基于二代測(cè)序及臨床病理評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)評(píng)價(jià)子宮內(nèi)膜和卵巢雙發(fā)癌的研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-21 17:18
目的探究臨床病理學(xué)評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)與二代測(cè)序技術(shù)相結(jié)合用于輔助同時(shí)性子宮內(nèi)膜和卵巢雙發(fā)癌(synchronous endometrial and ovarian carcinomas,SEOCs)患者的診斷及預(yù)后評(píng)價(jià),從而指導(dǎo)臨床個(gè)體化治療。方法收集2010年1月至2017年5月的68例經(jīng)術(shù)后病理證實(shí)的同時(shí)性子宮內(nèi)膜和卵巢雙發(fā)癌、2011年1月至2011年12月的50例子宮內(nèi)膜樣子宮內(nèi)膜癌患者的臨床病理資料。根據(jù)Scully病理診斷標(biāo)準(zhǔn)對(duì)同時(shí)性雙發(fā)癌人群進(jìn)行分組;谠撛\斷標(biāo)準(zhǔn)及相關(guān)臨床研究數(shù)據(jù),制定評(píng)分標(biāo)準(zhǔn),對(duì)該人群重新分組。采用全基因外顯子測(cè)序方法對(duì)其中一例SEOCs進(jìn)行測(cè)序。通過(guò)與相關(guān)文獻(xiàn)的研究數(shù)據(jù)進(jìn)行比對(duì),找出該患者子宮內(nèi)膜腫瘤中與發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)顯著相關(guān)的突變基因,為后續(xù)大量標(biāo)本實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證做準(zhǔn)備。排除所有子宮內(nèi)膜和卵巢均為漿液性癌的雙發(fā)癌,對(duì)同時(shí)性子宮內(nèi)膜樣的子宮內(nèi)膜和卵巢雙發(fā)癌、單發(fā)卵巢癌及單發(fā)子宮內(nèi)膜癌進(jìn)行回顧性分析。各組患者間臨床特點(diǎn)及病理特征方面的對(duì)比研究采用卡方檢驗(yàn)進(jìn)行分析。使用Kaplan-Meier統(tǒng)計(jì)學(xué)方法計(jì)算總生存率(OS)。結(jié)果1.根據(jù)Scully標(biāo)準(zhǔn),68例同時(shí)性雙發(fā)癌患...
【文章來(lái)源】:天津醫(yī)科大學(xué)天津市 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:44 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
評(píng)分系統(tǒng)分組結(jié)果
圖2 Scully診斷標(biāo)準(zhǔn)和評(píng)分系統(tǒng)分組后各組間總生存率對(duì)比。(1)Scully分組后雙原發(fā)癌與轉(zhuǎn)移癌間的總生存率比較(P=0.059);(2)評(píng)分系統(tǒng)分組后雙原發(fā)癌與轉(zhuǎn)移癌間的總生存率比較(P=0.010)。2.4 全外顯子測(cè)序結(jié)果為了進(jìn)一步明確評(píng)分為 2 的病例組的分組,對(duì)該組患者的兩腫物進(jìn)行全外顯子測(cè)序,并與外周血中的正常 DNA 相匹配,排除存在于血液中的突變,明確配對(duì)腫瘤之間的起源關(guān)系,其中位測(cè)序深度為 147.2×(范圍為 78.95~228.46×)。由于組織樣本質(zhì)量等原因,在本研究中僅 1 例測(cè)序成功,測(cè)序結(jié)果如下:2.4.1 突變特征不同的突變特征揭示了癌癥發(fā)展背后突變過(guò)程的多樣性,對(duì)于了解癌癥病因,預(yù)防和治療具有潛在的意義。本研究中兩配對(duì)樣本的突變特征如圖所示,即以 NpCpG 三核苷酸 C 取代 T(C> T)為主(圖 3)。這種突變特征可以在約83.3%的癌癥類型中觀察到,也是子宮體腫瘤與卵巢腫瘤中常見(jiàn)的突變特征之一[21]。
