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miR-363靶基因預(yù)測及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2018-12-25 14:13
【摘要】:目的 :初步明確hsa-miR-363潛在的生物學(xué)功能。方法:首先通過miRbase、UCSC等在線數(shù)據(jù)庫對hsa-miR-363的堿基序列、基因位點及序列保守性進行分析;其次選擇miranda、miRDB、Pic Tar及Target Scan四個在線數(shù)據(jù)庫預(yù)測hsa-miR-363的靶基因并取交集,篩選后的靶基因用于后續(xù)分析;最后通過基因GO功能注釋、富集分析和KEGG信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路富集分析,初步闡明hsa-miR-363靶基因參與調(diào)控的細胞功能與信號通路。結(jié)果:根據(jù)生物信息學(xué)分析的結(jié)果顯示,hsa-miR-363的功能較廣泛,其多個潛在靶基因均參與子宮內(nèi)膜異位癥發(fā)生、發(fā)展過程中的多個生物學(xué)進程。結(jié)論:hsa-miR-363很可能與子宮內(nèi)膜異位癥的發(fā)病機制密切相關(guān),并有可能為臨床的靶向治療提供潛在的新靶點。
[Abstract]:Objective: to identify the potential biological function of hsa-miR-363. Methods: the base sequence, gene locus and sequence conserved of hsa-miR-363 were analyzed by miRbase,UCSC and other online databases. Secondly, four online databases of miranda,miRDB,Pic Tar and Target Scan were selected to predict the target genes of hsa-miR-363 and intersected. The selected target genes were used for subsequent analysis. Finally, the cellular function and signal pathway regulated by hsa-miR-363 target gene were elucidated by gene GO function annotation, enrichment analysis and KEGG signal transduction pathway enrichment analysis. Results: according to the results of bioinformatics analysis, hsa-miR-363 has a wide range of functions and many potential target genes are involved in the occurrence and development of endometriosis. Conclusion: hsa-miR-363 may be closely related to the pathogenesis of endometriosis and may provide a potential new target for clinical targeted therapy.
【作者單位】: 南京醫(yī)科大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院;南京醫(yī)科大學(xué)附屬南京市婦幼保健院婦科;南京中醫(yī)藥大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院;
【分類號】:R711.7

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本文編號:2391238

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