卵巢上皮性癌癌旁組織腫瘤相關(guān)差異表達(dá)蛋白的篩選
發(fā)布時(shí)間:2020-12-22 00:00
目的:對比分析卵巢上皮性癌組織、卵巢上皮性癌近端癌旁組織及正常卵巢組織差異表達(dá)蛋白,篩選出卵巢上皮性癌近端癌旁組織中腫瘤相關(guān)差異表達(dá)蛋白作為標(biāo)志物,為卵巢癌術(shù)后卵巢組織自體移植及卵巢功能重建提供依據(jù)。方法:收集卵巢上皮性癌患者手術(shù)切除標(biāo)本癌組織、近端癌旁組織及正常卵巢組織各6例,采用同位素標(biāo)記的相對和絕對定量(iTRAQ)技術(shù)篩選不同組間的差異表達(dá)蛋白,結(jié)合功能注釋及生物信息分析,篩選出卵巢上皮性癌近端癌旁組織腫瘤相關(guān)差異表達(dá)蛋白。結(jié)果:共鑒定出三組共同上調(diào)的蛋白有92個(gè);與卵巢上皮性癌和正常卵巢組織相比,變化倍數(shù)均在2倍以上且在卵巢上皮性癌近端癌旁組織高表達(dá)的蛋白8個(gè),其由6個(gè)基因編碼:IGKV1-16、IGLV2-18、HEL-214、IGHV3OR16-12、HLF、TNC。結(jié)論:卵巢上皮性癌近端癌旁組織存在高表達(dá)的差異蛋白;篩選出的差異蛋白有可能成為安全篩選卵巢上皮性癌癌旁待移植組織的分子標(biāo)志物。
【文章來源】:南華大學(xué)湖南省
【文章頁數(shù)】:47 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
癌旁組織與正常卵巢組織間含量前30差異蛋白顯著富集的GOterm統(tǒng)計(jì)
11圖 2 癌旁組織與癌組織間含量前 30 的差異蛋白顯著富集的 KEGG 通路統(tǒng)計(jì)3.2.3 差異表達(dá)蛋白質(zhì)聚類分析聚類分析的目的是在相似性的基礎(chǔ)上對數(shù)據(jù)進(jìn)行分組、歸類。因此在聚類分組的結(jié)果中,組內(nèi)的數(shù)據(jù)模式有較高的相似性,而組間的數(shù)據(jù)模式差異明顯。在聚類分析過程中,聚類算法會(huì)對樣本(Sample)和變量(Variable,在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中通常指蛋白質(zhì)的定量信息)兩個(gè)維度進(jìn)行分類。目標(biāo)蛋白質(zhì)的聚類分析結(jié)果可以幫助我們從蛋白質(zhì)集合中篩選出具有相同表達(dá)模式的蛋白質(zhì)子集合,具有相似表達(dá)模式的蛋白質(zhì)可能具有類似的功能或者參與同一個(gè)生物學(xué)途徑,或者
在通路中處于臨近的調(diào)控位置。圖 3 所示為癌旁組織與癌組織差異蛋白的聚類分析結(jié)果。圖3 癌組織與癌旁組織差異蛋白聚類分析結(jié)果3.3 組間篩選出的差異表達(dá)蛋白的交叉分析同時(shí)與其他兩組相比, 卵巢上皮癌近端癌旁組織鑒定出的高表達(dá)差異蛋白共92個(gè),將差異倍數(shù)提高至2倍以上,得到8個(gè)差異表達(dá)蛋白,其蛋白序列號分別為:P04430、A0A075B6J9、V9HW68、A0A075B7B8、P24821、Q4LE33、S6C4S2、Q16534由6個(gè)基因編碼:IGKV1-16、IGLV2-18、HEL-214、IGHV3OR16-12、TNC及HLF,詳見表2。表 2 卵巢上皮癌近端癌旁組織與其他兩組相比變化倍數(shù) 2 倍以上的差異表達(dá)蛋白蛋白序列號 基因名稱癌旁組織/癌組織變化倍數(shù)癌旁組織/正常卵巢組織變化倍數(shù)P04430 IGKV1-16 3.470809793 4.202964652A0A075B6J9 IGLV2-18 3.027633851 3
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]假基因及其生物學(xué)功能概述[J]. 付春鵬. 生物學(xué)教學(xué). 2018(12)
