI）網(wǎng)絡(luò)ING 數(shù)據(jù)庫探索所有 DEGs 以進(jìn)一步研究這些基因。 DEGs 的 PPI 網(wǎng)絡(luò)由 Cytoscape 構(gòu)建（圖 4A）。量以找出關(guān)鍵樞紐基因。排名前 30 的樞紐基因展于鑒定 DEGs 中最重要的基因。Fig.4A

A:差異共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)。圖 4B:具有最多結(jié)點(diǎn)的前 30 個基因ne coexpression network of GEDs.Fig. 4B: Top 30 genes witnodes.小分子藥物稱為 CMAP）是一種在線的工具，它收集全基因組變化的特征，深入了解藥物，基因和疾病之間的聯(lián)子的微陣列數(shù)據(jù)和模式匹配算法，篩選出與所選基物。它旨在尋找一種新的和潛在的治療疾病的方式選了上調(diào)和下調(diào)的基因，發(fā)現(xiàn)了 10 種相關(guān)的小分癌患者的藥物敏感性有益（表 2）。表 2：前十個相關(guān)的小分子藥物。Table II：TOP 10 relevent small molecular drugs.


本文編號：2959509