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胰島因子1基因多態(tài)性與先天性心臟病的相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2017-10-02 08:31

  本文關(guān)鍵詞:胰島因子1基因多態(tài)性與先天性心臟病的相關(guān)性研究


  更多相關(guān)文章: 先天性心臟病 ISL1基因 單核苷酸多態(tài)性 單體型 兒童


【摘要】:目的: 探討心臟發(fā)育相關(guān)基因胰島因子1(Isletl, ISL1) SNP位點(diǎn)(rs41268421、 rs1017)與先天性心臟病(Congenital Heart Disease, CHD)的相關(guān)性,為闡明CHD的發(fā)生機(jī)制并進(jìn)行遺傳學(xué)干預(yù)提供理論依據(jù),為其他先天畸形的研究提供科學(xué)的方法。 方法: 1利用NCBI網(wǎng)站SNPs數(shù)據(jù)庫(kù)查找ISL1基因內(nèi)部和周圍所有SNPs,同時(shí)參考相關(guān)文獻(xiàn),確定所要研究的SNPs位點(diǎn)。 2采用病例-對(duì)照研究方法,選取2011年12月至2012年12月在天津市兒童醫(yī)院心內(nèi)科住院接受治療的35名CHD患兒納入本研究,其中男孩18例,女孩17例,男女之比為1.06:1,年齡7月至3歲,平均年齡23±6月;純壕螩HD的診斷標(biāo)準(zhǔn),具有典型的臨床癥狀,并經(jīng)心臟彩色超聲、心導(dǎo)管或手術(shù)證實(shí),其中室間隔缺損類型患兒18例,房間隔缺損類型患兒17例。來自我院同期外科收治的除外CHD的30名兒童作為對(duì)照組,其中男孩15例,女孩15例,男女之比為1:1,年齡6月至3歲,平均年齡22±9月,經(jīng)心臟彩色超聲明確未患有CHD。采集所有研究對(duì)象的外周靜脈血2ml,枸櫞酸鈉抗凝,于-80℃保存?zhèn)溆谩?3基因測(cè)序并評(píng)價(jià)SNP位點(diǎn)和CHD的相關(guān)性。從血液中提取DNA,應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)聯(lián)合直接基因測(cè)序技術(shù)對(duì)研究對(duì)象的ISL1基因SNPrs41268421、rs1017多態(tài)性進(jìn)行檢測(cè)。分別比較兩個(gè)SNP位點(diǎn)基因型頻率和等位基因頻率在兩組的分布情況,并進(jìn)行單體型分析。 結(jié)果: 1ISLl基因SNP位點(diǎn)rs41268421存在GG、GT、TT3種基因型,CHD組攜帶T等位基因的基因型(包括GT和TT)頻率與對(duì)照組相比具有明顯的差異,差異顯著(χ2=4.169,P0.05),并且CHD組攜帶T等位基因的基因型頻率高于對(duì)照組。攜帶T等位基因的兒童患CHD的危險(xiǎn)是G等位基因的4.833倍。 2ISL1基因SNP位點(diǎn)rsl017存在AA、AT、TT3種基因型,CHD組攜帶T等位基因的基因型(包括AT和TT)頻率與對(duì)照組相比具有明顯的差異,差異顯著(χ2=6.807,P0.01),并且CHD組攜帶T等位基因的基因型頻率高于對(duì)照組。攜帶T等位基因的兒童患CHD的危險(xiǎn)是A等位基因的4.491倍。 3對(duì)ISL1基因SNPrs41268421、rs1017這兩個(gè)位點(diǎn)單體型進(jìn)行分析,共檢出4種單體型,分別是GA、GT、TA、TT,其中表現(xiàn)TT單體型的兒童患CHD的危險(xiǎn)度最高(OR=7.813)。 結(jié)論: 1ISL1基因SNP rs41268421、rs1017位點(diǎn)多態(tài)性可能與中國(guó)漢族兒童CHD易感性相關(guān)。 2ISL1基因SNPrs41268421位點(diǎn)等位基因T可能為中國(guó)漢族兒童患CHD的危險(xiǎn)因素。 3ISL1基因SNPrs1017位點(diǎn)等位基因T可能增加中國(guó)漢族患兒童患CHD的危險(xiǎn)性。 4對(duì)ISL1基因SNPrs41268421、rs1017兩位點(diǎn)進(jìn)行單體型分析,得出在這兩個(gè)位點(diǎn)表現(xiàn)TT型的兒童具有較高的患先天性心臟病的風(fēng)險(xiǎn)。