[2]肝硬化合并門靜脈血栓患者的差異蛋白篩選[J]. 熊靜平,彭媛媛,張躍新. 臨床肝膽病雜志. 2018(01)
[3]小分子干擾RNA抑制TNC基因的表達(dá)并逆轉(zhuǎn)卵巢癌紫杉醇耐藥[J]. 樊蓓,李紅霞,吳玉梅,徐小紅,鄧小虹. 癌癥進(jìn)展. 2017(07)
[4]Tenascin-C表達(dá)與卵巢上皮性癌分化、浸潤及轉(zhuǎn)移的關(guān)系[J]. 劉睿敏,關(guān)慧,董立娜,牛悅婷,陳杰. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2017(08)
[5]卵巢上皮性癌鉑類耐藥患者血清中耐藥相關(guān)的差異表達(dá)蛋白質(zhì)的篩選及其臨床價(jià)值[J]. 吳文娟,王琪,張瑋,李力. 中華婦產(chǎn)科雜志. 2016 (07)
[6]中國2010年卵巢癌發(fā)病與死亡分析[J]. 張爽爽,夏慶民,鄭榮壽,陳萬青. 中國腫瘤. 2016(03)
[7]肌腱蛋白C(Tenascin C)在組織纖維化中的研究進(jìn)展[J]. 嚴(yán)敏驊. 健康之路. 2016(02)
[8]2006-2014年重慶市惡性腫瘤發(fā)病特征及趨勢變化[J]. 丁賢彬,呂曉燕,毛德強(qiáng),焦艷. 現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2016(03)
[9]沉默信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄活化因子(STAT3)對卵巢癌細(xì)胞SKOV-3中肌糖蛋白(TN-C)表達(dá)的影響[J]. 蔣艷,蔣榮英,劉潔冰. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2016(04)
[10]非B細(xì)胞來源的免疫球蛋白促進(jìn)腫瘤的發(fā)生和發(fā)展[J]. 邱曉彥. 中國腫瘤生物治療雜志. 2015(02)
碩士論文
[1]肌腱蛋白C在直腸癌及胃癌組織中的表達(dá)及其與臨床分期分化之間的關(guān)系[D]. 趙寅生.安徽醫(yī)科大學(xué) 2017
[2]免疫磁性微粒的制備及其在人血漿高豐度蛋白去除中的應(yīng)用研究[D]. 胡佳.西北大學(xué) 2010
[3]卵巢癌中IgG表達(dá)的臨床意義及應(yīng)用RNAi技術(shù)阻斷其表達(dá)的研究[D]. 姜海洋.山東大學(xué) 2005
本文編號:2930757
【文章來源】:南華大學(xué)湖南省
【文章頁數(shù)】:47 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
癌旁組織與正常卵巢組織間含量前30差異蛋白顯著富集的GOterm統(tǒng)計(jì)
11圖 2 癌旁組織與癌組織間含量前 30 的差異蛋白顯著富集的 KEGG 通路統(tǒng)計(jì)3.2.3 差異表達(dá)蛋白質(zhì)聚類分析聚類分析的目的是在相似性的基礎(chǔ)上對數(shù)據(jù)進(jìn)行分組、歸類。因此在聚類分組的結(jié)果中,組內(nèi)的數(shù)據(jù)模式有較高的相似性,而組間的數(shù)據(jù)模式差異明顯。在聚類分析過程中,聚類算法會(huì)對樣本(Sample)和變量(Variable,在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中通常指蛋白質(zhì)的定量信息)兩個(gè)維度進(jìn)行分類。目標(biāo)蛋白質(zhì)的聚類分析結(jié)果可以幫助我們從蛋白質(zhì)集合中篩選出具有相同表達(dá)模式的蛋白質(zhì)子集合,具有相似表達(dá)模式的蛋白質(zhì)可能具有類似的功能或者參與同一個(gè)生物學(xué)途徑,或者
