宮頸癌HPV整合和基因組不穩(wěn)定性的研究
本文選題:人乳頭瘤病毒 切入點:整合 出處:《華中科技大學》2014年博士論文
【摘要】:目的 為了研究HPV整合和基因組不穩(wěn)定性在宮頸癌發(fā)生發(fā)展的意義,我們探索建立HPV整合-FISH技術(shù),從宮頸癌標本原位角度研究HPV整合的特點;利用TP63和MYC的拷貝數(shù)和蛋白表達作為標記物,并且利用基因集富集分析方法,探索HPV整合和宿主基因拷貝數(shù)變化等基因組不穩(wěn)定對宮頸癌發(fā)病的影響。 方法 我們建立了一套新的可推廣的FISH探針制作方法,用來檢測HPV和基因組內(nèi)的任意基因。探索了宮頸癌標本中不同基因組位點HPV整合的出現(xiàn)頻率;研究CIN和宮頸癌病人病變組織的石蠟切片,用ROC曲線分析TP63、MYC的拷貝數(shù)和蛋白表達鑒別宮頸癌和CIN的診斷效率;分析宮頸癌中主要激活的信號通路和過表達的基因的特征。 結(jié)果 新的FISH探針制作方法可以有效地檢測出宮頸癌中HPV整合。HPV信號在宮頸癌癌中有彌散和點狀形式。在宮頸癌內(nèi)部癌細胞分為不同亞群。在8q24位點HPV整合的頻率最高。TP63和MYC的拷貝數(shù)、蛋白表達水平,以及HPV整合陽性率都隨著CIN向?qū)m頸癌的進展而增加。TP63拷貝數(shù)擴增表現(xiàn)出很高的診斷效能。經(jīng)典通路富集顯示ATM信號通路在宮頸癌中被激活,宮頸癌中染色體3q區(qū)域容易出現(xiàn)過表達的基因。 結(jié)論 HPV在宮頸癌中存在高頻整合位點。TP63和MYC的拷貝數(shù)擴增和蛋白過表達,以及HPV整合陽性率都和CIN到宮頸癌的病程發(fā)展具有相關(guān)性。ATM信號通路的激活和通路內(nèi)的過表達基因,染色體3q區(qū)域的DNA擴增和基因過表達也是宮頸癌的重要特征。進一步研究上述標記物有助于深入理解宮頸癌發(fā)病機制,以更好地指導宮頸癌的防治。
[Abstract]:PurposeIn order to study the significance of HPV integration and genomic instability in the occurrence and development of cervical cancer, we explored the establishment of HPV integration-fish technology, and studied the characteristics of HPV integration from the point of view of cervical cancer in situ.Using the copy number and protein expression of TP63 and MYC as markers, and using the method of gene set enrichment analysis, the effects of genomic instability such as HPV integration and variation of host gene copy number on the pathogenesis of cervical cancer were explored.MethodWe have established a new and extensible FISH probe method for the detection of any gene in HPV and genome.The frequency of HPV integration at different genomic sites in cervical cancer specimens was explored, and the paraffin sections of CIN and cervical cancer tissues were studied. The ROC curve was used to analyze the copy number and protein expression of TP63 HPV in the differential diagnosis of cervical cancer and CIN.To analyze the characteristics of major activated signaling pathways and overexpression genes in cervical cancer.ResultThe new method of FISH probe fabrication can effectively detect the diffusive and punctate forms of HPV integration.HPVsignal in cervical carcinoma.In cervical cancer, cancer cells are subdivided into different subsets.The frequency of HPV integration at 8q24 site was the highest. TP63 and MYC copy number, protein expression level, and HPV integration positive rate were all increased with the progression of CIN to cervical cancer.The enrichment of classical pathway showed that the ATM signaling pathway was activated in cervical cancer, and the 3q region of chromosome was prone to overexpression in cervical cancer.ConclusionThe high frequency integration site. TP63 and MYC copy number amplification and protein overexpression were found in cervical cancer, and the positive rate of HPV integration was correlated with the activation of CIN signal pathway and overexpression gene in the pathway.DNA amplification and gene overexpression in chromosome 3 Q are also important features of cervical cancer.Further study of these markers is helpful to understand the pathogenesis of cervical cancer and guide the prevention and treatment of cervical cancer.
【學位授予單位】:華中科技大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R737.33
【共引文獻】
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,本文編號:1690044
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