【關(guān)鍵詞】:先天性心臟病 ISL1基因 單核苷酸多態(tài)性 單體型 兒童
【學(xué)位授予單位】:天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R725.4
【目錄】:
  • 中文摘要4-6
  • Abstract6-10
  • 縮略語/符號(hào)說明10-12
  • 前言12-16
  • 研究現(xiàn)狀、成果12-14
  • 研究目的、方法14-16
  • 1 對(duì)象和方法16-27
  • 1.1 研究對(duì)象16-17
  • 1.2 實(shí)驗(yàn)原理17-19
  • 1.2.1 PCR的基本原理17-18
  • 1.2.2 單核苷酸多態(tài)性和單體型分析的原理18-19
  • 1.3 主要儀器設(shè)備及實(shí)驗(yàn)試劑19-22
  • 1.3.1 主要儀器設(shè)備19-20
  • 1.3.2 主要實(shí)驗(yàn)試劑20-22
  • 1.4 血液標(biāo)本的采集和處理22
  • 1.5 血液基因組DNA提取22
  • 1.6 基因組DNA的鑒定22
  • 1.7 引物準(zhǔn)備22-23
  • 1.8 PCR擴(kuò)增23-24
  • 1.9 2%瓊脂糖凝膠電泳判斷PCR產(chǎn)物24-25
  • 1.10 質(zhì)量控制25
  • 1.11 PCR產(chǎn)物測(cè)序及測(cè)序圖的分析25-26
  • 1.12 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析26-27
  • 2 結(jié)果27-31
  • 2.1 DNA質(zhì)量的鑒定27
  • 2.2 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的鑒定27
  • 2.3 病例組-對(duì)照組ISL1基因SNPrs41268421、rs1017測(cè)序結(jié)果27-29
  • 2.4 統(tǒng)計(jì)結(jié)果29
  • 2.4.1 Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)29-31
  • 2.4.2 CHD病例組與對(duì)照組等位基因與基因型頻率分布的比較29-30
  • 2.4.3 單體型分析30-31
  • 3 討論31-37
  • 3.1 簡(jiǎn)述先天性心臟病31-32
  • 3.2 單核苷酸多態(tài)性的研究進(jìn)展32-33
  • 3.3 ISL1基因與先天性心臟病33-37
  • 結(jié)論37-38
  • 研究不足及展望38-39
  • 參考文獻(xiàn)39-43
  • 發(fā)表論文和參加科研情況說明43-44
  • 附錄44-47
  • 綜述47-62
  • 綜述參考文獻(xiàn)58-62
  • 致謝62

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前6條

1 陳新民;;先天性心臟病的病因-基因突變與染色體異常[J];中國(guó)全科醫(yī)學(xué);2006年16期

2 王俊,袁婺洲,吳秀山;鋅指蛋白與心臟發(fā)育[J];生命科學(xué)研究;2003年S1期

3 夏慧蘇;余細(xì)勇;;NKX2.5基因的表觀遺傳學(xué)改變與先天性心臟病的關(guān)系[J];實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志;2009年24期

4 彭凌湘;馬維紅;陳盛智;游輝蘭;;母體血漿中游離胎兒DNA檢測(cè)在產(chǎn)前診斷和產(chǎn)科臨床領(lǐng)域中的應(yīng)用[J];微創(chuàng)醫(yī)學(xué);2009年06期

5 諶琛,惠汝太;心臟特異轉(zhuǎn)錄因子及其對(duì)心臟發(fā)育和心臟基因的調(diào)控[J];中國(guó)分子心臟病學(xué)雜志;2005年03期

6 劉群;陳利軍;譚學(xué)瑞;;apoE基因型與心腦血管病的前瞻性研究[J];中國(guó)分子心臟病學(xué)雜志;2009年03期

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本文編號(hào):958577

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