本文關(guān)鍵詞：伴童年創(chuàng)傷抑郁癥患者DNA甲基化譜研究

  更多相關(guān)文章： 童年期創(chuàng)傷 抑郁癥 DNA甲基化 MeDIP-seq測(cè)序

【摘要】：目的：本研究利用全基因組DNA甲基化測(cè)序技術(shù),探討DNA甲基化修飾改變與童年創(chuàng)傷和抑郁癥之間的關(guān)系,初步了解DNA甲基化在童年創(chuàng)傷和抑郁癥機(jī)制中的作用。 方法：本研究分為伴童年創(chuàng)傷抑郁癥患者組、不伴童年創(chuàng)傷抑郁癥患者組、伴童年創(chuàng)傷健康成人組和不伴童年創(chuàng)傷健康對(duì)照組共四組,每組各3例。分別抽提各樣本外周血組織中的基因組DNA,并采用MeDIP-Seq (Methylated DNA Immunoprecipitation sequencing)測(cè)序技術(shù)進(jìn)行DNA甲基化測(cè)序。 結(jié)果：通過(guò)運(yùn)用MeDIP-seq測(cè)序技術(shù),本階段獲得測(cè)序深度足夠和高分辨率的外周血全基因組DNA甲基化譜。本次測(cè)序結(jié)果的整體原始數(shù)據(jù)高達(dá)60Gb,組間比較、GO (gene ontology)功能分析和Pathway分析后整體數(shù)據(jù)約80Gb。根據(jù)分析伴童年創(chuàng)傷抑郁癥患者組與伴童年創(chuàng)傷健康成人組相比呈低甲基化改變的基因有11,623個(gè),呈高甲基化改變的基因有12,772個(gè)。伴童年創(chuàng)傷抑郁癥患者組與不伴童年創(chuàng)傷抑郁癥患者組相比呈低甲基化改變的基因有12,838個(gè),呈高甲基化改變的基因有12,709個(gè)。伴童年創(chuàng)傷健康成人組和不伴童年創(chuàng)傷健康對(duì)照組相比呈低甲基化改變的基因有12,228個(gè),呈高甲基化改變的基因有12,664個(gè)。不伴童年創(chuàng)傷抑郁患者組和不伴童年創(chuàng)傷健康對(duì)照組相比呈低甲基化改變的基因有12,039個(gè),呈高甲基化改變的基因有13,661個(gè)。GO分析顯示甲基化異常改變明顯的基因類型包括：生物進(jìn)程的(biological process)中的生物調(diào)節(jié)、細(xì)胞生理過(guò)程、代謝過(guò)程、生物過(guò)程的調(diào)節(jié)、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程；細(xì)胞組分(cellular component)部分改變主要集中在細(xì)胞構(gòu)架、細(xì)胞器；在分子功能(molecular function)部分主要集中在分子結(jié)合、催化活性等。 結(jié)論：本次研究發(fā)現(xiàn)童年創(chuàng)傷和抑郁癥中均存在DNA甲基化修飾的改變,表明DNA甲基化修飾的改變可能與童年創(chuàng)傷和抑郁癥的發(fā)生有一定的關(guān)系。
【關(guān)鍵詞】：童年期創(chuàng)傷 抑郁癥 DNA甲基化 MeDIP-seq測(cè)序
【學(xué)位授予單位】：中南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號(hào)】：R749.4
【目錄】：

• 摘要5-7
• Abstract7-9
• 目錄9-10
• 符號(hào)說(shuō)明10-11
• 1 前言11-15
• 1.1 童年創(chuàng)傷與抑郁癥12
• 1.2 甲基化的生物學(xué)機(jī)制及相關(guān)測(cè)序技術(shù)12-13
• 1.3 甲基化在童年創(chuàng)傷抑郁癥研究中的進(jìn)展13-14
• 1.4 研究假設(shè)和目的14-15
• 2 研究設(shè)計(jì)與方法15-27
• 2.1 研究對(duì)象15-17
• 2.2 主要儀器及試劑17-18
• 2.3 實(shí)驗(yàn)方法18-26
• 2.4 信息分析26-27
• 3 結(jié)果27-46
• 3.1 分組情況27
• 3.2 DNA抽提結(jié)果27-28
• 3.3 數(shù)據(jù)處理28-31
• 3.4 標(biāo)準(zhǔn)信息分析31-46
• 4 討論46-49
• 5 結(jié)論49-50
• 參考文獻(xiàn)50-54
• 攻讀學(xué)位期間的研究成果54-55
• 致謝55-56

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 孫玉紅;任美萍;張開蓮;劉明華;肖順漢;;積雪草提取物對(duì)抑郁模型動(dòng)物行為的影響[J];中國(guó)生化藥物雜志;2014年01期

2 郭曉惠;馮磊光;;精神分裂癥的表觀遺傳學(xué)研究進(jìn)展[J];疑難病雜志;2014年12期

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 鄒華鋒;仔豬肝臟糖皮質(zhì)激素受體基因表達(dá)的品種差異及其轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

2 梁云生;STAT5/TET2調(diào)控單核細(xì)胞FCER1G基因啟動(dòng)子DNA甲基化的分子機(jī)制及其在特應(yīng)性皮炎發(fā)病中的作用[D];中南大學(xué);2013年

3 齊薪蕊;抑郁癥患者前額葉中情感調(diào)節(jié)相關(guān)信號(hào)通路紊亂的分子基礎(chǔ)[D];中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué);2013年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 姜宇懋;人參的神經(jīng)細(xì)胞保護(hù)活性及其機(jī)制研究[D];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年

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本文編號(hào)：855420