肛門直腸畸形大鼠盆底肌發(fā)育異常的分子機(jī)制及其宮內(nèi)移植干細(xì)胞修復(fù)作用的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-12-17 01:22
目的:先天性肛門直腸畸形(Anorectal malformations,ARMs)是最常見的小兒消化道畸形,同時(shí)也是世界衛(wèi)生組織常規(guī)監(jiān)測的先天畸形之一,其發(fā)病率為1/5000~1/1500,居消化道畸形首位。研究至今,ARMs的病因仍不清晰,且病理類型及改變繁多而復(fù)雜。雖然手術(shù)方式不斷改進(jìn),總病死率及手術(shù)死亡率顯著下降,但是國內(nèi)外學(xué)者隨訪發(fā)現(xiàn),部分患兒術(shù)后仍存在不同程度的排便功能障礙,對患兒的生活質(zhì)量及心理健康造成不同程度的影響,給患兒家庭和社會(huì)帶來沉重的醫(yī)療負(fù)擔(dān)和經(jīng)濟(jì)壓力。便秘、便失禁等不良預(yù)后與畸形類型及伴發(fā)畸形,如盆底肌發(fā)育異常、盆底肌的支配神經(jīng)發(fā)育異常和骶尾椎發(fā)育不良等發(fā)育缺陷密切相關(guān)。在諸多因素中,盆底橫紋肌復(fù)合體(Striated Muscle Complex,SMC),是控制排便的關(guān)鍵因素之一,SMC中的肌肉神經(jīng)發(fā)育異常是影響AMRs患兒預(yù)后的重要原因之一。相關(guān)前期研究已證實(shí),ARMs患兒及實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型中均存在著不同程度的SMC發(fā)育異常。表現(xiàn)為肌纖維發(fā)育異常、肌梭發(fā)育異常與運(yùn)動(dòng)終板發(fā)育異常。胚胎期SMC的發(fā)育過程較為復(fù)雜,是諸多環(huán)境與遺傳因素共同作用的結(jié)果。參與其中的分...
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:153 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
E19天對照組與ARMs組SMC組織中差異mRNA的表達(dá)分析
lularcomponent);分子功能(molecularfunction);生物學(xué)途徑(biologicalprocess)。根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康暮Y選差異基因后,對差異表達(dá)基因進(jìn)行GO分類分析,研究差異基因在GO中的分布狀況,闡明實(shí)驗(yàn)中樣本差異在基因功能上的體現(xiàn)[50]。對差異基因和本實(shí)驗(yàn)中所有基因即背景基因在GO的二級水平進(jìn)行分類,得到差異基因及背景基因在每個(gè)二級條目的分布情況。從GO分析結(jié)果(圖3.2)可知,生物學(xué)途徑(biologicalprocess)層次占主要地位,其中占前五位的生物學(xué)過程如下:cellularprocess、singleorganismprocess、cell、bingding、cellpart。圖3.2E19時(shí)SMC組織差異表達(dá)mRNA的GO二級頻率圖橫坐標(biāo)為GO數(shù)據(jù)庫的分類內(nèi)容,縱坐標(biāo)左邊為基因數(shù)目所占百分比,右邊為基因數(shù)目。此圖展示的是在差異基因背景和全部基因背景下GO數(shù)據(jù)庫各二級功能的基因分布的情況,體ENSRNOG000000015973:-:60718847-60796006Atf27.650.015364798upENSRNOG000000152222:-:202794187-202816562Fam46c-9.600.038901188downENSRNOG000000078516:+:93422923-93444240Psma3-8.920.020100963downENSRNOG0000003721113:+:53350061-53422216Kif14-8.340.001073843downENSRNOG0000004644513:-:110807913-110864702Rcor3-8.327.40791E-06downENSRNOG000000079057:+:3354561-3384675Itga7-8.137.52753E-05downENSRNOG000