本文關鍵詞：兒童噬血細胞綜合征的PRF1和UNC13D基因內(nèi)含子變異的研究

  更多相關文章： 噬血細胞綜合征 PRF1 UNC13D 內(nèi)含子 兒童

【摘要】：目的：了解噬血細胞綜合征患兒的PRF1和UNC13D基因內(nèi)含子是否存在變異,初步探討內(nèi)含子變異型與兒童噬血細胞綜合征是否存在相關性。方法：(1)收集2009年1月2013年5月來自廣西、廣州、武漢、蘇州確診為噬血細胞綜合征的48例患兒,經(jīng)基因檢測PRF1和UNC13D基因外顯子變異陰性(HLH組)。對照組為50名門診健康體檢的正常兒童。(2)應用PCR分段擴增HLH組和對照組兒童的PRF1和UNC13D基因的內(nèi)含子,直接測序后分別與基因庫的人類PRF1和UNC13D基因序列進行比對。結(jié)果：(1)在48例HLH患兒PRFl基因內(nèi)含子發(fā)現(xiàn)4個單核苷酸多態(tài)性位點(SNIP)：g.5179de1G (rs55974750)25例(52.08%)、g.5452CT(rs3758562)46例(95.83%)、g.5936TC (rs6480460)47例(97.91%)、g.7745TC (rs80019657)10例(20.83%),其在HLH組和對照組中的等位基因頻率差別均無統(tǒng)計學意義(P0.05)。此外,2個SNP位點g.7494CT(rs10999426)和g.7473GA(rs 10999427)僅在2例正常兒童中發(fā)現(xiàn)(4%),它們在HLH組和對照組的等位基因頻率亦無統(tǒng)計學差別((P0.05)。連鎖不平衡分析提示rs10999426和rs10999427緊密連鎖(D,=1,r2=1),但其構(gòu)建的單體型在HLH組和對照組中的分布差異無統(tǒng)計學意義(P0.05)。(2)在UNC13D基因內(nèi)含子共發(fā)現(xiàn)20個SNP位點：g.5527GA(rs3744011)29例(60.4%)、g.5556CT(rs3744010)8例(16.7%)、g.6301CT(rs9903200)10例(20.8%)、g.6433GA(rs3744009)10例(20.8%).g.585CG. (rs3744008)7例(14.6%).g.6628GA(rs142996967)2例(4.2%).g.6942GA (rs11870883)8例(16.7%).g.6983CT(rs3744006)35例(72.9%)、g.8657TG (rs8067076)29例(60.4%).g.8825CA(rs6501838)2例(4.2%)、g.9072GA (rs7208603)2例(4.2%).g.9358CT(rs7226310)1例(2.1％).g.9381CT (rs201406035)2例(4.2%).g.13899AG(rs3744026)26例(54.2%)、 g.14141 TC(rs3744024)27例(56.3%).g.14803GA(rs17581728)7例 (14.6%). g.15529CT (rs7212635)28 例 (58.3%). g.16806CT (rs113796451)5例(10.4%).g.19188CT(rs2290768)28例0(58.3%)、 g.19393CG(rs2290769)9例(18.8%).其中rs8067076在HLH組和對照組的等位基因頻率差異有統(tǒng)計學意義(P=0.0460.05)。連鎖不平衡分析提示rs6501838和rs7208603緊密連鎖(D=1,r2=1),其等位基因頻率和構(gòu)建的單體型在HLH組和對照組的分布差異無統(tǒng)計學意義(P0.05)。余17個SNP位點在HLH組和對照組的等位基因分布差異均無統(tǒng)計學意義(P值均0.05)。此外,4例患兒在內(nèi)含子1各發(fā)現(xiàn)一種堿基變異型：IVS1+238CT、IVS1+394CT.IVS1+466GA,IVSl+498CA,6例患兒在內(nèi)含子29發(fā)現(xiàn)同一個堿基變異型IVS29+62AT,均為雜合子,在對照組中未發(fā)現(xiàn),其在HLH組和對照組的等位基因頻率分布差異有統(tǒng)計學意義(P=0.0340.05)。結(jié)論：(1)PRF1基因內(nèi)含子的4個SNP和UNC13D基因內(nèi)含子的1勺個SNP在HLH組和對照組的等位基因分布無顯著性差異,與兒童HLH發(fā)病相關性不大；(2)PRF1基因內(nèi)含子的2個SNP(rs10999426和rs10999427)存在連鎖不平衡關系,其構(gòu)建的A-T單體型雖僅在正常組中發(fā)現(xiàn),但發(fā)生率低,可能并不是HLH的保護性因素。而UNC13D基因內(nèi)含子的1個SNP(rs8067076)可能是HLH的一種保護因素。(3)在UNC13D基因深度內(nèi)含子發(fā)現(xiàn)1個已報道的致病性內(nèi)含子突變型IVS1+394CT和4個新的內(nèi)含子變異型IVS1+238CT、IVS1+466GA、 IVS1+498CA、IVS29+62AT,發(fā)生率低,后者是否與HLH有關尚有待進一步研究探討。
【關鍵詞】：噬血細胞綜合征 PRF1 UNC13D 內(nèi)含子 兒童
【學位授予單位】：廣西醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：R725.5
【目錄】：

• 個人簡歷3-5
• 摘要5-8
• ABSTRACT8-11
• 前言11-13
• 第一部分 兒噬血細胞綜合征的PRF1基因內(nèi)含子變異的研究13-25
• 材料與方法13-18
• 1.實驗材料13-14
• 2.研究對象14-15
• 3.實驗方法15-18
• 結(jié)果18-23
• 1.病例資料18
• 2. PGR產(chǎn)物測序結(jié)果及統(tǒng)計分析18-23
• 討論23-25
• 第二部分兒童噬血細胞綜合征的UNC13D基因內(nèi)含子變異的研究25-44
• 材料與方法25-27
• 1.實驗材料和研究對象25
• 2.實驗方法25-27
• 結(jié)果27-38
• 討論38-44
• 結(jié)論44-45
• 參考文獻45-50
• 附錄50-51
• 綜述51-61
• 參考文獻56-61
• 致謝61-62
• 碩士研究生在讀期間發(fā)表的論文62

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 陸文嫻;羅建明;;兒童噬血細胞性淋巴組織細胞增生癥的預后因素分析[J];中國當代兒科雜志;2012年08期

，

本文編號：785331