圖 3 測(cè)序病例體細(xì)胞 SNVs 的突變特征2.4.2 克隆相關(guān)性我們分析了體細(xì)胞突變的等位基因頻率,這些頻率反映了腫瘤樣本的中心克隆數(shù)和遺傳組成(圖 4.1)。EEC 與 EOC 兩個(gè)樣本具有不同的克隆結(jié)構(gòu)。在EOC 樣品中檢測(cè)到兩個(gè)峰,在 EEC 樣品中檢測(cè)到 1 峰。2 個(gè)樣本對(duì)應(yīng)頻率的突變密度也不一致,在 EEC 樣品中,除了主克隆以外,還有亞克隆結(jié)構(gòu)。根據(jù)這一觀察結(jié)果,推測(cè)這兩個(gè)部位的腫瘤很可能是不同起源。比較子宮內(nèi)膜腫瘤和卵巢腫瘤樣本之間的突變相似性,以確定該病例是否具有遺傳獨(dú)立性。我們已鑒定出在卵巢和子宮內(nèi)膜腫瘤中共有 97 個(gè) SNVs 和 156個(gè) INDELs 突變。共同的體細(xì)胞 SNVs / INDELs 突變的鑒定比例分別為 5.2%和7.9%,遠(yuǎn)低于我們的預(yù)期(圖 4.2-4.5)。如果兩個(gè)腫瘤是同義起源,它們將會(huì)具有更多共同的 SNVs 和 INDELs。
本文編號(hào):2930189
【文章來(lái)源】:天津醫(yī)科大學(xué)天津市 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:44 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
評(píng)分系統(tǒng)分組結(jié)果
圖2 Scully診斷標(biāo)準(zhǔn)和評(píng)分系統(tǒng)分組后各組間總生存率對(duì)比。(1)Scully分組后雙原發(fā)癌與轉(zhuǎn)移癌間的總生存率比較(P=0.059);(2)評(píng)分系統(tǒng)分組后雙原發(fā)癌與轉(zhuǎn)移癌間的總生存率比較(P=0.010)。2.4 全外顯子測(cè)序結(jié)果為了進(jìn)一步明確評(píng)分為 2 的病例組的分組,對(duì)該組患者的兩腫物進(jìn)行全外顯子測(cè)序,并與外周血中的正常 DNA 相匹配,排除存在于血液中的突變,明確配對(duì)腫瘤之間的起源關(guān)系,其中位測(cè)序深度為 147.2×(范圍為 78.95~228.46×)。由于組織樣本質(zhì)量等原因,在本研究中僅 1 例測(cè)序成功,測(cè)序結(jié)果如下:2.4.1 突變特征不同的突變特征揭示了癌癥發(fā)展背后突變過(guò)程的多樣性,對(duì)于了解癌癥病因,預(yù)防和治療具有潛在的意義。本研究中兩配對(duì)樣本的突變特征如圖所示,即以 NpCpG 三核苷酸 C 取代 T(C> T)為主(圖 3)。這種突變特征可以在約83.3%的癌癥類型中觀察到,也是子宮體腫瘤與卵巢腫瘤中常見(jiàn)的突變特征之一[21]。
圖 3 測(cè)序病例體細(xì)胞 SNVs 的突變特征2.4.2 克隆相關(guān)性我們分析了體細(xì)胞突變的等位基因頻率,這些頻率反映了腫瘤樣本的中心克隆數(shù)和遺傳組成(圖 4.1)。EEC 與 EOC 兩個(gè)樣本具有不同的克隆結(jié)構(gòu)。在EOC 樣品中檢測(cè)到兩個(gè)峰,在 EEC 樣品中檢測(cè)到 1 峰。2 個(gè)樣本對(duì)應(yīng)頻率的突變密度也不一致,在 EEC 樣品中,除了主克隆以外,還有亞克隆結(jié)構(gòu)。根據(jù)這一觀察結(jié)果,推測(cè)這兩個(gè)部位的腫瘤很可能是不同起源。比較子宮內(nèi)膜腫瘤和卵巢腫瘤樣本之間的突變相似性,以確定該病例是否具有遺傳獨(dú)立性。我們已鑒定出在卵巢和子宮內(nèi)膜腫瘤中共有 97 個(gè) SNVs 和 156個(gè) INDELs 突變。共同的體細(xì)胞 SNVs / INDELs 突變的鑒定比例分別為 5.2%和7.9%,遠(yuǎn)低于我們的預(yù)期(圖 4.2-4.5)。如果兩個(gè)腫瘤是同義起源,它們將會(huì)具有更多共同的 SNVs 和 INDELs。
本文編號(hào):2930189
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