在通路中處于臨近的調(diào)控位置。圖 3 所示為癌旁組織與癌組織差異蛋白的聚類分析結(jié)果。圖3 癌組織與癌旁組織差異蛋白聚類分析結(jié)果3.3 組間篩選出的差異表達(dá)蛋白的交叉分析同時(shí)與其他兩組相比, 卵巢上皮癌近端癌旁組織鑒定出的高表達(dá)差異蛋白共92個(gè),將差異倍數(shù)提高至2倍以上,得到8個(gè)差異表達(dá)蛋白,其蛋白序列號分別為:P04430、A0A075B6J9、V9HW68、A0A075B7B8、P24821、Q4LE33、S6C4S2、Q16534由6個(gè)基因編碼:IGKV1-16、IGLV2-18、HEL-214、IGHV3OR16-12、TNC及HLF,詳見表2。表 2 卵巢上皮癌近端癌旁組織與其他兩組相比變化倍數(shù) 2 倍以上的差異表達(dá)蛋白蛋白序列號 基因名稱癌旁組織/癌組織變化倍數(shù)癌旁組織/正常卵巢組織變化倍數(shù)P04430 IGKV1-16 3.470809793 4.202964652A0A075B6J9 IGLV2-18 3.027633851 3
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]假基因及其生物學(xué)功能概述[J]. 付春鵬. 生物學(xué)教學(xué). 2018(12)
[2]肝硬化合并門靜脈血栓患者的差異蛋白篩選[J]. 熊靜平,彭媛媛,張躍新. 臨床肝膽病雜志. 2018(01)
[3]小分子干擾RNA抑制TNC基因的表達(dá)并逆轉(zhuǎn)卵巢癌紫杉醇耐藥[J]. 樊蓓,李紅霞,吳玉梅,徐小紅,鄧小虹. 癌癥進(jìn)展. 2017(07)
[4]Tenascin-C表達(dá)與卵巢上皮性癌分化、浸潤及轉(zhuǎn)移的關(guān)系[J]. 劉睿敏,關(guān)慧,董立娜,牛悅婷,陳杰. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2017(08)
[5]卵巢上皮性癌鉑類耐藥患者血清中耐藥相關(guān)的差異表達(dá)蛋白質(zhì)的篩選及其臨床價(jià)值[J]. 吳文娟,王琪,張瑋,李力. 中華婦產(chǎn)科雜志. 2016 (07)
[6]中國2010年卵巢癌發(fā)病與死亡分析[J]. 張爽爽,夏慶民,鄭榮壽,陳萬青. 中國腫瘤. 2016(03)
[7]肌腱蛋白C(Tenascin C)在組織纖維化中的研究進(jìn)展[J]. 嚴(yán)敏驊. 健康之路. 2016(02)
[8]2006-2014年重慶市惡性腫瘤發(fā)病特征及趨勢變化[J]. 丁賢彬,呂曉燕,毛德強(qiáng),焦艷. 現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2016(03)
[9]沉默信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄活化因子(STAT3)對卵巢癌細(xì)胞SKOV-3中肌糖蛋白(TN-C)表達(dá)的影響[J]. 蔣艷,蔣榮英,劉潔冰. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2016(04)
[10]非B細(xì)胞來源的免疫球蛋白促進(jìn)腫瘤的發(fā)生和發(fā)展[J]. 邱曉彥. 中國腫瘤生物治療雜志. 2015(02)
碩士論文
[1]肌腱蛋白C在直腸癌及胃癌組織中的表達(dá)及其與臨床分期分化之間的關(guān)系[D]. 趙寅生.安徽醫(yī)科大學(xué) 2017
[2]免疫磁性微粒的制備及其在人血漿高豐度蛋白去除中的應(yīng)用研究[D]. 胡佳.西北大學(xué) 2010
[3]卵巢癌中IgG表達(dá)的臨床意義及應(yīng)用RNAi技術(shù)阻斷其表達(dá)的研究[D]. 姜海洋.山東大學(xué) 2005
本文編號:2930757
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