宮頸上皮內(nèi)瘤變和宮頸癌中LMX1A和PAX1基因甲基化的定量分析
本文選題:宮頸癌 切入點(diǎn):宮頸上皮內(nèi)瘤變 出處:《中國(guó)癌癥雜志》2015年01期
【摘要】:背景與目的:DNA甲基化是宮頸上皮癌變過(guò)程中常見的表觀遺傳改變。本研究旨在檢測(cè)同源盒轉(zhuǎn)錄因子1ɑ(LMX1A)基因和配對(duì)盒基因家族PAX1基因在浸潤(rùn)性宮頸鱗癌(invasive cervical cancers,ICC)組織中的甲基化水平,評(píng)估其作為分子標(biāo)志物用于區(qū)分各級(jí)別宮頸病變的潛在臨床價(jià)值。方法:在32例低級(jí)別宮頸上皮內(nèi)瘤變(low-grade cervical intraepithelial neoplasia,LG-CIN)、34例高級(jí)別宮頸上皮內(nèi)瘤變(high-grade cervical intraepithelial neoplasia,HG-CIN)、27例ICC病變宮頸組織和28例慢性宮頸炎為正常對(duì)照組(negative for intraepithelial lesion or malignancy,NLM)中,采用巢式PCR和焦硫酸測(cè)序(pyrosequencing)技術(shù)定量分析LMX1A基因的6個(gè)位點(diǎn)和PAX1基因的9個(gè)位點(diǎn)的甲基化。并通過(guò)受試者工作特征曲線下面積(receiver operating characteristic curve,ROC)的計(jì)算獲得上述基因的甲基化檢測(cè)用于診斷各級(jí)別宮頸病變的準(zhǔn)確性。結(jié)果:宮頸癌中的LMX1A基因6個(gè)位點(diǎn)的甲基化平均水平為14.36%,明顯高于HG-CIN病變的4.70%、LG-CIN病變的5.05%和NLM的4.53%(P0.01)。宮頸癌中PAX1基因9個(gè)位點(diǎn)的甲基化平均水平為41.97%,明顯高于HG-CIN的10.21%(P0.01);而后者又明顯高于LG-CIN的5.55%和NLM的4.92%(P0.01)。檢測(cè)LMX1A基因甲基化和PAX1基因甲基化水平鑒別宮頸癌的ROC曲線下面積分別為0.603(P=0.104)和0.883(P0.001)。經(jīng)ROC曲線下面積計(jì)算獲得最佳PAX1基因甲基化水平的界定值為20.50%,其診斷浸潤(rùn)性宮頸癌的靈敏度為81%、特異度為93%。當(dāng)PAX1基因甲基化水平界定值為9.58%時(shí),其檢測(cè)浸潤(rùn)性宮頸癌的靈敏度為89%、特異度為84%。結(jié)論:定量分析宮頸組織中的PAX1基因甲基化將有可能作為分子標(biāo)志物用于浸潤(rùn)癌的鑒別診斷,而LMX1A基因的甲基化檢測(cè)臨床價(jià)值有限。
[Abstract]:Background & AIM: PAX1 methylation is a common epigenetic change in cervical epithelial carcinogenesis. The aim of this study was to detect homologous cassette transcription factor 1 (LMX1A) gene and pairing box gene family PAX1 gene in invasive cervical carcinomas (ICCCs) of invasive cervix cervix. Methylation level, To evaluate its potential clinical value as a molecular marker in differentiating cervical lesions of various grades. Methods: Thirty-four cases of high-grade cervical intraepithelial neoplasms with high-grade cervical intraepithelial neoplasia HG-CINA of 27 cases with ICC lesions were studied in 32 cases of low-grade cervical intraepithelial neoplasia intraepithelial neoplasia of low grade cervical intraepithelial neoplasms. Tissue and 28 cases of chronic cervicitis were included in normal control group: negative for intraepithelial lesion or malignant NLM. The methylation of 6 sites of LMX1A gene and 9 sites of PAX1 gene were quantitatively analyzed by nested PCR and pyrosulphuric acid sequencing techniques. The A of the above gene was obtained by calculating the area of receiver operating characteristic curveroc under the operating characteristic curve of the subjects. Results: the average methylation level of 6 LMX1A loci in cervical cancer was 14.36, which was significantly higher than that of 4.70% in HG-CIN and 4.53% in NLM. PAX1 gene 9 was found in cervical cancer. The average methylation level of each locus was 41.97, which was significantly higher than that of HG-CIN (10.21%), and the latter was significantly higher than that of LG-CIN (5.55%) and NLM (4.92%). The areas under ROC curve of detecting LMX1A gene methylation and PAX1 gene methylation were 0.603P0.104) and 0.883mP0.001g respectively. The optimum methylation level of PAX1 gene was calculated by ROC curve. The sensitivity and specificity of PAX1 gene methylation level were 81 and 933, respectively. When the methylation level of PAX1 gene was 9.58, the sensitivity was 81 and the specificity was 93.When the methylation level of PAX1 gene was 9.58, Its sensitivity in detecting invasive cervical carcinoma is 89 and the specificity is 84. Conclusion: quantitative analysis of PAX1 gene methylation in cervical tissue may be used as a molecular marker for differential diagnosis of invasive carcinoma. The clinical value of methylation detection of LMX1A gene is limited.
【作者單位】: 復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院婦瘤科 復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院腫瘤學(xué)系;復(fù)旦大學(xué)附屬閔行醫(yī)院婦產(chǎn)科;上海市計(jì)劃生育科學(xué)研究所;
【基金】:上海市衛(wèi)生局科研課題計(jì)劃(20114152)
【分類號(hào)】:R737.33
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,本文編號(hào):1661575
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