子癇前期患者VC轉(zhuǎn)運(yùn)體基因遺傳易感性研究及營(yíng)養(yǎng)狀況調(diào)查分析
【學(xué)位授予單位】:青島大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R714.244
【圖文】:
圖 1.1 Taqman 探針熒光定量 PCR 原理圖TaqMan 探針的 5’處有一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)(reporter dye,簡(jiǎn)稱 R 基團(tuán)),3’處有一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)(quencher,簡(jiǎn)稱 Q 基團(tuán)),Q 集團(tuán)與 R 集團(tuán)位于探針兩端,完整的探針中 R 集團(tuán)發(fā)出的熒光信號(hào)會(huì)被 Q 基團(tuán)所吸收,呈現(xiàn)熒光(-)信號(hào);PCR 擴(kuò)增時(shí),探針會(huì)與 DNA 模板結(jié)合,當(dāng)正向引物與探針相遇時(shí),Taq 聚合酶(Taq polymerase)的5’-3’的外切酶活性會(huì)把探針溶解,R 集團(tuán)與探針?lè)蛛x,使它和猝滅集團(tuán)分開(kāi),這時(shí)就會(huì)產(chǎn)生熒光,這樣就實(shí)現(xiàn)了每合成一條 DNA 鏈就就會(huì)捕獲到一個(gè)熒光信號(hào),經(jīng)過(guò) PCR的多個(gè)循環(huán)之后,熒光檢測(cè)系統(tǒng)就會(huì)得到一條呈 S ‖增長(zhǎng)的熒光信號(hào)增長(zhǎng)曲線。本實(shí)驗(yàn)在 PCR 反應(yīng)體系中加入兩種不同熒光標(biāo)記的探針,在 PCR 擴(kuò)增之后通過(guò)終點(diǎn)讀板檢測(cè)熒光信號(hào)有無(wú)就可以判斷樣本的基因型。3.2 標(biāo)本采集納入研究隊(duì)列的孕婦在入院后,常規(guī)禁食12 h后,次日清晨采集外周肘靜脈血2 mL(EDTA 抗凝),進(jìn)行充分地顛倒混勻,吸取 200 μL 全血至 1.5 mL EP 管中,置于 4℃冰箱保存,盡快進(jìn)行 DNA 的提取,并將剩余的全血置于 2 mL EP 管內(nèi),于-80℃冰箱
CAGTCTGGGATATGGAAATTTC-3’ ; rs1279683 位點(diǎn)的上游引物序列是:GTTCTTGGACCGCTAAGCA-3’, 下 游 引 物 序 列 是 CCATGTGAGGTCAGACAGACA。.2 PCR 反應(yīng)體系和反應(yīng)條件實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 的總反應(yīng)體系共 25 μL,包括:2×Taqman Genotyping M 12.5 μL、20×SNP Genotyping Assay 1.25 μL、高壓滅菌去離子水 10.25μL 以及A 樣本 1.0 μL。PCR 擴(kuò)增反應(yīng)由 C1000TM熱循環(huán)儀進(jìn)行,反應(yīng)條件是:①95℃預(yù)變性 3 分鐘變性 15 秒;③ 60℃退火 1 分鐘,共 45 個(gè)循環(huán)。.3 SNP 基因分型應(yīng)用美國(guó)Bio-Rad 公司的 CXF96 TM Manager 軟件檢測(cè) VIC 跟 FAM 標(biāo)記的探號(hào),進(jìn)而對(duì) rs6133175 和 rs1279683 兩位點(diǎn)的樣本基因型進(jìn)行區(qū)分。現(xiàn)以 rs613,其三種基因型如下圖所示:
FAM標(biāo)記的堿基被擴(kuò)增,基因型讀為GG(純合性)
【參考文獻(xiàn)】
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1 周璐;單核苷酸多態(tài)性及交互作用與子癇前期遺傳易感性研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2017年
本文編號(hào):2758184
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