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宿主免疫基因CD133和ERAPs多態(tài)性與宮頸癌的相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2020-06-26 10:53
【摘要】:目的:宮頸癌(cervicalcancer,CC)是一類嚴(yán)重威脅女性健康的婦科疾病。目前已有研究表明宮頸癌的發(fā)生是由高危型人乳頭瘤病毒(Highrisk-HPV,Hr-HPV),宿主遺傳因素和環(huán)境因素共同決定的。本研究主要關(guān)注于宿主遺傳因素與宮頸癌發(fā)生發(fā)展的關(guān)系。CD133被認(rèn)為是腫瘤干細(xì)胞的標(biāo)記分子,其表達(dá)情況與腫瘤的分化情況,腫瘤大小以及患者生存率等相關(guān)。在腫瘤免疫反應(yīng)過程中,抗原肽的加工呈遞非常重要,而內(nèi)質(zhì)網(wǎng)氨肽酶(ERAPs)在抗原肽的加工呈遞過程中發(fā)揮著極其重要的作用,ERAPs功能異?蓪(dǎo)致肽庫改變,從而影響對(duì)腫瘤的殺傷,導(dǎo)致腫瘤免疫逃逸。研究表明:基因本身的變異可能會(huì)通過影響基因的表達(dá)及其表達(dá)蛋白的結(jié)構(gòu)而影響其功能,并進(jìn)一步與疾病的發(fā)生發(fā)展相關(guān)。因此,本研究選取CD133基因的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(SNPs)rs2240688(G/T)和 rs3130(T/C),ERAP1 基因的 rs26653(C/G)、rs26618(C/T)、rs30187(T/C)和 rs27044(G/C)位點(diǎn)以及ERAP2 基因的 rs61731315(G/C),rs2549782(G/T)和 rs2248374(A/G)位點(diǎn)作為研究位點(diǎn),探究其與宮頸癌發(fā)生發(fā)展的關(guān)系,為宮頸癌的診斷以及治療提供新的遺傳數(shù)據(jù)。方法:在CD133基因多態(tài)性與宮頸癌的相關(guān)性研究中,癌癥組(CC)共納入428人,健康對(duì)照組(Control)共納入455人。在ERA基因多態(tài)性與宮頸癌的相關(guān)性研究中,癌癥組(CC)共納入476人,癌前病變組(CIN)共納入350人,對(duì)照組(Control)中共納入653人。本研究采用TaqMan探針基因分型和Massarray質(zhì)譜基因分型方法對(duì)SNPs進(jìn)行基因分型,采用χ2檢驗(yàn)分析各SNPs等位基因、基因型以及構(gòu)建的單倍型在各組之間的分布差異,并進(jìn)一步對(duì)存在分布差異的位點(diǎn)進(jìn)行遺傳模式分析。結(jié)果:CD133基因中,rs2240688(G/T)位點(diǎn)等位基因G可能是宮頸癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)性因素(OR=1.29,95%Cl:1.04~1.60),基因型2G/G-G/T可能會(huì)增加患宮頸癌的風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.31,95%Cl:1.04~1.64),rs3130(T/C)與宮頸癌的發(fā)生無相關(guān)性,單倍型rs2240688G-rs3130C可能是宮頸癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)性因素(OR=1.30,95%Cl:1.04~1.63);ERAP1基因中,rs26653(C/G)位點(diǎn)等位基因C可能是宮頸癌發(fā)生的保護(hù)性因素(OR=0.85,95%Cl:0.72~1.00),基因型G/G可能會(huì)增加宮頸癌前病變和宮頸癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.35,95%Cl:1.02~1.78;OR=1.45,95%Cl:1.08~1.96),rs26618(C/T)位點(diǎn)等位基因C可能是宮頸癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)性因素(OR=1.25,95%Cl:1.04~1.50),基因型C/C可能會(huì)增加宮頸癌前病變和宮頸癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.93,95%Cl:1.29~2.89;OR=1.86,95%Cl:1.21~2.87),rs30187(T/C)位點(diǎn)等位基因 C可能是宮頸癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)性因素(OR=1.22,95%Cl:1.03~1.45),基因型C/T-T/T可能會(huì)降低宮頸癌前病變和宮頸癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.70,95%C:0.54~0.91;OR=0.69,95%Cl:0.51~0.92),rs27044(G/C)位點(diǎn)等位基因C可能是宮頸癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)性因素(OR=1.28,95%Cl:1.08~1.52),基因型G/G-C/G可能會(huì)降低宮頸癌前病變和宮頸癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.69,95%Cl:0.52~0.91;OR=0.76,95%Cl:0.64~0.91),單倍型rs26653C-rs26618T-rs30187T-rs27044G可能是宮頸癌發(fā)生發(fā)展的保護(hù)性因素(OR=0.62,95%Cl:0.52~0.74;OR=0.73,95%Cl:0.60~0.89);ERAP2基因中,rs61731315(G/C)位點(diǎn)在我們的研究人群中無多態(tài)性存在,rs2549782(G/T)位點(diǎn)等位基因G可能是宮頸癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)性因素(OR=1.20,95%Cl:1.02~1.42),基因型G/T-G/G有可能會(huì)增加宮頸癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.36,95%Cl:1.05~1.77),rs2248374(A/G)位點(diǎn)等位基因A可能是宮頸癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)性因素(OR=1.20,95%Cl:1.02~1.42),基因型G/A-A/A與宮頸癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的增加有關(guān)(OR=1.36,95%Cl:1.04~1.76),單倍型rs2549782G-rs2248374A可能是宮頸癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)性因素(OR=1.20,95%Cl:1.02~1.42),rs2549782T-rs2248374G 可能是宮頸癌發(fā)生的保護(hù)性因素(OR=0.83,95%Cl:0.70~0.98)。結(jié)論:本研究發(fā)現(xiàn),CD133基因中的rs2240688位點(diǎn),ERAP基因中的rs26653、rs26618,rs30187 和 rs27044 位點(diǎn)以及ERAP2 基因中的 rs2549782 和 rs2248374 位點(diǎn)均可能是宮頸癌的易感位點(diǎn)。
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R737.33
【圖文】:

