重癥手足口病患兒腸道病毒71型的檢測及基因特征分析
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【摘要】:目的 對2012年手足口病流行期間天津市兒童醫(yī)院收治入院的重癥手足口病(HFMD)患兒進行病原學分析,了解重癥病例腸道病毒71型(EV71)的檢出和其他病原體的流行趨勢變化,探討不同臨床標本及IgM抗體檢測對于EV71感染的早期診斷價值,同時通過VP1全基因擴增了解EV71流行株的的型別和基因特征,為天津市EV71病毒毒株的基因庫及其分子流行病學研究補充資料,為本地區(qū)重癥手足口病的監(jiān)測、治療和預后提供參考。 方法 以2012年7月至9月天津市兒童醫(yī)院收治入院的98例重癥手足口病患兒為研究對象,收集臨床標本共188份,包括咽拭子79份,糞便86份,腦脊液23份,其中67例患兒同時留取咽拭子和糞便標本。整理患兒臨床資料,提取病毒核酸,采用三通道一步法實時熒光RT-PCR檢測總腸道病毒(EV)、腸道病毒71型(EV71)和柯薩奇病毒A組16(CA16),同時采用ELISA法檢測患者血清中的EV71特異性IgM抗體。然后從EV71陽性標本中選取部分病例進行EV71的VP1全基因擴增,并進行核苷酸序列比對和遺傳進化分析。 結(jié)果 98例重癥HFMD患兒中EV71的陽性率為60.2%(59/98);CA16的陽性率為10.2%(10/98);非EV71非CA16的其他類型腸道病毒(NENC)占16.3%(16/98);EV總陽性率為82.7%(81/98),同時有4例患兒為EV71和CA16雙陽性。本組重癥病例中男女性患兒的比例大約為2:1,二者的腸道病毒檢出率無顯著統(tǒng)計學差異。5歲以下的患兒占95.9%,75.5%在6個月到2歲之間,不同年齡組患兒的腸道病毒檢出率差異無統(tǒng)計學意義。糞便標本的腸道病毒陽性率顯著高于咽拭子標本,分別為82.6%和53.2%。23份腦脊液標本中均未檢測到腸道病毒核酸。ELISA法檢測的血清EV71IgM抗體陽性率為70.4%,高于熒光RT-PCR檢測的病毒核酸陽性率(60.2%)。16株EV71VPl全基因序列的遺傳進化分析表明本研究中的EV71毒株屬于C4a亞型。 結(jié)論 1、2012年天津市重癥手足口病的病原體以EV71為主,其次是EV71和CA16以外的其他腸道病毒。 2、重癥手足口病的易感人群為5歲以下的兒童,尤其是2歲以下患兒,應警惕幼齡兒童發(fā)展為重癥的可能,但是腸道病毒檢出率無明顯性別和年齡差異。 3、糞便標本的病毒檢出率高于咽拭子,檢測結(jié)果更穩(wěn)定,更適合做病原學檢測以輔助疾病的早期診斷,腦脊液中不易檢測到病毒。 4、ELISA法IgM抗體檢測操作簡單、快速經(jīng)濟,能夠滿足基層醫(yī)療機構(gòu)EV71感染的防控需求。 5、2012年度天津市導致重癥手足口病的EV71優(yōu)勢毒株為C4a基因亞型。
【關(guān)鍵詞】:手足口病 腸道病毒71型 熒光RT-PCR IgM抗體 基因型 兒童
【學位授予單位】:天津醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R725.1
【目錄】:
- 中文摘要4-6
- Abstract6-10
- 縮略語/符號說明10-11
- 前言11-14
- 研究現(xiàn)狀、成果11-12
- 研究目的、方法12-14
- 一、腸道病毒的鑒定與分型14-25
- 1.1 對象和方法14-18
- 1.1.1 研究對象14-15
- 1.1.2 主要儀器和試劑15
- 1.1.3 方法和步驟15-18
- 1.1.4 統(tǒng)計學分析18
- 1.2 結(jié)果18-21
- 1.2.1 腸道病毒熒光RT-PCR檢測結(jié)果18-19
- 1.2.2 不同性別、年齡兒童腸道病毒檢出率的比較19-20
- 1.2.3 不同標本腸道病毒的檢出情況20-21
- 1.2.4 腸道病毒71型的IgM抗體檢測結(jié)果21
- 1.2.5 臨床資料分析21
- 1.3 討論21-24
- 1.3.1 重癥手足口病的病原學特征21-22
- 1.3.2 重癥手足口病的易感人群分析22-23
- 1.3.3 不同臨床標本對于疾病早期診斷的價值23-24
- 1.3.4 腸道病毒快速檢測方法的評價24
- 1.4 小結(jié)24-25
- 二、腸道病毒71型的VP1基因特征分析25-32
- 2.1 對象和方法25-27
- 2.1.1 研究對象25
- 2.1.2 主要儀器和試劑25-26
- 2.1.3 方法和步驟26-27
- 2.2 結(jié)果27-29
- 2.2.1 腸道病毒71型VP1基因擴增27
- 2.2.2 序列同源性比對分析27-28
- 2.2.3 系統(tǒng)進化分析28-29
- 2.3 討論29-31
- 2.4 小結(jié)31-32
- 結(jié)論32-33
- 參考文獻33-39
- 發(fā)表論文和參加科研情況說明39-40
- 附錄40-43
- 綜述43-69
- 綜述參考文獻56-69
- 致謝69
【參考文獻】
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,本文編號:758652
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