本文關(guān)鍵詞：昆明市嬰幼兒腹瀉病毒分子流行病學(xué)及星狀病毒特性的研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：嬰幼兒腹瀉病在我國兒童多發(fā)病、常見病中排第二位,在發(fā)展中國家及發(fā)達(dá)國家的發(fā)病率較高,疾病嚴(yán)重程度各不相同。腹瀉可由多種病原體引起,包括寄生蟲、細(xì)菌和病毒等,約72%嬰幼兒腹瀉是由病毒引起的。本文主要選取人諾如病毒(human norovirus, HNV)、人星狀病毒(human astrovirus, HAstV)和人輪狀病毒(human rotavirus, HRV)三種常見的腹瀉病毒,對昆明地區(qū)嬰幼兒腹瀉進(jìn)行分子流行病學(xué)的研究。通過逆轉(zhuǎn)錄PCR (reverse transcription PCR, RT-PCR)法對HAstV全基因組進(jìn)行擴(kuò)增；并挑取12份HAstV陽性樣品擴(kuò)增HAstV的衣殼蛋白ORF2,以期對昆明地區(qū)嬰幼兒病毒性腹瀉進(jìn)行初步探討。首先,利用RT-PCR方法對63份嬰幼兒腹瀉樣品和42份非腹瀉樣品進(jìn)行檢測,檢測可知：HNV、HAstV、HRV陽性率分別為20.63%、41.27%和34.92%,對照組中未檢測出HNV和HRV感染,HAstV檢測出1例感染,感染率為2.38%。其次,利用RT-PCR對HAstV基因組擴(kuò)增,結(jié)果獲得6.8 kb的全長基因組,命名為KM-02。通過核苷酸比對、系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建發(fā)現(xiàn),KM-02與HQ398856同源性最高為98.2%,屬于HAstV1型。另外KM-02與昆明株KC342249同源性為88.7%,表明不同時(shí)間,流行的株系不同。最后,從檢測HAstV陽性的樣品中,通過RT-PCR的方法獲得12株不同序列的HAstV ORF2。對其進(jìn)行核酸及氨基酸的比對,并利用生物軟件和互聯(lián)網(wǎng)在線數(shù)據(jù)庫分析ORF2的理化參數(shù)等,最后分析發(fā)現(xiàn)該蛋白理化參數(shù)較穩(wěn)定,有較好的免疫原性。綜上,本實(shí)驗(yàn)對2013年-2014年昆明地區(qū)嬰幼兒病毒性腹瀉的分子流行病學(xué)進(jìn)行了調(diào)查和研究,豐富我國南方病毒性腹瀉的相關(guān)資料,對我國病毒性腹瀉感染、控制提供部分理論依據(jù)。對獲得HAstV的全基因組和12株HAstV的ORF2進(jìn)行研究和分析,為HAstV的檢測、疫苗研制、起源和病毒免疫逃逸等提供理論依據(jù)。
【關(guān)鍵詞】：嬰幼兒腹瀉 病毒 分子流行病學(xué) 星狀病毒 ORF2
【學(xué)位授予單位】：昆明理工大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：R725.1
【目錄】：

• 摘要6-7
• ABSTRACT7-14
• 英文縮略語索引14-15
• 第一章 緒論15-23
• 1.1 嬰幼兒腹瀉病15-16
• 1.1.1 嬰幼兒腹瀉病的起因15
• 1.1.2 嬰幼兒腹瀉病臨床癥狀15-16
• 1.2 諾如病毒16-17
• 1.2.1 諾如病毒的結(jié)構(gòu)及基因組特征16-17
• 1.2.2 諾如病毒基因的分型17
• 1.3 星狀病毒17-19
• 1.3.1 星狀病毒的結(jié)構(gòu)及基因組特征18
• 1.3.2 星狀病毒的衣殼蛋白18-19
• 1.3.3 星狀病毒基因的分型19
• 1.4 輪狀病毒19-21
• 1.4.1 輪狀病毒的結(jié)構(gòu)及基因組特征19-20
• 1.4.2 輪狀病毒基因的分型20-21
• 1.5 HNV、HASTV,、HRV的預(yù)防和治療21-22
• 1.5.1 HNV、HASTV、HRV的預(yù)防21
• 1.5.2 HNV、HASTV、HRV的治療21-22
• 1.6 本論文研究目的及意義22-23
• 第二章 昆明地區(qū)病毒性小兒腹瀉的分子流行病學(xué)分析23-50
• 2.1 材料和方法23-38
• 2.1.1 材料23-30
• 2.1.2 方法30-38
• 2.2 結(jié)果38-47
• 2.2.1 RT-PCR法檢測嬰幼兒腹瀉病毒38-43
• 2.2.2 昆明地區(qū)嬰幼兒腹瀉病毒的流行病學(xué)統(tǒng)計(jì)43-47
• 2.3 討論47-49
• 2.4 小結(jié)49-50
• 第三章 HASTV基因組的克隆50-64
• 3.1 材料和方法50-56
• 3.1.1 材料50-53
• 3.1.2 方法53-56
• 3.2 結(jié)果56-62
• 3.2.1 HASTV基因組的克隆56
• 3.2.2 HASTV基因組測序56-62
• 3.3 討論62-63
• 3.4 小結(jié)63-64
• 第四章 HASTV衣殼蛋白ORF2的特性64-80
• 4.1 材料和方法64-69
• 4.1.1 材料64-66
• 4.1.2 方法66-69
• 4.2 結(jié)果69-78
• 4.2.1 RT-PCR法檢測擴(kuò)增HASTV的ORF269-71
• 4.2.2 ORF2的核苷酸序列和氨基酸序列比對71-75
• 4.2.3 HASTVORF2的系統(tǒng)進(jìn)化分析75
• 4.2.4 HASTVORF2的理化性質(zhì)分析75-76
• 4.2.5 HASTVORF2二級結(jié)構(gòu)預(yù)測和分析76-78
• 4.3 討論78-79
• 4.4 小結(jié)79-80
• 第五章 全文總結(jié)80-82
• 第六章 展望82-83
• 致謝83-84
• 參考文獻(xiàn)84-89
• 附錄A 攻讀碩士期間發(fā)表論文及參與項(xiàng)目目錄89

【參考文獻(xiàn)】

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  本文關(guān)鍵詞：昆明市嬰幼兒腹瀉病毒分子流行病學(xué)及星狀病毒特性的研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：382578