電泳圖,完整性檢測,電泳圖,等位基因


圖4.所提取基因組DNA完整性檢測電泳圖逡逑Figure邋4.邋Electrophoretic邋map邋of邋integrity邋detection邋of邋extracted邋genomic邋DNA逡逑CDBJ基因和EiMPs基因多態(tài)性研宄位點(diǎn)選取結(jié)果逡逑結(jié)合相關(guān)研究報(bào)道以及SNPs等位基因以及基因型在各地區(qū)的分布情況綜我們選取了邐基因的2個(gè)SNPs,邋_尸/基因的4個(gè)SNPs以及五兄43個(gè)SNPs以及進(jìn)行研究。各SNPs的位點(diǎn)信息,等位基因及基因型在各分布頻率如表4所示。逡逑

散點(diǎn)圖,基因分型,散點(diǎn)圖,位點(diǎn)


中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院&北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院碩士研究生畢業(yè)論文基因分型結(jié)果逡逑TaqMan邋Assay邋SNP邋分型結(jié)果逡逑240688(G/T>位點(diǎn)分型結(jié)果逡逑用于檢測rs2240688位點(diǎn)基因型的探針中,VIC標(biāo)記的是等位基因GM標(biāo)記的是等位基因T。在基因分型散點(diǎn)圖中,紅色斑點(diǎn)表示的是G/G,藍(lán)色斑點(diǎn)表示的是T/T基因型,綠色斑點(diǎn)代表的是G/T基因型。下圖圖是CC組的分型散點(diǎn)圖,右圖是Control組的分型散點(diǎn)圖。逡逑Allelic邋Dtscrimination邋Plot邐Allelic邋Otscriminatton邋Plot逡逑

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相關(guān)碩士學(xué)位論文 前1條

1 周紫云;宿主免疫基因CD133和ERAPs多態(tài)性與宮頸癌的相關(guān)性研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2019年



本文編號(hào):2730215

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