000329222:+:144646148-144939391Dclk1-7.880.001275207downENSRNOG0000001834218:-:71463486-71883470Ctif-7.870.001421508downENSRNOG000000103793:+:79768797-79842082Celf1-7.780.002030827downENSRNOG00000060542X:+:112019772-112121979Mid2-7.750.000165337downENSRNOG0000000038320:+:26988774-27074138Mypn-7.660.000510495down
中國醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文16現(xiàn)兩個(gè)背景下各二級功能的地位。GO功能顯著性富集分析(圖3.3)是根據(jù)差異與背景相比,分析差異表達(dá)基因與哪些生物學(xué)功能顯著相關(guān)。該分析首先把所有差異表達(dá)基因向GO數(shù)據(jù)(http://www.geneontology.org/)的各個(gè)條目映射,計(jì)算每個(gè)條目的基因數(shù)目,利用超幾何分布進(jìn)行假設(shè)檢驗(yàn),得到富集結(jié)果的p-value,此時(shí)得到的p-value假陽性較高,利用BH多重假設(shè)檢驗(yàn)對p-value進(jìn)行校正可降低假陽性,校正后可得到Correctedp-Value,Correctedp-Value越低富集結(jié)果越顯著。由GO富集分析可得,前五位的條目如下:myofibril、contractilefiber、musclesystemprocess、sarcomere、musclecontraction。圖3.3E19時(shí)SMC組織差異表達(dá)mRNA的GOontology層次圖選取差異分析中得到的差異表達(dá)基因,進(jìn)行Pathway注釋和富集。基于Pathway的分析有助于進(jìn)一步了解基因的生物學(xué)功能。KEGG是有關(guān)Pathway的主要公共數(shù)據(jù)庫。根據(jù)差異基因所屬不同類別,對差異基因進(jìn)行分類并排序,取排名前20得到富集散點(diǎn)圖(圖3.4),前五位通路是Hypertrophiccardiomyopathy(HCM)、Cardiacmusclecontraction、Dilatedcardiomyopathy、Adrenergicsignalingincardiomyocytes、Neuroactiveligandreceptorinteraction。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]先天性肛門直腸畸形術(shù)后合并便秘患兒排便功能評定及病因探討[J]. 楊中華,王大斌,劉丹,賈慧敏,白玉作,王維林,袁正偉. 臨床小兒外科雜志. 2020(01)
[2]Long noncoding RNAs in neurodevelopment and Parkinson’s disease[J]. Ying Lyu,Lin Bai,Chuan Qin. Animal Models and Experimental Medicine. 2019(04)
[3]Wnt信號調(diào)控骨骼肌生長、發(fā)育與再生的機(jī)制[J]. 張宗明,金成龍,嚴(yán)會(huì)超,王修啟. 動(dòng)物營養(yǎng)學(xué)報(bào). 2019(02)
[4]肛門直腸畸形術(shù)后排便功能的中期評估[J]. 吉耿鋒,張志波. 中華小兒外科雜志. 2018 (12)
[5]長鏈非編碼RNA在肌肉分化發(fā)育及疾病中的研究進(jìn)展[J]. 賀健,王飛,張鵬,陳曉萍. 航天醫(yī)學(xué)與醫(yī)學(xué)工程. 2017(05)
[6]先天性肛門直腸畸形患兒母親照顧體驗(yàn)的質(zhì)性研究[J]. 劉曉然,胡麗君,劉麗,應(yīng)本娟. 解放軍護(hù)理雜志. 2016(23)
[7]先天性肛門直腸畸形的影像學(xué)檢查[J]. 王剛. 發(fā)育醫(yī)學(xué)電子雜志. 2016(01)
[8]肛管內(nèi)超聲及肛直腸測壓在肛門閉鎖術(shù)后肛門功能評估的意義[J]. 黃妍,金先慶,李曉慶,劉磊,袁亮,郭振華. 重慶醫(yī)學(xué). 2014(28)
