本文關(guān)鍵詞：NLGN3基因與泰巴山區(qū)兒童精神發(fā)育遲滯相關(guān)性分析

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【摘要】：精神發(fā)育遲滯(Mental retardation,MR)是在生命早期,由遺傳與環(huán)境因素共同作用所導(dǎo)致的綜合癥。我國貧困地區(qū)特別是中西部貧困地區(qū)發(fā)病率比較高,秦巴山區(qū)就是其中之一。因此,深入研究該地區(qū)MR形成的遺傳病因,對建立有效的遺傳監(jiān)控措施具有重要的意義。 本研究以先期研究為基礎(chǔ),在課題組初步發(fā)現(xiàn)的染色體區(qū)段Xq12-Xq23之中選擇了其中的NLGN3基因,采用病例-對照樣本,對NLGN3基因與該地區(qū)MR的相關(guān)性進(jìn)行了探討。NLGN3基因編碼神經(jīng)細(xì)胞表面蛋白家族成員中的一種,該蛋白家族的成員可以作為β-細(xì)胞黏附因子的一種配體,并且涉及到中樞神經(jīng)系統(tǒng)中突觸的形成和重塑,進(jìn)而可能通過調(diào)節(jié)突觸間神經(jīng)信號傳導(dǎo)而與MR相關(guān)。 本研究在NLGN3基因上共選擇了6個SNPs標(biāo)記位點,采用PCR-SSCP結(jié)合測序結(jié)果,對187例MR兒童及213例對照組兒童的基因各位點進(jìn)行分型,進(jìn)而通過關(guān)聯(lián)分析法對兩組兒童各位點等位基因及基因型頻率分布的差異性進(jìn)行分析。結(jié)果如下： (1)除了rs4844287位點在中國人群中只有兩種型以外,其它的5個SNPs位點各等位基因和基因型頻率在不同性別兒童的分布中均無明顯差異。 (2)各位點單位點分析結(jié)果顯示rs11795613位點的等位基因頻率與基因型頻率在MR與對照組間均存在顯著性差異(P值分別為0.0009,0.006),Bonferroni校正后其顯著性依然存在,兩組兒童的其它5個標(biāo)記均未有顯著性差異(P0.05)。 (3)單倍型分析表明,rs5981077-rs11795613組成的單倍型塊和秦巴山區(qū)MR顯著相關(guān)(P=0.0004),經(jīng)校正后顯著性依然存在,與單位點分析結(jié)果一致。 本研究結(jié)果提示,NLGN3基因與秦巴山區(qū)兒童MR有關(guān),在該基因的rs1795613位點以及rs5981077-rs11795613單倍型塊所標(biāo)記的染色體區(qū)段中,可能存在著致病突變位點,需要做進(jìn)一步的檢測分析。
【關(guān)鍵詞】：NLGN3基因 精神發(fā)育遲滯 秦巴山區(qū) 關(guān)聯(lián)分析
【學(xué)位授予單位】：西北大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2013
【分類號】：R749.94;Q75
【目錄】：

• 中文摘要3-4
• Abstract4-6
• 目錄6-8
• 第一部分 理論8-23
• 1.1 精神發(fā)育遲滯綜述8-17
• 1.1.1 精神發(fā)育遲滯的定義8
• 1.1.2 精神發(fā)育遲滯的分級8-10
• 1.1.3 精神發(fā)育遲滯的病因10-13
• 1.1.4 精神發(fā)育遲滯的診斷13-15
• 1.1.5 精神發(fā)育遲滯的治療和預(yù)防方法15-17
• 1.2 秦巴山區(qū)MR概述17-19
• 1.2.1 秦巴山區(qū)基本情況和人群特點17-18
• 1.2.2 秦巴山區(qū)MR的患病情況及病因分析18-19
• 1.3 MR的遺傳學(xué)研究19-23
• 1.3.1 連鎖分析與關(guān)聯(lián)分析19-20
• 1.3.2 Hardy-Weinberg平衡20-21
• 1.3.3 單倍型分析21
• 1.3.4 大規(guī)模關(guān)聯(lián)分析中要注意的問題21-23
• 第二部分 實驗設(shè)計與實現(xiàn)23-35
• 2.1 候選基因的選取23-24
• 2.1.1 候選基因的選取23-24
• 2.1.2 NLGN3基因情況介紹24
• 2.2 遺傳標(biāo)記的選擇24-29
• 2.2.1 本研究所選擇的遺傳標(biāo)記24-25
• 2.2.2 NLGN3基因上SNP的選擇25-29
• 2.3 實驗材料與方法29-35
• 2.3.1 研究對象29
• 2.3.2 實驗主要儀器設(shè)備及試劑29
• 2.3.3 樣品的采集及保存29-30
• 2.3.4 基因組DNA的提取30
• 2.3.5 目標(biāo)片段的獲取30-31
• 2.3.6 瓊脂糖電泳檢測31
• 2.3.7 PAGE電泳分型31-33
• 2.3.8 數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析33-35
• 第三部分 結(jié)果及其分析35-52
• 3.1 NLGN3基因的各個SNP分型情況35-42
• 3.1.1 rs7886134位點的基因分型結(jié)果35-36
• 3.1.2 rs11795613位點的基因分型結(jié)果36-37
• 3.1.3 rs5981077位點的基因分型結(jié)果37-39
• 3.1.4 rs7051529位點的基因分型結(jié)果39-40
• 3.1.5 rs4844285位點的基因分型結(jié)果40-41
• 3.1.6 rs4844287位點的基因分型結(jié)果41-42
• 3.2 NLGN3基因各個SNP標(biāo)記的遺傳學(xué)檢驗42-52
• 3.2.1 各個基因型頻率的地域分布43-44
• 3.2.2 哈德-溫伯格平衡檢驗44-45
• 3.2.3 各SNP等位基因頻率分布的性別差異45-46
• 3.2.4 單位點等位基因頻率與MR的關(guān)聯(lián)分析46-47
• 3.2.5 各個位點基因型的組間分布47-48
• 3.2.6 NLGN3基因六個SNP位點的連鎖不平衡檢測結(jié)果48-49
• 3.2.7 單倍型分析49-51
• 3.2.8 統(tǒng)計效力分析51-52
• 第四部分 討論52-54
• 參考文獻(xiàn)54-59
• 附錄59-63
• 致謝63

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前9條

1 陳建樹;劉躍琴;劉筱英;陽偉紅;劉麗君;;家長參與對兒童精神發(fā)育遲滯康復(fù)訓(xùn)練效果的影響[J];當(dāng)代護(hù)士(專科版);2010年01期

2 張富昌,李瑞林,高曉彩,鄭子健,黃紹平,宋合義,席恒,李芬;秦巴山區(qū)(寧強、柞水、安康試驗區(qū))0～14歲兒童精神發(fā)育遲滯患病狀況調(diào)查[J];第四軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報;2004年06期

3 龔耀先,戴曉陽;韋氏智力量表的簡式用法[J];湖南醫(yī)學(xué)院學(xué)報;1984年04期

4 王s，

本文編號：692560