本文關(guān)鍵詞：ORMDL3基因單核苷酸多態(tài)性與寧波兒童哮喘發(fā)病的關(guān)聯(lián)性的研究

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【摘要】：背景與目的 哮喘是當今世界最常見的慢性疾病之一。近20年來,哮喘發(fā)病率和死亡率持續(xù)增加,目前仍以每10年20%-50%的比例增長。哮喘是一種氣道慢性炎癥性疾病,其發(fā)生與發(fā)展主要由遺傳因素與環(huán)境因素相互作用的結(jié)果,遺傳因素對哮喘的相對作用為36～79%。目前國內(nèi)、外學者通過對人群哮喘相關(guān)基因篩選定位及其多態(tài)性的研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn)與人類哮喘有關(guān)的候選基因有261個,分布在22對常染色體和1對性染色體上,涉及的基因及單核苷酸多態(tài)性(SNPs)眾多,國內(nèi)外對相關(guān)基因的研究結(jié)果多有不一。Moffatt等人發(fā)表于自然期刊(Nature)的哮喘基因組相關(guān)研究(genome-wide associaton, GWAS)發(fā)現(xiàn)血清類粘蛋白1樣蛋白3(ORMDL3)基因是哮喘的易感基因,rs7216389基因型的多型性(polymorphism)與兒童哮喘的發(fā)作有關(guān)。目前國內(nèi)關(guān)于該基因位點單核苷酸多態(tài)性(single-nucleotide polymorphism, SNP)的相關(guān)研究報道較少,迄今未見寧波地區(qū)的相關(guān)報道。 本項目擬采用聚合酶鏈反應以及DNA測序方法,分析寧波地區(qū)哮喘兒童ORMDL3基因的SNPs,以期能夠明確該基因與寧波地區(qū)兒童哮喘發(fā)病的關(guān)聯(lián)性。主要是ORMDL3基因中rs7216389、rs4378650以及rs11650680位點SNPs與寧波地區(qū)兒童哮喘發(fā)病的關(guān)聯(lián)性。希望能夠進一步推動寧波地區(qū)兒童哮喘的防治。 材料與方法 從2011年10月到2012年10月共收集在寧波市北侖區(qū)人民醫(yī)院就診的兒童哮喘患者150例,符合((2008中國兒童哮喘指南》臨床診斷標準,包括初次診斷以及復診病例,均為寧波本地人口。其中男性82例,女性68例,平均年齡6.6±1.7歲。同期收集當時在寧波北侖區(qū)人民醫(yī)院住院的非呼吸道疾病患兒,排除既往有反復咳嗽、喘息病史的患兒,均為寧波本地人口,作為對照組,共150例,其中男性80例,女性70例,平均年齡7.54-1.3歲。由監(jiān)護人簽署知情同意書,并報告醫(yī)院倫理委員會備案。采集血液標本,應用DNA抽提試劑盒提取實驗對象的基因組,采用聚合酶鏈反應(PCR)技術(shù)以及DNA測序方法對150例兒童哮喘患者ORMDL3基因多態(tài)性進行觀察,并與150例對照組進行對比。對兩組ORMDL3基因中rs7216389、rs4378650以及rs11650680位點等位基因頻率、基因型以及等位基因分布頻率進行統(tǒng)計學分析比較。 本研究主要采用SPSS13.0軟件進行分析。按照Hardy-Weiberg平衡法檢測樣本的群體代表性。組間基因型及等位基因頻率等技術(shù)資料采用卡方檢驗,P0.05為統(tǒng)計學有差異。 結(jié)果 1.哮喘組和對照組之間的性別、年齡無統(tǒng)計學差異,具有可比性。 2.哮喘組和對照組之間ORMDL3基因中rs7216389位存在三種基因型,即TT,TC和CC.ORMDL3基因rs7216389位點各基因型頻率在哮喘組和對照組相比,差異有統(tǒng)計學意義(P0.05)。進一步分析發(fā)現(xiàn),ORMDL3基因rs7216389位點C和T等位基因分布頻率存在顯著性差異(P0.05)。 3.哮喘組和對照組之間ORMDL3基因中rs4378650位點存在三種基因型TT,TC,CC,哮喘組合對照組相比,ORMDL3基因rs4378650位點基因型分布頻率存在統(tǒng)計學差異(P0.05)。并且此位點等位基因C和T的分布頻率存在顯著性差異(P0.05)。 4.哮喘組和對照組之間ORMDL3基因中rs11650680位均存在TT,TC和CC三種基因型。哮喘組和對照組相比,ORMDL3基因rs11650680位點基因型分布頻率存在統(tǒng)計學差異(P0.05)。此外,rs11650680位點C和T等位基因分布頻率存在顯著性差異(P0.05)。 結(jié)論 ORMDL3基因中rs7216389、rs4378650以及rs11650680位點具有單核苷酸多態(tài)性(SNPs),其位點多態(tài)性與寧波地區(qū)兒童哮喘的發(fā)病有相關(guān)性。
【關(guān)鍵詞】：ORMDL3 基因多態(tài)性 兒童哮喘
【學位授予單位】：浙江大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2014
【分類號】：R725.6
【目錄】：

• 致謝4-5
• 中文摘要5-8
• Abstract8-11
• 縮略詞表11-12
• 目次12-14
• 1 前言14-19
• 2 材料與方法19-27
• 2.1 病例診斷標準19-20
• 2.2 哮喘組和對照組的來源20
• 2.3 主要儀器與試劑20-21
• 2.4 實驗方法21-26
• 2.5 統(tǒng)計學處理26-27
• 3 結(jié)果27-37
• 3.1 一般資料27
• 3.2 ORMDL3基因rs7216389位點PCR反應產(chǎn)物及DNA測序結(jié)果判定27-29
• 3.3 ORMDL3基因rs7216389位點基因型頻率分布29-30
• 3.4 ORMDL3基因rs4378650位點PCR擴增產(chǎn)物及DNA測序結(jié)果判定30-32
• 3.5 ORMDL3基因rs4378650位點基因型及等位基因分布32-33
• 3.6 ORMDL3基因rs11650680位點PCR擴增產(chǎn)物及DNA測序結(jié)果判定33-35
• 3.7 ORMDL3基因rs11650680位點基因型及等位基因分布35-36
• 3.8 ORMDL3基因不同位點S1(rs7216389)、S2(rs4378650)S3(rs11650680)之間單倍體分析36-37
• 4 討論37-41
• 4.1 基因多態(tài)性概念及其意義37
• 4.2 ORMDL3基因與哮喘37-41
• 5 結(jié)論41-42
• 參考文獻42-47
• 綜述47-59
• 參考文獻53-59
• 作者簡歷及在學期間所取得的科研成果59-60

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