[9]改良股薄肌移植聯(lián)合生物反饋對肌源性肛門失禁患兒肛門節(jié)制的療效[J]. 鮑俊濤,張書峰,王曉暉,王旭輝,孟慶磊. 廣東醫(yī)學(xué). 2014(03)
[10]兩種人工肛門括約肌節(jié)制排便效果的比較[J]. 肖鐘,黃宗海,史福軍,陳飛,郭雄波. 安徽醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(04)
博士論文
[1]肛門直腸畸形胎鼠腰骶髓發(fā)育異常機(jī)制及其宮內(nèi)骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞移植修復(fù)的實(shí)驗(yàn)研究[D]. 楊中華.中國醫(yī)科大學(xué) 2018
碩士論文
[1]基于無線經(jīng)皮供能的反饋式人工肛門括約肌系統(tǒng)及實(shí)驗(yàn)研究[D]. 劉志強(qiáng).上海交通大學(xué) 2014
本文編號:3539151
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:153 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
E19天對照組與ARMs組SMC組織中差異mRNA的表達(dá)分析
lularcomponent);分子功能(molecularfunction);生物學(xué)途徑(biologicalprocess)。根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康暮Y選差異基因后,對差異表達(dá)基因進(jìn)行GO分類分析,研究差異基因在GO中的分布狀況,闡明實(shí)驗(yàn)中樣本差異在基因功能上的體現(xiàn)[50]。對差異基因和本實(shí)驗(yàn)中所有基因即背景基因在GO的二級水平進(jìn)行分類,得到差異基因及背景基因在每個(gè)二級條目的分布情況。從GO分析結(jié)果(圖3.2)可知,生物學(xué)途徑(biologicalprocess)層次占主要地位,其中占前五位的生物學(xué)過程如下:cellularprocess、singleorganismprocess、cell、bingding、cellpart。圖3.2E19時(shí)SMC組織差異表達(dá)mRNA的GO二級頻率圖橫坐標(biāo)為GO數(shù)據(jù)庫的分類內(nèi)容,縱坐標(biāo)左邊為基因數(shù)目所占百分比,右邊為基因數(shù)目。此圖展示的是在差異基因背景和全部基因背景下GO數(shù)據(jù)庫各二級功能的基因分布的情況,體ENSRNOG000000015973:-:60718847-60796006Atf27.650.015364798upENSRNOG000000152222:-:202794187-202816562Fam46c-9.600.038901188downENSRNOG000000078516:+:93422923-93444240Psma3-8.920.020100963downENSRNOG0000003721113:+:53350061-53422216Kif14-8.340.001073843downENSRNOG0000004644513:-:110807913-110864702Rcor3-8.327.40791E-06downENSRNOG000000079057:+:3354561-3384675Itga7-8.137.52753E-05downENSRNOG000000329222:+:144646148-144939391Dclk1-7.880.001275207downENSRNOG0000001834218:-:71463486-71883470Ctif-7.870.001421508downENSRNOG000000103793:+:79768797-79842082Celf1-7.780.002030827downENSRNOG00000060542X:+:112019772-112121979Mid2-7.750.000165337downENSRNOG0000000038320:+:26988774-27074138Mypn-7.660.000510495down
