目的:采用甲基化基因芯片技術(shù)從全基因組水平分析足月兒與早產(chǎn)兒臍血有核紅細(xì)胞DAN甲基化差異,篩選出可能與γ珠蛋白基因(HBG)表達(dá)相關(guān)的差異甲基化基因及生物信號(hào)通路。方法:收集足月產(chǎn)兒及早產(chǎn)兒各8例,取其臍血標(biāo)本,分離臍血有核紅細(xì)胞并提取基因組DNA,并對(duì)其進(jìn)行亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化。利用Illumina 850K甲基化芯片檢測(cè)2組樣本的DNA甲基化位點(diǎn)。篩選差異甲基化位點(diǎn),并通過(guò)GO和KEGG富集分析得到差異甲基化基因的功能。結(jié)果:相較于早產(chǎn)組,足月組共篩選到4 749個(gè)差異甲基化位點(diǎn),其中低甲基化位點(diǎn)4 359個(gè),高甲基化位點(diǎn)390個(gè)。GO和KEGG分析結(jié)果顯示,差異甲基化基因的功能主要涉及造血系統(tǒng)、生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程、Wnt和Notch信號(hào)通路等。結(jié)論:本研究獲得了足月組和早產(chǎn)組臍血有核紅細(xì)胞在全基因組水平的差異甲基化位點(diǎn),篩選出可能與γ→β珠蛋白基因表達(dá)轉(zhuǎn)換相關(guān)的通路和基因。這為后續(xù)進(jìn)一步研究HBG基因的表達(dá)調(diào)控機(jī)制提供了新的研究靶點(diǎn)。

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【文章目錄】：
材料和方法
    入組新生兒
    試劑與儀器
    臍血有核紅細(xì)胞分離及DNA提取
    850K甲基化芯片檢測(cè)
    統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
結(jié)果
    芯片實(shí)驗(yàn)質(zhì)控結(jié)果
    差異甲基化位點(diǎn)篩選結(jié)果
    差異甲基化位點(diǎn)的聚類分析結(jié)果
    差異基因的GO、KEGG富集分析
討論



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