中國醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文16現(xiàn)兩個(gè)背景下各二級功能的地位。GO功能顯著性富集分析(圖3.3)是根據(jù)差異與背景相比,分析差異表達(dá)基因與哪些生物學(xué)功能顯著相關(guān)。該分析首先把所有差異表達(dá)基因向GO數(shù)據(jù)(http://www.geneontology.org/)的各個(gè)條目映射,計(jì)算每個(gè)條目的基因數(shù)目,利用超幾何分布進(jìn)行假設(shè)檢驗(yàn),得到富集結(jié)果的p-value,此時(shí)得到的p-value假陽性較高,利用BH多重假設(shè)檢驗(yàn)對p-value進(jìn)行校正可降低假陽性,校正后可得到Correctedp-Value,Correctedp-Value越低富集結(jié)果越顯著。由GO富集分析可得,前五位的條目如下:myofibril、contractilefiber、musclesystemprocess、sarcomere、musclecontraction。圖3.3E19時(shí)SMC組織差異表達(dá)mRNA的GOontology層次圖選取差異分析中得到的差異表達(dá)基因,進(jìn)行Pathway注釋和富集。基于Pathway的分析有助于進(jìn)一步了解基因的生物學(xué)功能。KEGG是有關(guān)Pathway的主要公共數(shù)據(jù)庫。根據(jù)差異基因所屬不同類別,對差異基因進(jìn)行分類并排序,取排名前20得到富集散點(diǎn)圖(圖3.4),前五位通路是Hypertrophiccardiomyopathy(HCM)、Cardiacmusclecontraction、Dilatedcardiomyopathy、Adrenergicsignalingincardiomyocytes、Neuroactiveligandreceptorinteraction。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]先天性肛門直腸畸形術(shù)后合并便秘患兒排便功能評定及病因探討[J]. 楊中華,王大斌,劉丹,賈慧敏,白玉作,王維林,袁正偉. 臨床小兒外科雜志. 2020(01)
[2]Long noncoding RNAs in neurodevelopment and Parkinson’s disease[J]. Ying Lyu,Lin Bai,Chuan Qin. Animal Models and Experimental Medicine. 2019(04)
[3]Wnt信號調(diào)控骨骼肌生長、發(fā)育與再生的機(jī)制[J]. 張宗明,金成龍,嚴(yán)會(huì)超,王修啟. 動(dòng)物營養(yǎng)學(xué)報(bào). 2019(02)
[4]肛門直腸畸形術(shù)后排便功能的中期評估[J]. 吉耿鋒,張志波. 中華小兒外科雜志. 2018 (12)
[5]長鏈非編碼RNA在肌肉分化發(fā)育及疾病中的研究進(jìn)展[J]. 賀健,王飛,張鵬,陳曉萍. 航天醫(yī)學(xué)與醫(yī)學(xué)工程. 2017(05)
[6]先天性肛門直腸畸形患兒母親照顧體驗(yàn)的質(zhì)性研究[J]. 劉曉然,胡麗君,劉麗,應(yīng)本娟. 解放軍護(hù)理雜志. 2016(23)
[7]先天性肛門直腸畸形的影像學(xué)檢查[J]. 王剛. 發(fā)育醫(yī)學(xué)電子雜志. 2016(01)
[8]肛管內(nèi)超聲及肛直腸測壓在肛門閉鎖術(shù)后肛門功能評估的意義[J]. 黃妍,金先慶,李曉慶,劉磊,袁亮,郭振華. 重慶醫(yī)學(xué). 2014(28)
[9]改良股薄肌移植聯(lián)合生物反饋對肌源性肛門失禁患兒肛門節(jié)制的療效[J]. 鮑俊濤,張書峰,王曉暉,王旭輝,孟慶磊. 廣東醫(yī)學(xué). 2014(03)
[10]兩種人工肛門括約肌節(jié)制排便效果的比較[J]. 肖鐘,黃宗海,史福軍,陳飛,郭雄波. 安徽醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(04)
博士論文
[1]肛門直腸畸形胎鼠腰骶髓發(fā)育異常機(jī)制及其宮內(nèi)骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞移植修復(fù)的實(shí)驗(yàn)研究[D]. 楊中華.中國醫(yī)科大學(xué) 2018
碩士論文
[1]基于無線經(jīng)皮供能的反饋式人工肛門括約肌系統(tǒng)及實(shí)驗(yàn)研究[D]. 劉志強(qiáng).上海交通大學(xué) 2014
本文編號:3539151
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